Surunkali yurak etishmovchiligining oldini olish mexanizmini, shuningdek, potumotsion kasalxonada, shuningdek, geo ma'lumotlar bazasini ko'p chipiy tahlil bilan birlashtirilgan, potumbologiyaning ko'p chipi bilan birlashtirilgan.
Dec 12, 2024
Referat
MaqsadHarakatning molekulyar mexanizmini tahlil qilishCho'ldalyuallyonerocheqarshisurunkali yurak etishmovchiligi (ChF)bioinformatika vaTarmoq farmakologiya.
UsulBuTCMSS ma'lumotlar bazasi, Shveytsariya maqsadli bashorat qilish, va'zgo'ylik va adabiyotni qidirish cho'lmaki varaqli varianchining birikmalari va nishonlarini ekishni ekzyatsiya qilish uchun ishlatilgan. Genfus geni al-ibora GSE16455, GSE42796 geniali genialin gen chiplarini, gse84796 gen chiplari, geo va boshqa ma'lumotlar bazalari, geo va boshqa ma'lumotlar bazalari, geografiya, geo va boshqa ma'lumotlar bazalari. Satrlar ma'lumotlar bazasi va sitoskape 3.7.2 dasturiy ta'minotni Vodret-starget vizualizatsiya tarmog'ini qurish uchun foydalanilgan va asosiy maqsadlar topologik parametr tahlili tomonidan olingan. Borish yo'lining kuchayish yo'llari bo'yicha tahlillar translyuardche-starget-state-statway tarmog'ini qurish uchun DVAIS ma'lumotlar bazasidan foydalangan holda amalga oshirildi. Va nihoyat, AuSDock dasturi asosiy maqsadlar va birikmalar orasidagi molekulyar dokallash natijalarini tasavvur qilish uchun ishlatilgan. Results 55 compounds and 630 potential targets of Desertliving cistanche were screened, including key components such as Rhodiola rosea, gastrodynamics, batrachotoxin, and core targets such as glyceraldehyde-3-hosphate dehydrogenasem (GAPDH), interleukin 6 (IL-6), tumor Saraton kasalligida saraton kasalligining signallari (AK) va saraton kasalligi bo'yicha markaziy uglerodli kinazi (S3K-AKT signalini signal berish yo'li bilan bog'liq. PI3K-AKT signalini, saraton kasalligi, mitogeninali uglerod metabolizmini, mitogeninali uglerodli kinotwazi, mitogeninali ulagich kinotevasi (Mapk) asosiy tarkibiy qismlar va asosiy maqsadlar yaxshi birlashtirganligini ko'rsatdi. Xulosa ko'p pristavkani, ko'p qirrali va ko'p yo'lli trafikni o'rganish uchun CHORSTECHE ning modalxi mexanizmini tekshirish uchun o'tkazildi. Natijada faol tarkibiy moddalar shuni ko'rsatdikiCho'ldalyuallyonerocheChfni yaxshilash uchun bir nechta maqsadlar va yo'llar bilan harakat qilishingiz mumkin.
Kalit so'zlar: cho'ldalyual vojanche; surunkali yurak etishmovchiligi; Tarmoq farmakologiya; bioinformatika; Geo ma'lumotlar bazasi; molekulyar docking; yadro maqsad
O'simlik Kristanche surunkali yurak etishmovchiligini davolash uchun chiqarib oling
Surunkali yurak etishmovchiligi (ChF)asosan murakkab klinik sindromdirAngormal yurak tuzilishiva funktsiya, natijadaOg'ir qorincha to'ldirishyoki surish qobiliyati [1]. So'nggi epidemiologik ma'lumotlar shuni ko'rsatadiki, ChF sog'liqni saqlash muammosiga aylandi va populyatsiya qarish bilan ijobiy bog'liqdir [{1}}]. Hozirgi vaqtda mavjud ichki va tashqi davolash ChFFni davolay olmaydi, kasallik ko'pincha ko'pchilik asoratlar, yomon prognoz va yuqori o'lim bilan birga keladi. Hozirgi vaqtda ChFni davolash uchun standart davolash rejalari ishlab chiqilgan. Tegishli adabiyotlarning fikriga ko'ra [5], an'anaviy yurak urushi vositalari, asosan diniotetik moddalar, diniotiklar, ankerensin retseptori antagonistlar va mineralokreditlar retseptorlari angi-alanga aylanishi. Yangi terapevtik dorilar tarkibiga angiotinlar retseptorlari, skefalinaz inhibitorlari, natriy-glyukoza kotranssografiyalari, youcy-glyosozik adastikorlar, ya'ni ion kanalini blokirovka qilish. Garchi ushbu dorilar CHF bemorlarining klinik belgilarini yaxshilashi mumkin bo'lsa-da, ular ham ko'plab noqulay reaktsiyalar hamrohlashadi. Professor Zhou Jingminning tadqiqotlari klinik amaliyotda ishlatiladigan ChF in preparatlari suvsizlanish yoki elektrolitlarga nomutanosiblik, og'ir holatlarda aneioedema, gipotenciya, jigar va buyrak funktsiyasi shikastlanishi mumkinligini ta'kidladi [6]. Shuning uchun ChFFning oldini olish va davolash uchun xavfsiz va yanada samarali giyohvand moddalarni yoki davolash usullarini ishlab chiqish zarur.
