Qandli diabet bilan bog'liq surunkali buyrak kasalligining erta va kech bosqichida ichak mikrobiomasining tarkibi barqaror bo'lib qoladi.

Abstrakt: (1) Ma'lumot: Qandli diabet bilan og'rigan shaxslar vasurunkali buyrak kasalligisog'lom nazorat bilan solishtirganda ichak disbiyozini ko'rsatish. Ammo diabetning barcha bosqichlarida disbiyozning o'zgarishi noma'lumsurunkali buyrak kasalligi. Biz ushbu ikki guruh va diabetik surunkali buyrak kasalligining har bir bosqichida yuzaga kelishi mumkin bo'lgan mikrobial farqlarni aniqlash uchun erta va kech diabet bilan bog'liq surunkali buyrak kasalligi bo'lgan bemorlarning kesma tadqiqotini o'rgandik. (2) Usullar: Ushbu kesmaviy tadqiqot 95 nafar kattalarni jalb qildi. Yig'ilgan najas namunalaridan olingan DNK ichakdagi bakterial jamoani aniqlash uchun 16S rRNK ketma-ketligi uchun ishlatilgan. (3) Natijalar: Firmicutes filumi eng ko'p bo'lgan va uning o'rtacha nisbiy ko'pligi erta va kech surunkali buyrak kasalliklari guruhida o'xshash edi, 45,99 ± 0,58 foiz va 49,39 ± 0,55 foiz. , mos ravishda. Bacteroidaceae oilasining o'rtacha nisbiy ko'pligi erta va kech guruhlarda ham o'xshash bo'lgan, mos ravishda 29,15 ± 2.02 foiz va 29,16 ± 1,70 foiz. Prevotellaceae ning past ko'pligi erta 3,87 ± 1,66 foiz va kechki 3,36 ± 0,98 foiz diabetik surunkali buyrak kasalligi guruhlarida bir xil bo'lib qoldi. (4) Xulosa: Qandli diabet bilan bog'liq surunkali buyrak kasalligi bo'lgan shaxslar guruhidan olingan ma'lumotlar phyla Firmicutes va Bacteroidoidlarning ustunligini ko'rsatadi. Ruminococcaceae va Bacteroidaceae oilalari eng yuqori ko'plikni ifodalaydi, foydali Prevotellaceae oilasi esa mo'l-ko'llikda kamayadi. Eng qiziqarli kuzatuv shundaki, bu ichak mikroblarining nisbiy ko'pligi diabetik surunkali buyrak kasalligining erta va kech bosqichlarida o'zgarmaydi, bu diabet bilan bog'liq surunkali buyrak kasalligi rivojlanishining dastlabki hodisasi ekanligini ko'rsatadi. Biz faraz qilamizki, diabetik surunkali buyrak kasalligining dastlabki bosqichlarida olingan disbiotik mikrobioma nisbatan barqaror bo'lib qolmoqda va buyrakning progressiv disfunktsiyasiga ta'sir qiluvchi ko'plab xavf omillaridan biri hisoblanadi.

Kalit so'zlar: surunkali buyrak kasalligi; qandli diabet; disbiyoz; ichak mikrobiomasi; mikrobiota

1.Kirish

Inson ichaklari ichak mikrobiotasini tashkil etuvchi 100 trilliondan ortiq mikrob hujayralaridan iborat murakkab jamoani o'z ichiga oladi. Ular oziqlanish, fiziologiya va immunitetga ta'sir qiluvchi mezbon metabolizmi bilan doimiy o'zaro ta'sirda bo'lgan dinamik va simbiotik ekotizimni hosil qiladi. Mikroblarning xilma-xilligi ko'payadi va hayotning birinchi 3-5 yilining oxirida kattalar mikrobiotasiga yaqinlashadi. Shunday qilib, o'rnatilgandan so'ng, ichak mikrobiotasining tarkibi, funktsiyasi va tuzilishi sog'lom odamlarda hayot davomida nisbatan barqaror bo'ladi. Bu oshqozon-ichak traktining (GI) biokimyoviy muhitiga moslashishga va bakterial metabolizmning asosiy regulyatorlarini ifodalovchi ozuqa moddalarining mavjudligidagi o'zgarishlarga qaramasdan. Bakteriya fila Firmicutes va Bacteroides sog'lom ichak mikrobiomasining ko'p qismini tashkil qiladi. Ushbu bakterial xilma-xillikning tarkibi semizlik kabi yuqumli bo'lmagan kasalliklarda, shuningdek, 2-toifa diabet bilan kasallanganlar uchun o'zgaradi.

Qandli diabet va u bilan bog'liq mikro va makrovaskulyar asoratlar pandemiya darajasiga yetdi, global tarqalish soni 463 millionni tashkil etdi. Qandli diabetga chalinganlarning 40 foizdan ortig'i diabet bilan bog'liqsurunkali buyrak kasalligi (CKD), qoladi

ning asosiy sababiyakuniy bosqich buyrak kasalligi (ESKD)butun dunyo bo'ylab, uzoq muddatli dializni talab qiladi. Yurak-qon tomir kasalliklari, qisman doimiy past darajadagi yallig'lanish tufayli KKD bilan og'rigan odamlarda o'limning asosiy sababidir. Qandli diabet kasalligi bugungi kunda global sog'liqni saqlash muammosi sifatida ko'rib chiqilishi ajablanarli emas.

Bir qator tadqiqotlar, nazorat sub'ektlari bilan solishtirganda diabet bilan og'rigan odamlarda ichak mikrobiotasi tarkibidagi o'zgarishlar haqida xabar berdi va misollar orasida sog'lom nazorat ostidagilarga nisbatan Firmicutes va 2-toifa diabetga chalinganlarda Clostridia sinfining kamayishi kiradi. Shuningdek, qandli diabet bilan og'rigan odamlarda bakterial xilma-xillikning kamayishi ko'rsatildi, bu Faecalibacterium prausnitzii va Roseburia intestinalis kabi butirat ishlab chiqaruvchi bakteriyalarning kamayishi va opportunistik patogenlarning ko'payishi bilan tavsiflanadi.

