Cistanche xloroplast genomining kodondan foydalanishning noto'g'ri tahlili

Annotatsiya:

Maqsad: Cistanche spp. ning to'rtta dorivor o'simliklarida xloroplast genomiga ta'sir etuvchi omillar va kodondan foydalanishni aniqlash. Usullari. ning kodon foydalanish taraflama parametrlariCistanche deserticola, Cistanchesalsa vaCistanchetubulosaCUSP, CodonW 1.4.2, SPSS va Microsoft Excel tomonidan tahlil qilingan.

Natijalar To'rtta Cistanche turining xloroplast genomlari kodondan foydalanish naqshlariga o'xshash bo'lib, uchinchi kodon asosi A/T bilan tugaydi va A/T asoslaridan qulayroq foydalanishga intiladi.

To'rt turning ENC (kodonning samarali soni) qiymatlari hammasi 35 dan yuqori bo'lgan, bu Cistanche spp.dagi xloroplast genlarining kodon afzalligini ko'rsatadi. zaifdir. Neytrallik syujeti, ENC-syujeti, PR{2}}bias syujeti va yozishmalar tahlili natijalari shuni ko'rsatdiki, tabiiy tanlanish Cistanche spp.da xloroplast genomi kodonidan foydalanish tarafkashligiga ta'sir qiluvchi asosiy omil bo'lgan. RSCU (nisbiy sinonimik kodon foydalanish) qiymatlari Cistanche spp.ning to'rtta turi tomonidan taqsimlangan to'rtta optimal kodonni aniqlash uchun ishlatilgan.

Xulosa Ushbu tadqiqotda biz to'rt turdagi xloroplast genomlarining kodon foydalanish moyilligini tahlil qildik.Cistanche tubulosa. va kodon moyilligiga ta'sir etuvchi omillarni aniqladi, bu tizimli evolyutsiyani, atrof-muhitga moslashuvini va zotlarini yaxshilashni o'rganish uchun tegishli nazariy asosni yaratdi.Cistanchemolekulyar darajada.

Cistanche Tubulosa ekstraktini olish uchun shu yerni bosing

Ko'proq so'rang:

Email:wallence.suen@wecistanche.com Whatsapp plus 86 15292862950

Cistanche Hoffmanns. & Link Orobanchaceae oilasiga mansub koʻp yillik parazit oʻt boʻlib, asosan Yevropa va Osiyoda tarqalgan boʻlib, toʻrtta turga ega.CistancheIchki Moʻgʻuliston, Ningsya, Gansu, Tsinxay va Shinjonda [1].

Ular orasida,Cistanche deserticola Maeng yuqori dorivor ahamiyatga ega va u asosan cho'l hududlarida o'sganligi sababli "cho'l jenshen" deb nomlanadi. Biroq, Cistanche jinsiga mansub dorivor o'simliklar o'simliklar tasnifida chalkashliklarga [2] va tijoratda mavjud bo'lgan turlardan foydalanishda chalkashlikka duch kelmoqdalar [3]. Xloroplastlar ko'pchilik yashil o'simliklarda fotosintez joyi bo'lib, rivojlanish va ikkilamchi metabolik jarayonlarda ishtirok etadi [4] va organellalar va yadro genomlari o'rtasida gen ekspressiyasini muvofiqlashtiradi [5]. Xloroplastlar avtonom ravishda meros qilib olingan genomga ega va o'simliklarning filogenetik tahlili, turlarni aniqlash va genetik xilma-xillikni ifodalash kabi tadqiqotlarda keng qo'llaniladi. So'nggi yillarda xloroplast genomini yuqori o'tkazuvchanlik sekvensiyasi texnologiyasining etukligi bilan Cistanche, Cistanche salina C. salsa (CA Mey.) G. Beck, Cistanche salsa C. sinensis G. Beck va Cistanche tubulosa Wight jinsining bir nechta o'simliklari. xloroplastlar ketma-ketligi va ularning filogeniyasi va genetikasi bo'yicha tadqiqotlar o'tkazilgan, ammo Cistanche spp.ning xloroplast genomining kodon afzalligi bo'yicha hech qanday tadqiqotlar o'tkazilmagan. xabar qilingan.