RojdibocollaQuritilgan go'shtli - bu Rojdch amaldagi yadma yoki kekkaygancha (Shensk) WIDB, orobchakeae oilasi o'simliklari. Bu ikkala dori, ham oziq-ovqatning xususiyatlariga ega va 2-dan ortiq 000 yillarda klinik jihatdan ishlatilgan. "Shennang Benkao Jing" ga ko'ra, u Rojdey cho'lisola shirin, sho'r va issiq ta'mga ega va ichakning mohiyati va qonini yaxshilaydi va ichidagi ich qotishi [{2}}] [{2}}]. From the perspective of traditional Chinese medicine, the treatment of CHF mainly focuses on invigorating qi and warming yang, promoting blood circulation and removing blood stasis, and promoting diuresis and removing dampness [9-12]. Yang, qonni oziqlantirish va qon stasisini olib tashlash uchun yaxshi dori sifatida, "Oksklyar" Atroflik, kamerali autofil ta'sir ko'rsatadi, kamarga qarshi autofish yoki oshqozon-ichakning ta'sirini himoya qiladi. Klinik jarayonlar va farmakologik tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, SALIKROSSIYA, Leonurin, pufak kislotasi, kofir kislotasi, kofeik kislota va mog'or kislotali modellari, miyokard hujayralarining tarkibiy o'zgarishlarini sezilarli darajada yaxshilashdi [16-22] Biroq, CHFni davolashda "Radichch" ning harakatlanish mexanizmi bo'yicha tadqiqotlar hali ham nisbatan kam. Shunga asoslanib, ushbu hujjat giyohvand moddalar nishoni, kasalliklar va signal yo'llari kabi bir nechta istiqbollar kabi bir nechta istiqbollarni yaxshilash uchun "Farmakologiya va kasalliklar" ning ma'lumotlar bazasidan foydalanadi va keyinchalik CHF Symuraviy tadqiqotlar kabi o'zaro munosabatlarni o'rganadi [23].
1 materiallar va usullar
1.1 Vorchning faol tarkibiy qismlarini tekshirish va potentsial maqsadlar to'planishi
Kalit so'z sifatida "Canalistch Ho'litikola" dan foydalanish TCMSP ma'lumotlar bazasi orqali tegishli kimyoviy tarkibiy qismlar qidirildi va 3 0 dan katta yoki unga teng bo'lgan yoki 0,18 ga teng bo'lgan yoki unga teng bo'lganidek, 1 {{1} {{1} {{1} {{1} {{1} 0 dan yuqori yoki unga teng bo'lgan. Vornche shtatidagi faol tarkibiy qismlar chop etilgan tegishli adabiyotlarni qidirish orqali to'ldirildi. Pubchem platformasi (https://pubchem.nlmm.nlmm.nlmm.nlmm.gvov/) asosiy ekranli barcha asosiy ekrredientlarning raqamlarini olish uchun foydalanilgan, keyin ularning tabassumlari kimyoviy formulalari olindi. SDFning 2dr faylini yuklab oling va barcha ingredientlarni Swisseadme tahlil platformasiga (http://www.swissadme.ch/) olib boring. Lipinskiyning besh tamoyilining besh tamoyiliga asoslanib, ger so'rigi "yuqori") va jami 49 faol ingredientlar namoyish etildi. Shveytsariya maqsadli bashorat qilish (http://www.lilab-custper.c), pitmmapper (http://www.lilab-custper.d/), Super-Pabe/)
ction.charite.de/) and SEA Search Server https://sea.docking.org/search), set the species to "human" and add "Probability">{{0} {0} centcheche cho'lololati potentsial maqsadlarini to'plash va tashkillashtirish uchun skrining holati. Va nihoyat, har bir faol tarkibiy qismlarga mos keladigan maqsadlar UPROTS ma'lumotlar bazasi (https://www.uniprot.org/) orqali kirish edi. Barcha maqsadli nomlar gen qisqartmalarini olish uchun ajratilgan va standartlashtirilgan.