Hayvonlarning eksperimental modellarida tadqiqotlarsurunkali buyrak kasalligi (CKD)va turli bosqichlari bo'lgan bemorlarCKDnormal ichak mikrobiomasining o'zgarishini ko'rsatish. Qandli diabet kabi surunkali kasalliklar, ko'plab patofizyologik mexanizmlar orqali ichak mikrobiotasining "ichak disbiyozi" holatini keltirib chiqaradi, bu tizimli yallig'lanish reaktsiyasiga olib kelishi mumkin. Ichak disbiyozining o'ziga xos o'zgarishlari qisqa zanjirli yog 'kislotalari (SCFA) ishlab chiqaradigan foydali saxarolitik mikroblarning kamayishi va CKD holatida Clostridium spp kabi proteolitik bakteriyalarning ko'payishi hisoblanadi. va Bacteroides spp. Ma'lumki, odamlar bilanbuyrak kasalligibuzilganligi sababli qon zardobidagi karbamid yoki qon karbamid azotining (BUN) yuqori darajasiga ega.buyrakbu uremik toksinlarni tozalash va ichakdagi karbamid miqdorini oshirish. Ushbu o'sish bakteriyalar vositasida karbamid gidrolizidan yuqori ammiak ishlab chiqarishga olib kelishi taklif qilindi, bu esa o'z navbatida luminal pH ni oshiradi va CKDda Clostridium turlari kabi proteolitik turlarning haddan tashqari ko'payishini kuchaytiradi. Ushbu "uremik muhit" faqat qandli diabet (KKD bo'lmagan) bo'lgan odamlarda mavjud emas va shuning uchun bu odamlarda Clostridium turlarining ko'payishi kuzatilmaydi. Sog'lom inson ichak mikrobiotasining butun populyatsiyasining 90 foizdan ortig'i ikkita asosiy fila, ya'ni Firmicutes va Bacteroides bilan ifodalanganligini hisobga olsak, qandli diabet bilan og'rigan odamlarni ularning sog'lom nazorati bilan solishtirganda, mikrobiomaning tarkibiy o'zgarishi mavjud bo'lib, u kamaygan firmikutlardan iborat. Qandli diabetga chalinganlarda sog'lom odamlarga nisbatan.

Ichak disbiyozining yana bir o'ziga xos xususiyati butirat kabi qisqa zanjirli yog 'kislotalarini ishlab chiqaradigan Prevetoellaceae kabi foydali saxarolitik mikrobial oilalarning kamayishi hisoblanadi. Ushbu qisqa zanjirli yog 'kislotalari ichak to'sig'ining yaxlitligini saqlashga yordam beradi va sog'lom sub'ektlarga nisbatan CKD bilan kasallangan shaxslarda kamayadi. Qandli diabet bilan kasallangan odamlar ko'pincha metabolik sindrom bilan bog'liq. Ichak mikrobiotasining xilma-xilligini metabolik sindrom aspektlari bilan baholagan inson tadqiqotida mualliflar mikrobiota xilma-xilligi semirish, insulin qarshiligi, jigar steatozi va past darajadagi yallig'lanish bilan bog'liqligini ko'rsatdi. Ular bunday sub'ektlarning yallig'lanishga qarshi mikrobial profilga ega ekanligini ko'rsatdi, bu butirat ishlab chiqaruvchi bakteriyalarning kamayishi bilan tavsiflanadi.

Kasallikning og'irligiga qaramay, diabetik KKD rivojlanishining patofizyologik mexanizmlari yaxshi tushunilmagan. Qandli diabet kasalligi gipertenziya, albuminuriya va progressiv pasayish bilan tavsiflanadibuyrak funktsiyasi,taxminiy glomerulyar filtratsiya tezligining (eGFR) o'zgarishi sifatida o'lchanadi. Ichak mikrobiomasining diabetik KBB rivojlanishidagi roli ilmiy qiziqish sohasi sifatida paydo bo'ldi. Qandli diabet bilan og'rigan shaxslar vasurunkali buyrak kasalliginazorat bilan solishtirganda ichak disbiyozini ko'rsatish. Shu bilan birga, diabetik CKD bosqichlarida bu dysbiozda o'zgarish bor-yo'qligi noma'lum; shuning uchun ushbu tadqiqot ushbu ikki guruh o'rtasidagi va diabetik KKDning har bir bosqichida mumkin bo'lgan mikrobial farqlarni aniqlash uchun erta va kech diabet bilan bog'liq bo'lgan bemorlarning ichak mikrobiomalari profillarini kesma tahlil qilishni maqsad qilgan.