Kodon, shuningdek, genetik kod sifatida ham tanilgan, nuklein kislotalar va oqsillar o'rtasidagi ko'prikdir. nuklein kislotalar va oqsillar o'rtasidagi ko'prik bo'lib, biologik genetik ma'lumotlarning muhim tan olinishi va uzatilishi bo'lib, genetik kod deb ham ataladigan kodonlar biologik genetik ma'lumotni tanib olish va uzatish uchun muhim vektor bo'lib, biologik meros va o'zgaruvchanlikning hal qiluvchi qismidir [8] ].

Turlar orasida oqsillarni tarjima qilish jarayonidagi farqlar tufayli turli turlarning bir yoki tarjima jarayonidan foydalanish tendentsiyasi mavjud bo'lib, ular bir yoki bir nechta o'ziga xos sinonim kodonlardan foydalanishga moyildirlar. Bu hodisa kodon foydalanish tarafkashligi (CUB) [9] deb ataladi va kodon afzalligi mRNK tarjimasi, DNK transkripsiyasi, oqsil tuzilishi, ifodasi va ifodalanishiga sezilarli taʼsir koʻrsatadi. kodon afzalligi mRNK tarjimasi, DNK transkripsiyasi, oqsil tuzilishi, ifodasi, funktsiyasi va ko-translatsion qatlamlanishi va boshqa hujayrali metabolik jarayonlarda muhim rol o'ynaydi. Kodon afzalligi mRNK translatsiyasi, DNK transkripsiyasi, oqsil tuzilishi, ifodasi, funktsiyasi va ko-translatsion katlama kabi hujayrali metabolik jarayonlarda muhim rol o'ynaydi [10]. Shi Yanshuo va boshqalar [11] to'rtta Panax Linnning xloroplast genom afzalligini tahlil qilish orqali to'rtta Panax ginseng turining kodon afzalligini tahlil qildilar. to'rtta Panax Linnning xloroplast genomlarining kodon afzalligini tahlil qilish orqali. o'simliklar va bir jinsdagi o'simliklar bir-biri bilan chambarchas bog'liq degan xulosaga keldi. Song Yun va boshqalar [12] ICE1 geni kodon afzalligi asosida optimallashtirilishi mumkinligini ko'rsatdi, bu esa uni past haroratli stressga chidamliroq qiladi.

Song Yun va boshqalar [12] ICE1 geni kodon afzalligi asosida past haroratli stress ostida ifodalash uchun optimallashtirilishi mumkinligini ko'rsatdi; Li Xianhuang va boshqalar [13] Li Xianhuang va boshqalar [13] kodon afzalligi turlar orasidagi evolyutsion munosabatlarni aks ettirishi mumkinligini aniqladilar; Chjan Jun Yan Li va boshqalar [13] kodon afzalligi turlar orasidagi evolyutsion munosabatlarni aks ettiradi; Jun Yan Zhang va boshqalar [14] mutatsiya va tabiiy tanlanish birgalikda Swertia bimaculate (L.) ifodasiga ta'sir qilishini ko'rsatdi. Chjan Junyan va boshqalar [14] mutatsiya va tabiiy tanlanish Swertia bimaculate (Sieb. et Zucc.) Hookning evolyutsion munosabatlariga ta'sir qilish uchun birgalikda ekanligini ko'rsatdi. f. va Toms. ex CB Clark xloroplast genom kodon afzal swertia bimaculate (Sieb. et Zucc.) Hook. f. va Toms. Shvedlarni xonakilashtirish uchun asos yaratish uchun o'simlik xloroplast genomlarida xloroplast genomik kodon imtiyozlarini o'rganish o'tkazildi. Shuning uchun o'simlik xloroplast genomlarining kodon foydalanish usullarini o'rganish shvedlarni xonakilashtirish uchun asos bo'lishi mumkin. Shu sababli, xloroplast genomlarining kodondan foydalanish usullarini o'rganish gen ekspresyonu vektorini qurishning atrof-muhitga moslashishning molekulyar mexanizmlari va o'simlik navlarini yaxshilash samaradorligini oshirishga yordam beradi. Shu sababli, o'simlik xloroplast genomlarining kodon foydalanish usullarini o'rganish gen ekspresyonu vektorlarini qurish samaradorligini oshirish, turlarning evolyutsion munosabatlarini o'rganish, atrof-muhitga moslashishning molekulyar mexanizmlarini tushunish va o'simlik turlarini yaxshilash uchun ma'lumotlarni taqdim etishi mumkin [15].