1.2 ChF G gen chipi va den skrining
"Surunkali yurak etishmovchiligi" dan asosiy qidiruv muddati sifatida "Geo Sapys.Nih.Gov" GESE84796 Gen chipdagi gen chip ma'lumotlarini olish uchun "Homo Sapiens" ni qidirib topdi va "organizm" gilamdagi yurak to'qimalarini tahlil qilish uchun "Homo Sapiens" ga o'rnatildi. CHF bemorlari va sog'lom boshqarish vositalari. R tilidagi limma paketida differentsial tahlil uchun ishlatiladi. Skrining mezonlari [log2 (fc)]> 0 shaklida o'rnatildi. 5 Tiring va Tiring ({{{{{{{{}}} Vulkan uchastkalari va geni issiqlik xaritalarida CHF kasalligi bilan bog'liq turli xil genlar ko'p chiplar tomonidan tekshiriladigan ekranni olish uchun qilingan.
1.3 Potentsial kasalliklarning maqsadlari va urug'larchechreamning tarkibiy qismlari - ChF umumiy maqsadlari
Tug'getlar ma'lumotlari asosida (https://www.dgenet.org/), giyohvand moddalar (https://www.drugbank.com/datasp: //210.107.182.61/greesearch/), genermp:
(https://www.genecards.org va geo (https://www.aclbi.com/), "surunkali yurak etishmovchiligi", "surunkali yurak etishmovchiligi", "surunkali yurak etishmovchiligi". Keyinchalik, bu genlar gen timsollarini olish uchun uni IIPROT ma'lumotlar bazasiga olib kirdi va ittifoqni qabul qilgandan so'ng, generatsiyani genet kasalligi uchun genetikani olish uchun olib tashlandi. Qo'llamoq
Venny 2.1 Onlayn xaritalash dasturi (https://bioioinfogp.cnb.csc.cs/tools/ools/ownynleny/).
1.4. Cancychre Shallotsiko'l o'rtasidagi o'zaro ta'sir tarmoqlarini (PPI) CHORACHI FOYDALANUVCHI ANTredients CHFning potentsial prognozi uchun faol tarkibiy qismlarini qurish
Satrlar ma'lumotlar bazasiga bo'lgan umumiy maqsadli nomlarni import qiling, "Bir nechta oqsil" rejimini tanlang, o'rtacha ishonchni (o'rtacha ishonchni) o'rnating.
1.5 Centalchola shtatining asosiy maqsadlarini tekshirish - Chf kasalligi kesishish maqsadlari
TSV formatidagi ma'lumotlar yuqoridagi potentsial o'zaro ta'sir tarmoqlari orqali olingan tarmoqlar va eksport qilingan TDV formati ma'lumotlari Simoskape 3.7.2 dasturiy ta'minotidan foydalanib tahlil qilindi va ingl. Maqsadli ulanish (daraja) qiymati har bir tugunning rangi va hajmini o'zgartirish uchun kichikdan katta hajmgacha o'rnatildi (birlashtirilgan ball), ulanish liniyasining qalinligi va yorug'lik koeffitsienti sifatida, ulanish koeffitsienti (birlashtirilgan ball) sifatni kamaytirish uchun ishlatiladi (birlashtirilgan ball). tugunga mos keladigan to undan kattagacha o'zgargan. Muzligi (miloddan tashqari), masalan, o'zaro munosabatlar bo'yicha (CC), yaqinlik markazi (CC) va darajaning o'zaro bog'liqligi SiTrusipape 3.7.2 dasturiy ta'minotining o'rnatilgan analizatori yordamida hisoblab chiqilgan va hisoblab chiqilgan topologik parametrlardan foydalanilgan. Shu bilan birga, miloddan avvalgi, CCdan kattaroq qiymati va darajasiga ega bo'lgan maqsad tanlandi. Median nishoni, Corech amaldagi ChFning reglamentsiyasini tartibga solishda asosiy maqsad sifatida ishlatilgan. Rotoskape 3.7.2 dasturiy ta'minotidan foydalanib tasvirlar chizilgan va ingl.