Cistanche Tubulosa qo'shimchasiga bosing

QO'ShIMChA MA'LUMOT UCHUN:david.deng@wecistanche.com

2. Materiallar va usullar

2.1. Ishtirokchilar

Ushbu istiqbolli, ko'ndalang tadqiqot 95 nafar kattalarni, 6 oydan ortiq, ambulatoriya endokrinologiya klinikasiga tashrif buyurish vaqtida jalb qildi. Bemorlar ambulator tashrifda muntazam qon tekshiruvlaridan tashqari DNK izolatsiyasi uchun najas namunasini berishga rozi bo'lishdi. Ushbu bemorlarda diabetning turli bosqichlari (1-5 bosqichlari) bo'lgansurunkali buyrak kasalligi. Bemorlar ikkita alohida guruhga bo'lingan: "erta KKD" va "kechki KKD". Erta diabetik KKD guruhi 1, 2 yoki 3a bosqichlari bo'lgan diabet bilan kasallangan ishtirokchilar, kech diabetik KKD guruhi esa ishtirokchilar sifatida belgilangan. 3b, 4 yoki 5 bosqichlari bo'lgan qandli diabet bilan. Qandli diabet bilan bog'liqsurunkali buyrak kasalligiBu=kuzatilishi mumkin bo'lgan buyrakning gistologik lezyonlari oralig'ini o'z ichiga olgan afzal atama emas. CKD buyrak funktsiyasining asta-sekin pasayishi bilan tavsiflanadi, bu glomerulyar filtratsiya tezligining (eGFR) o'zgarishi sifatida, albuminuriya bilan yoki unsiz. Mavjud bo'lsa, albuminuriya ularning venoz qon namunasini taqdim etish bilan bir vaqtda spot siydik namunasida siydik albumin-kreatinin nisbatini (ACR) o'lchash orqali baholandi. Mikroalbuminuriya ACR 30-300 mg/g, makroalbuminuriya esa 300 mg/g dan yuqori bo'lgan ACR sifatida belgilangan. CKDning olti bosqichi tan olingan: 1-bosqich (eGFR 90 ml/min/1,73 m2 dan katta yoki teng), 2 (eGFR 60–89 ml/min/1,73 m2), 3a (eGFR 45–59 ml/min/1,73 m2) ), 3b (eGFR 30–44 mL/min/1,73 m2), 4 (eGFR 20–29 mL/min/1,73 m2) va 5 (eGFR < 20 mL/min/1,73 m2). Har qanday sabab, yurak-qon tomir hodisalari yoki kasalxonaga yotqizish natijasida o'lim xavfi 3b bosqichidan boshlab eksponent ravishda oshadi.

Ma'lumotlar to'plash faqat bir martalik nuqtada sodir bo'ldi va qon bosimi, tibbiy komorbidliklar, diabetning davomiyligi, CKD bosqichi va unga bog'liq bo'lgan asoratlar, dori-darmonlar va patologiya natijalari haqida ma'lumotni o'z ichiga oladi. Antropometrik ma'lumotlar va najas namunalari klinikaga tashrif buyurilgan kuni to'plangan, bemorning qolgan ma'lumotlari esa Austin Healthning elektron tibbiy yozuviga kirish orqali to'plangan. Ushbu tanlangan ma'lumotlarning barchasi keyinchalik tahlil qilish uchun ushbu tadqiqot uchun maxsus ma'lumotlar bazasiga kiritildi. Qandli diabetning dastlabki guruhida 70 nafar, kechki guruhda esa 25 nafar ishtirokchi bor edi. Ishtirokchilar yozma ma'lumotli rozilik berishdi va tadqiqot Ostin sog'lig'i, Viktoriya, Avstraliyaning Inson tadqiqotlari etikasi qo'mitasi tomonidan ma'qullandi (HREC/17/Austin/166, loyiha raqami ND 17/166, HREC 13/07/2017 yilda ma'qullangan) va Deakin universitetining Inson tadqiqotlari etikasi qo'mitasi, Avstraliya. Amalga oshirilgan protseduralar 2013 yilda qayta ko'rib chiqilgan 1975 yildagi Xelsinki deklaratsiyasiga muvofiq edi.

2.2. Taburet kolleksiyasi

Donor tomonidan 50 ml namunali idishda yig‘ilgandan so‘ng, kelajakda DNK ekstraktsiyasi uchun namunalar -80 ◦C da muzlatishdan oldin, taxminan 0,5-1 g dan kichikroq 1,5 ml Eppendorf naychalariga ajratildi.

2.3. DNK ekstraktsiyasi

DNK ishlab chiqaruvchining protokoliga muvofiq Qiagen QIAamp® DNK najas mini to'plami (Ref 51504, Hilden, Germaniya) yordamida ekstraksiya qilingan. DNK miqdorini aniqlash va tozalash Qubit florometr (Invitrogen) yordamida baholandi. Najas alikvotlaridan DNK ekstraktsiyasi bemorni ishga qabul qilgandan so'ng amalga oshirildi.

2.4. DNK mikrobioma profilini yaratish va sifat nazorati

PCR kuchaytirilishi va ketma-ketligi Avstraliya genom tadqiqot markazi (AGRF, Melburn, Avstraliya) tomonidan amalga oshirildi. PCR amplikonlari 1-jadvalda ko'rsatilgan primerlar va shartlar yordamida yaratilgan. Termotsikl birlamchi PCR uchun Applied Biosystem 384 Veriti va AmpliTaq Gold 360 master mix (Life Technologies, Mulgrave, VIC, Avstraliya) yordamida yakunlandi. PCRning birinchi bosqichi magnit boncuklar yordamida tozalandi va namunalar 2 foizli SYBR Agarose E-Gel (Thermo-Fisher, Mulgrave, VIC, Avstraliya) da ko'rsatildi. Amplikonlarni indekslash uchun ikkilamchi PCR TaKaRa Taq DNK Polimeraz (Takara Bio USA, Inc., Mountain View, CA, AQSH) bilan amalga oshirildi. Olingan amplikonlar magnit boncuklar yordamida yana tozalandi va normalizatsiya qilishdan oldin QuantiFluor florometri (Promega, Madison, WI, AQSh) bilan miqdori aniqlandi. Hovuzni konsentratsiyalash uchun magnit boncuklar yordamida oxirgi marta tozalashdan oldin namunalar ekvimolyar konsentratsiyalarda birlashtirildi va keyin Agilent 2200 TapeStation tizimida yuqori sezuvchanlik D1000 lentasi yordamida o'lchandi. Hovuz 5 nM ga suyultirildi va yuqori sezuvchanlik D1000 lentasi yordamida molyarlik yana tasdiqlandi. Shundan so'ng Illumina MiSeq (San-Diego, CA, AQSh) da V 3, 600 sikl to'plami (2 × 300 tayanch juftlik juftligi) bilan ketma-ketlik amalga oshirildi.

Juftlangan o'qishlar PEAR (versiya 0.9.5) yordamida oldinga va teskari o'qishlarni tekislash orqali yig'ildi. Primerlar aniqlandi va kesildi. Kesilgan ketma-ketliklar Quantitative Insights Into Microbial Ecology (QIIME 1.8).USEARCH (versiya 7.1.1090) va UPARSE dasturlari yordamida ishlangan. USEARCH yordamida ketma-ketliklar sifatli filtrdan o'tkazildi, so'ngra to'liq uzunlikdagi takroriy ketma-ketliklar olib tashlandi va ko'pligi bo'yicha saralandi. Ma'lumotlar to'plamidagi singletonlar yoki noyob o'qishlar olib tashlandi. Ketma-ketliklar klasterlangan, soʻngra “rdp{10}}gold” maʼlumotlar bazasidan foydalanib, ximera filtrlash oʻtkazilgan. Har bir operatsion taksonomik birlikda (OTU) o'qishlar sonini olish uchun o'qishlar minimal identifikatsiyasi 97 foizga teng bo'lgan OTUlarga qaytarildi. QIIME yordamida taksonomiya Greengenes ma'lumotlar bazasidan foydalangan holda tayinlangan (versiya 13_8, 2013 yil avgust)

2.5. Ma'lumotlarni tozalash, normallashtirish va statistik tahlil

Bemorning xarakteristikalari uchun toifali o'zgaruvchilar Fisher's Exact yordamida sinovdan o'tkazildi va doimiy o'zgaruvchilar Wilcoxon tomonidan imzolangan daraja testi bilan sinovdan o'tkazildi.

Archaea (N=4), Chloroplast(N=42) va R statistik dasturining 1.26.1 versiyasida "phyloseq" paketida amalga oshirilgan tayinlanmagan 22 ta OTUga tasniflangan vakillarni olib tashlash uchun ma'lumotlar kesildi. Biz, shuningdek, ikkitadan kam tarqalgan OTUlarni olib tashladik, bu esa har bir namuna uchun qayd etilgan hisoblarni yanada teng taqsimlash imkonini berdi. Qolgan 1818 taksonlar qirollik bakteriyalariga, 69,03 foizi filum darajasiga tegishli. Biz bakteriyalarning nisbiy ko'pligini (ko'pligi > 2 foiz) filum va jins darajasiga qarab tasniflangan turli xil namunalarda ko'rdik.

Biz kuzatilgan OTU sonini hisoblab chiqdik va Shannon indeksidan foydalangan holda CKD bosqichi bo'yicha guruhlangan shaxslarning alfa xilma-xilligini (namuna ichida) solishtirdik, bu mavjud taksonlarning ko'pligi va tengligini hisobga oladi. Alfa xilma-xillik indekslarining quti grafiklari R bazasida boxplot buyrug'i yordamida yaratilgan. Bizning ma'lumotlarimiz potentsial chegaralarga ega va normal taqsimlanmaganligi sababli, Kruskal buyrug'i yordamida namunaviy guruh o'rtasidagi farqlar parametrik bo'lmagan Kruskal-Vallis testi bilan tekshirildi. sinov.

Beta xilma-xilligi uchun (namunalar orasidagi) biz har bir namunadagi chuqurlikni o'qish uchun masshtablangan ma'lumotlarning log konvertatsiyasidan foydalandik, so'ngra nisbiy mo'l-ko'llik va filogenetik o'xshashlik o'lchovini ta'minlaydigan og'irlikdagi UniFracni hisoblab chiqdik va chizdik. Ikki namuna orasidagi kichikroq UniFrac masofasi ikkita mikrobial jamoalar o'rtasidagi o'xshashlikning yuqori ekanligini ko'rsatadi. UniFrac masofalari "phyloseq" to'plamidagi buyruqlar yordamida Principle Coordinate Analysis (PCoA) chizmalari yordamida tasvirlangan. Asosiy koordinatalar tahlili (PCoA) masofa matritsasiga qarab namunalar o'rtasidagi munosabatlarni ko'rsatadigan va mikrobioma kabi murakkab ma'lumotlar to'plamining nazoratsiz guruhlash naqshini tasvirlaydigan o'lchamlarni kamaytirish usulidir. Biz har bir namuna guruhining mikrobial jamoalari sezilarli darajada farq qilishini tekshirish uchun permutatsion ko'p o'zgaruvchan dispersiya tahlilini (PERMANOVA) o'tkazish uchun "vegan" paketidagi adonis buyrug'idan foydalandik. Barcha statistik testlar natijalari p-qiymatlari bo'lganda muhim deb hisoblanadi<0.05.

3. Natijalar

Klinik va biokimyoviy xususiyatlari

Namuna sifatini nazorat qilgandan so'ng, 95 bemor namunalari uchun ma'lumotlar mavjud edi. 95 ta tadqiqot populyatsiyasining klinik va biokimyoviy xususiyatlari 2-jadvalda ko'rsatilgan. O'rtacha eGFR erta davrda 67,51 ml/min/1,73 m2 ni tashkil qilgan.diabetik surunkali buyrak kasalligiguruh (1, 2 va 3a bosqichlari CKD dan iborat) va kech 24,48 ml / min / 1,73 m2diabetik surunkali buyrak kasalligishaxslar (3b, 4 va 5 bosqichlardan iborat). Bu p-qiymati < 0.001 (Wilcoxon Signed Rank Test) bilan statistik ahamiyatga ega bo'ldi. CKDning dastlabki guruhidagi o'rtacha yosh 66,24 yoshda, kechki KKD guruhidagi 72,68 yoshga nisbatan ancha yoshroq edi (p-qiymati=0,01). Qandli diabet kasalligining har bir bosqichida ishga qabul qilingan 95 nafar bemorning ulushi 1-rasmda ko'rsatilgan.