1.6 Biologik funktsiya va Kegg yo'llarini boyitish tahlilini tahlil qiling
Venografiya diagrammadan olingan umumiy maqsadlar Devid Onlayn tahlil platformasiga (https://david.ncifcfcf.gov/). "Ho Sapiens" "Kirish turlari" va "Tahlil turlari" variantlarida tanlandi. Sozlamalardan so'ng (p <{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{}}}}. P ning eng yaxshi 10 ta biologik jarayonlar (BP), uyali qismlar va molekulyar funktsiyalar (MF) va eng yaxshi 20 ta muhim yo'llar. Keyin, Kegg funktsional boyitish xaritalari mikrobial ma'lumotni xaritalash platformasi (https://www.bioioinformaticics.com.cn/) vizualizatsiya tahlil qilish uchun.
1.7 Faol ingredientlar - signalizatsiya qilingan yo'llarni - Saytni signalizatsiya yo'llari
Kegg yo'llarini tahlil qilish natijalariga ko'ra, tadqiqot guruhi ushbu yo'llarda boyitilgan maqsadlar bilan boyitilgan va ularni vizualizatsiya qilish uchun ajratib olish va faol tarkibiy qismlar - signalizatsiya qilingan yo'llar sxemasiga mos keladi.
1.8 Molekulyar dozing tekshiruvi
Preparatning faol moddalarining aralash tarkibi Pubchem ma'lumotlar bazasi orqali olindi va SDF faylida OpenBabel -3 -3 yordamida SDF faylini PDB formatiga aylantirdi. 1.1 dasturiy ta'minot. Keyin, asosiy maqsadli reterin oqsilining tarkibi PDB ma'lumotlar bazasi (http://www.rcsb.org) orqali olingan, degel dasturida suvsizlanish va suvsizlanish va baylab borilgan. Keyin, AutoDock vositalarining dasturiy ta'minoti gidrogensiya va zaryadlash uchun ishlatilgan, va retseptor oqsillari va liganing kichik molekulalar PDBQT formatiga aylantirildi. Nihoyat, AveroDock Vine 1.1.2 Bo'sh energiya sarflash va erkin energiya prognozi uchun ishlatilgan.
2 natija
2.1 - Vorchning jallodsikolalarining asosiy faol tarkibiy qismlari
TCMSS ma'lumotlar bazasi 75 ta kimyoviy tarkibiy qismlarni olish uchun "Canalistch Ho'litikola" kalit so'zi bilan qidirildi. Obni 3 {{2}% {{2}% dan yuqori yoki unga teng ravishda ekranda yoki unga teng bo'lgan, Scresabololaning 6 ta asosiy faol tarkibiy qismi kuzatildi. Bundan tashqari, adabiyotni qidirish orqali Salidrosid, fenetrotid, Leonurin, Deonin, Keurin, Daurin, Daurin, Daurin, Devorin, Deonin, zanjirbin, deviikin kabi 49 faol ingredient qo'shildi. Tafsilotlar uchun 1-jadvalga qarang.
1-jadvalda qadiiy cho'lolikning asosiy faol tarkibiy qismlari
| Yo'q | Moddalar toifasi | Ism | CAS raqam |
|---|---|---|---|
| R1 | Qizil pigment | alizarin | 103-58-8 |
| R2 | Fenolik birikma | pionetin | 104-57-4 |
| R3 | kofeik kislota | 331-39-5 | |
| R4 | Lazzat birikmasi | kenuin | 92432-60-5 |
| R5 | enga qoldirmoq | 101-62-6 | |
| R6 | parvarish kislotasi | 1135-24-6 | |
| R7 | salitsil kislotasi | 69-72-7 | |
| R8 | koumarin | 91-64-5 | |
| R9 | Kava Lakton H1 | 68434-40-4 | |
| R10 | Kava Lakton H2 | 17193-39-6 | |
| R11 | Kava Lakton H3 | 17193-40-9 | |
| R12 | Kava Lakton H4 | 17193-41-0 | |
| R13 | 3, 4- dihidrokphenylaniline | 1194-00-1 | |
| R14 | 4- gidroksityzil spirti | 623-05-2 |