Beta xilma-xillik indekslari mikrobial jamoa namunalari orasidagi ekologik xilma-xillikni tavsiflash uchun ishlatiladi. Ichak mikrobiomasining beta xilma-xilligi diabetik KKD bilan kasallangan odamlarning erta va kech guruhlari o'rtasida yoki diabetik KKDning har bir bosqichida boshqasi bilan solishtirganda sezilarli darajada farq qilmadi (PERMANOVA, p-qiymati=0.70, 2A-rasm, B).

Shakl 1. Diabetik surunkali buyrak kasalligining har bir bosqichidagi bemorlarning nisbati (CKD)

Alfa xilma-xillik indekslari odatda mikrobial jamoa namunalaridagi ekologik xilma-xillikni tavsiflash uchun ishlatiladi. Shannon indeksi turlarning boyligi va tekisligini hisobga oladi. Ichak mikrobiomasining alfa xilma-xilligi diabetik KKD bilan kasallangan odamlarning erta va kech guruhlari (Shannon indeksi, KruskalWallis testi, p-qiymati 0.05 dan kichik yoki unga teng) yoki kasallikning har bir bosqichi o'rtasida sezilarli darajada farq qilmadi. diabetik CKD boshqa bilan solishtirganda (3A, B-rasm).

Shakl 2. (A) Asosiy koordinatalar tahlili (PCoA) (B) Ordinatsiya chizmalari ichak bakteriyasi jamoasining KKD bilan kasallangan shaxslardan farqliligini ko'rsatadi.

Shakl 3.(A). Quti va moʻylovli uchastkalarda bir nechta kuzatilgan bakterial operatsion taksonomik birliklar (OTU) va najas namunalarining Shennonning xilma-xillik indeksi KKHning erta (1 dan 3a gacha) va kechki (3b dan 5) bosqichlari boʻlgan shaxslar tomonidan guruhlangan.(B). ). Quti va mo'ylovli uchastkalarda kuzatilgan bakterial operatsion taksonomik birliklar (OTU) soni va KBH 1,2,3a,3b,4 va 5 bosqichlarida shaxslar tomonidan guruhlangan najas namunalarining Shannon xilma-xillik indeksi ko'rsatilgan.

The majority (>85% o'rtacha nisbiy ko'pligi) bakterial operatsion taksonomik birliklari (OTUs) phyla Bacteroidetes va Firmicutes bilan ifodalangan bo'lib, turli bosqichlarida CKD kasalligi bo'lgan shaxslarning ichak mikrobiomasida filumning taksonomik darajasiga aniqlangan. Firmicutes filumi eng ko'p bo'lgan va uning o'rtacha nisbiy ko'pligi erta (1, 2 va 3a bosqich) va kech (3b, 4 va 5 bosqich) CKD guruhida o'xshash bo'lib, 45,99 ± 0 ni tashkil etdi. 58% KBYning boshida va 49,39 ± 0, 55% kech KKDda. Xuddi shunday, Bacteroidetes filumining o'rtacha nisbiy ko'pligi diabetik KKDning erta bosqichida o'xshash bo'lib, 42.86 ± 1,4{34}} foiz va kech diabetik KKD guruhida 41,20 ± 1,12 foizni tashkil etdi (rasm). 4A). Oila darajasida Bacteroidaceae va Ruminococcaceae erta va kechki KKD guruhlari bo'yicha OTUlarning eng yuqori ko'pligini ifodalagan, Prevotellaceae esa diabetik KKDning barcha bosqichlarida eng past ko'plikka ega. Xususan, Bacteroidaceae oilasining o‘rtacha nisbiy ko‘pligi erta va kech qandli diabet kasalligida o‘xshash bo‘lib, 29,15 ± 2.0 KBHning dastlabki guruhida 2 foizni va kechki KKD guruhida 29,16 ± 1,70 foizni tashkil etdi. Ruminococcaceae ning o'rtacha nisbiy ko'pligi erta va kechki KKDda ham o'xshash bo'lib, erta KKDda 20,49 ± 0,61 foizni va kech KKDda 20,22 ± 0,44 foizni tashkil etdi. Prevotellaceae ning past ko'pligi ham erta va kech KKDda o'xshash bo'lib qoldi, bu erta KKDda atigi 3,87 ± 1,66 foizni va kech diabetik BKDda 3,36 ± 0,98 foizni tashkil etdi (4B-rasm).

4-rasm. (A). Yig'ilgan shtrixli diagrammalarda KBH kasalligining turli bosqichlari bo'lgan shaxslarning ichak mikrobiomasida filumning taksonomik darajasiga aniqlangan bakterial operatsion taksonomik birliklarning (OTU) o'rtacha nisbiy ko'pligi ko'rsatilgan. Keng tarqalgan OTUlarni olib tashlash uchun kesilgan ma'lumotlardan ko'plik hisoblangan<2 samples with <2 counts in the complete dataset. (B). Stacked bar charts display the average relative abundance of bacterial operational taxonomic units (OTUs) identified to the taxonomic level of family in the gut microbiome of individuals with different stages of CKD disease. Abundances were calculated from trimmed data to remove OTUs that were prevalent in <2 samples with <2 counts in the complete dataset.

2-toifa diabet bilan salbiy bog'liqligi ma'lum bo'lgan Faecalibacterium, Bifidobacterium, Bacteroides va Akkermansia avlodlari bizning tadqiqotimizda erta yoki kech diabetik KKDda ularning nisbiy ko'pligida sezilarli farqni ko'rsatmadi (5A-D-rasm). CKD bilan og'rigan bemorlarda yo'g'on ichakning haddan tashqari o'sishi ko'rsatilgan Actinobacteria va Firmicutes phyla, erta yoki kech diabetik KKDda nisbiy ko'plikda sezilarli farq ko'rsatmadi (6A-rasm). Uremik hayvonlar modellarida ichak mikrobiomasi Prevotellaceae tarkibining kamayishi bilan bog'liq edi. Bizning tadqiqotimizda Prevotellaceae oilasidagi Prevotella jinsi erta yoki kech diabetik CKDda nisbatan ko'plikda sezilarli farq ko'rsatmadi (6B-rasm).

Shakl 5. (A): Quti va mo'ylovli uchastkalarda erta va kech KKD guruhlari orasida Ruminococcus va Faecalibacterium avlodlarining nisbatan ko'pligi ko'rsatilgan. ns ahamiyatsizlikni bildiradi. (B): Quti va mo'ylovli uchastkalarda erta va kech KKD guruhlari o'rtasida Bifidobacterium jinsining nisbiy ko'pligi ko'rsatilgan. ns ahamiyatsizlikni bildiradi. (C): Quti va mo'ylovli uchastkalarda erta va kech KKD guruhlari orasida Bacteroides jinsining nisbiy ko'pligi ko'rsatilgan. (D): Quti va mo'ylovli uchastkalarda erta va kech KKD guruhlari orasida Akkermansia jinsining nisbatan ko'pligi ko'rsatilgan. ns ahamiyatsizlikni bildiradi.

Shakl 6. (A): Quti va mo'ylovli uchastkalarda Firmicutes va Actinobakteriyalarning nisbiy ko'pligi KKDning erta va kech guruhlari o'rtasida ko'rsatilgan. ns ahamiyatsizlikni bildiradi. (B): Quti va mo'ylovli uchastkalarda erta va kech KKD guruhlari o'rtasida Prevotella jinsining nisbiy ko'pligi ko'rsatilgan. ns ahamiyatsizlikni bildiradi.

4. Munozara

Muhim adabiyotlar to'plami ichak mikrobiotasining surunkali metabolik kasalliklar jarayonlarida, shu jumladan 2-toifa diabetdagi roli haqida dalillarni taqdim etadi. Tez-tez e'lon qilingan topilmalar orasida Bifidobacterium, Bacteroides, Faecalibacterium, Akkermansia va Roseburia avlodlari 2-toifa diabet bilan salbiy bog'langan, Ruminococcus, Fusobacterium va Blautia avlodlari esa 2-toifa diabet bilan ijobiy bog'langan. Ichak mikrobiotasi biokimyoviy muhitdagi o'zgarishlarga juda moslasha oladi, Vaziri va boshqalarning so'nggi tadqiqotlari. KBY bilan og'rigan bemorlarning ingichka ichaklarida aerob va anaerob bakteriyalar sonining ko'payishi bilan birga proteobakteriyalar, aktinobakteriyalar va firmikutlarning yo'g'on ichakda ko'payishini ko'rsatdi.

Diabetik CKD - ​​bu murakkab patofiziologik jarayonlarga ega bo'lgan ko'p tizimli kasallik jarayoni. Darhaqiqat, bunday dinamik patologik jarayon va ichak mikrobiotasiga bog'liq o'zgarishlar o'rtasidagi sabab-oqibat munosabatlarini farqlash qiyin. KBYda disbiyoz uchun javobgar bo'lgan omillar orasida yallig'lanish va uraemik muhit bilan bog'liq bo'lgan ichak to'sig'ining o'tkazuvchanligining oshishi va keyinchalik patogen bakteriyalar va bakterial endotoksinlarning ichak o'tkazuvchanligi oshishi tufayli ichak lümenidan qon oqimiga ko'chishi kiradi. Qandli diabet bilan bog'liq bo'lgan CKD bilan og'rigan bemorlarning aksariyati ko'pincha keng spektrli antibiotiklarni qabul qilishadi, chunki bu holatdan kelib chiqadigan infektsiyalar xavfi ortishi. Bunday antibiotiklardan foydalanish Firmicutes va Bacteroidetes o'rtasidagi muvozanatga olib keladi. Bunday davolash davrida bakteriyalarning xilma-xilligi pasayadi, chunki bu bakteriyalarning ko'pligi. Bundan tashqari, bakterial metabolizm va ichak disbiyozining muhim regulyatori ozuqa moddalarining mavjudligi va tarkibi, xususan, hazm bo'lmagan uglevodlar va oqsillar o'rtasidagi nisbat bilan ifodalanadi. Hozirgi vaqtda bunday ichak disbiyoziga olib keladigan bir nechta CKD bilan bog'liq jarayonlar mavjud. Misol tariqasida, ingichka ichakda oqsilning so'rilishi CKDda buziladi, bu esa yo'g'on ichakda oziq-ovqat oqsilining ko'payishiga va natijada yo'g'on ichakdagi uglevod-oqsil nisbatining pasayishiga olib keladi. Substrat mavjudligidagi bu o'zgarish sog'lom saxarolitikdan (Bifidobacterium va Lactobacillus turlari) yanada patogen proteolitik fermentatsiya modeliga o'tishga yordam berishi mumkin. Qandli diabetdagi disbiyozning mexanizmlari aniq tushunilmagan bo'lsa-da, qandli diabet bilan og'rigan bemorlarda odatda Faecalibacterium prausnitzii va Roseburia intestinalis kabi butirat ishlab chiqaruvchi bakteriyalarning kamayishi va opportunistik patogenlarning ko'payishi bilan tavsiflangan bakterial xilma-xillikning kamayishi ko'rsatilgan.

Qandli diabet bilan bog'liq bo'lgan CKD tufayli ichak disbiotik sababini ajratib olish qobiliyati gipertenziya, semirish va qon tomir kasalliklari kabi ko'plab komorbidiyalar mavjudligi sababli klinik muammo bo'lib qolmoqda. Bundan tashqari, diabetik KKDda terapevtik strategiyalar yuqorida ta'riflanganidek, ichak mikrobiomasiga mustaqil ta'sir ko'rsatishi mumkin bo'lgan dori-darmonlar va parhez cheklovlarini o'z ichiga oladi. Ushbu murakkabliklarga qaramay, buni taxmin qilish o'rinlibuyrak kasalligiva ichak mikrobiotasi bir-biriga ta'sir qilishi mumkin.

Xususan, sog'lom odamlar va diabetik KKD bilan kasallangan odamlar o'rtasidagi ichak mikrobiomalaridagi farqlar hujjatlashtirilgan [16,23,46]. Ushbu ma'lumotlarni hisobga olgan holda, biz ichak mikrobiomasining o'zgarishi yoki o'zgarishi haqidagi savolga javob berish uchun, asosan, 2-toifa diabet bilan og'rigan Avstraliya populyatsiyasining 95 ta najas namunalarida DNK profillarini kesma tahlil qildik (1-5) diabetik KKDning bu turli bosqichlari. Shunday qilib, asosiy yakuniy nuqta erta va kech KKD bo'lgan guruhlar o'rtasida potentsial differentsial mikrobioma profillarini aniqlash edi. KBYning 1, 2 va 3a bosqichlarini erta guruhga, 3b, 4 va 5 bosqichlarini esa kech guruhga kesib tashlash uchun asos, chunki surunkali buyrak disfunktsiyasi va yurak-qon tomir kasalliklari xavfi CKD 3b bosqichidan boshlab sezilarli darajada oshadi. va CKD rivojlanishini sekinlashtirishga qaratilgan klinik aralashuvlar alohida ahamiyatga ega.

Ma'lumotlar shuni ko'rsatdiki, erta va kech diabetik KKD bilan og'rigan odamlarning ichak mikrobiomalari va diabetik KKDning barcha 1-5 bosqichlarida bir xil. Adabiyotga mos ravishda, biz kohortimizda Firmicutes va Bacteroides filumlarining ustunligi borligini ko'rsatdik (4A-rasm). Bizning tadqiqotimizda biz 2-toifa diabet bilan salbiy bog'liq bo'lgan disbiyozni keltirib chiqaradigan avlodlar, xususan, Faecalibacterium, Bifidobacterium, Bacteroides va Akkermansiya KKH bosqichlarida shunga o'xshash miqdorda nisbiy ko'plikda mavjudligini aniq ko'rsatdik (5A-D-rasm). 2-toifa diabet bilan og'rigan odamlarda ijobiy bog'langan Ruminococcus jinsi diabetik KKDning erta yoki kechki bosqichida nisbiy ko'pligida sezilarli farqni ko'rsatmaydi (5A-rasm). Yo'g'on ichakning haddan tashqari o'sishiga olib kelishi ko'rsatilgan Actinobacteria va Firmicutes proteolitik bakteriyalari xuddi shunday nisbiy ko'plikda CKD bosqichlarida mavjud edi (6A-rasm). Bundan tashqari, biz diabetik KBHning har bir bosqichining mikrobial namunasidagi ekologik xilma-xillikni tekshirganimizda va uni diabetik KKDning boshqa bosqichlarining har biri bilan taqqoslaganimizda, biz hali ham sezilarli farqni kuzatmadik (3B-rasm). Ushbu topilmalar kasallik holatlarida disbioz haqida ma'lum dalillarni tasdiqlaydi, ammo qo'shimcha ravishda diabetik KKDning dastlabki bosqichida orttirilgan ichak disbiyozi barqaror bo'lib qolishi va kasallikning rivojlanishining keyingi bosqichlarigacha davom etishini ko'rsatadigan yangi dalillarni taqdim etadi. Ushbu ma'lumotlar oshqozon-ichak traktining mikrobial tarkibi ikkita CKD guruhida o'rganilgan mavjud adabiyotlarga asoslanadi. Kai-Yu Xu va boshqalar. GFR 7 ml/min/1,73 m2 dan katta yoki unga teng bo‘lgan va GFR 7 ml/min/1,73 m2 dan kam yoki unga teng bo‘lgan past GFR kichik guruhi sifatida aniqlangan yuqori GFR kichik guruhidagi 15 bemorda ichak mikrobiomasini tekshirdi. . Bizning ma'lumotlarimizga mos keladigan bo'lsa-da, kichik guruhlardagi kichik sonlarni va kasallikning turli bosqichlarining klinik spektrini aks ettirmaydigan GFR chegaralaridan foydalanishni hisobga olgan holda, ularni o'rganishdan juda ko'p xulosalar chiqarish qiyin.surunkali buyrak kasalligi, chunki ikkala kichik guruh 5-bosqichga yoki oxirgi bosqichga to'g'ri keladibuyrak kasalligi.

Bizning ma'lumotlarimiz shuni ko'rsatdiki, diabetik KKDning 1-5 bosqichlarida bakterial fila va oilaning o'rtacha nisbiy ko'pligi asosan o'xshash edi (4A, B-rasm). Bu polikistik kasalligi bo'lgan odamlarda ichak mikrobiomini baholagan Yacoub va boshqalar tomonidan olib borilgan tadqiqotdan olingan ma'lumotlarga mos keladi.buyrak kasalligiCKD ning turli bosqichlari bilan. Yakub va boshqalar faqat polikistik kasalligi bo'lgan juda tanlangan odamlar guruhida tadqiqot o'tkazdilarbuyrak kasalligiva turli darajadagi buyrak etishmovchiligining inson ichak mikrobiomasiga ta'sirini o'rganish uchun diabet va gipertenziyaning chalkash komorbiditlarisiz 3 ta KKD guruhi. 3 ta CKD guruhining har birida oltita bemorning kichik soniga qaramay, ular buyraklar faoliyatining turli xil disfunktsiyalari bo'lgan 3 guruhi bo'yicha fila darajasida operatsion taksonomik birliklarda (OTU) farqni ko'rsatmadi.

Prevotellaceae oilalari kamaygan aniq ichak mikrobiomasi CKD bilan bog'liq. Ushbu adabiyotga muvofiq, bizning natijalarimiz diabetik KKDning erta (3,87 ± 1,66 foiz) va kechki (3,36 ± {6}},98 foiz) bosqichlarida foydali Prevotellaceae ning o‘rtacha nisbiy ko‘pligi pastligini ko‘rsatdi (6B-rasm). . Prevotella shtammlari sog'lom inson tanasida keng tarqalganligi sababli klassik kommensal bakteriyalar hisoblanadi. Prevotella - turlar ichida va turlar orasida yuqori genetik xilma-xillikka ega bo'lgan jins, bu uning inson sog'lom mikrobiotasidagi ko'pligini tushuntirishi mumkin. Yuqorida aytib o'tilganidek, bu kommensal bakteriyalar qisqa zanjirli yog 'kislotalari (SCFAs), ayniqsa, ichak sog'lig'ini saqlash uchun juda muhim bo'lgan butir kislotasini ishlab chiqaradi. SCFA rollari ichak epitelial oziqlanishi va energiya komponentlarini ishlab chiqarish, ichak to'siqni funktsiyalarini saqlash va yallig'lanishning og'irligini kamaytirishni o'z ichiga oladi, lekin ular bilan cheklanmaydi. Bizning tadqiqotimizga o'xshash, Vaziri va boshqalar. uremik hayvonlarda Prevotellaceae oilasining kamayganini aniqladi.

Bizning tadqiqotimizda diabetik KKD ning barcha bosqichlarida taksonomik darajalarning birortasida operativ taksonomik birliklarda (OTU) hech qanday aniq farq yo'q edi, bu disbioz diabetik KKDda erta paydo bo'lishini va kasallikning kech bosqichlarigacha davom etishini ko'rsatadi. diabetik KKD rivojlanishida ichak disbiyozi qanday rol o'ynaydi degan savol. Biz dysbioz diabetik KKD rivojlanishiga ta'sir ko'rsatadigan bir nechta omillardan biri deb taxmin qilamiz. Gipertenziya, qandli diabet va qon tomir kasalliklari, proteinuriya va genetika kabi komorbid kasalliklar patogeneziga hissa qo'shadigan ba'zi omillardir.surunkali buyrak kasalligi. So'nggi paytlarda murakkab fenotipni aniqlashda, aks holda epigenetika deb ataladigan gen va atrof-muhitning o'zaro ta'siri patogeneziga ham hissa qo'shayotgani haqida dalillar ko'paymoqda.surunkali buyrak kasalligi.Yuqoridagi heterojen xavf omillariga o'xshash ichak disbiyozi KKH rivojlanishida potentsial sezuvchanlik omili bo'lishi mumkin, deb taxmin qilamiz.

Ma'lumki, ichak disbiyozida patogen bakteriyalar haddan tashqari ko'payadi va ichak o'tkazuvchanligiga zarar etkazuvchi lipopolisaxaridlar, peptidoglikanlar va bakterial DNKning ko'p miqdorini xostning qon aylanish tizimiga chiqaradi. Binobarin, bu ichak-shilliq qavat immun tizimining faollashishiga va interleykin (IL)-6, interferon (IFN-) va o'simta nekrozi omili (TNF) kabi omillarni ishlab chiqarish bilan yallig'lanish kaskadiga olib keladi. Immunitetning bunday doimiy faollashuvi endi KKH rivojlanishi va yurak-qon tomir asoratlari uchun asosiy xavf omili hisoblanadi. Ichak disbiyozining yallig'lanish omillarini ishlab chiqarishga ta'siriCKDLi F va boshqalar tomonidan tekshirilgan. . va ularning natijalari shuni ko'rsatadiki, mikrobiota disbiyozi surunkali tizimli yallig'lanishni keltirib chiqarishi mumkinCKD.

Qandli diabet juda tez-tez uchraydi va diabet bilan kasallanganda global miqyosda pandemiya darajasida mavjudsurunkali buyrak kasalligikeng tarqalgan oqibatidir. Biroq, bu shaxslarning faqat nisbatan kichik bir qismi bilanCKDga borishyakuniy bosqich buyrak kasalligi (ESKD)ularning hayoti davomida. Biz an'anaviy xavf omillarining har biri KBH rivojlanishiga ta'sir qilishi mumkin, deb taxmin qilamiz, ammo bu kasallikka chalingan barcha odamlarning ozchiligida yuzaga keladigan ushbu kasallikning progressiv tabiati ushbu barcha sezuvchanlik omillarining murakkab o'zaro ta'sirining natijasi bo'lishi mumkin. , shu jumladan ichak disbiyozi (qo'shimcha materiallar S1-rasm).

Ushbu tadqiqotning cheklovlaridan biri uning kichik namuna hajmi, ayniqsa diabetik KKDning kech bosqichlari (3b-5) bo'lgan atigi 25 nafar bemorning mavjudligi, natijada mikrob tendentsiyalarini tan olish qobiliyatini yo'qotishi mumkin. Buning sabablaridan biri shundaki, o'rganilayotgan ob'ektlar ambulatoriya endokrin klinikasidan tanlangan, bu erda buyrak funktsiyasining yanada rivojlanganligini ko'rishga moyillik kamroq. Biz tan olamizki, kech KKD guruhidagi kichik namuna hajmining o'ziga xos muammosi va bizning ko'p sonli kovariatlarimiz mikrobioma farqlarini aniqlash uchun cheklangan statistik kuchga, shuningdek, ta'sirni baholashning noaniqligiga va yuqori noto'g'ri ijobiy ko'rsatkichga olib keladi. Boshqa cheklovlar ushbu tadqiqot kogortasining kesma tabiatini o'z ichiga oladi, ya'ni bemor namunalari faqat bir martalik nuqtalarda to'plangan va uzunlamasına o'rganilmagan. Bundan tashqari, bizning ma'lumotlar to'plamimiz ichak mikrobiomining tarkibiga ta'sir qilishi ma'lum bo'lgan antibiotiklardan foydalanish haqida ma'lumotni o'z ichiga olmaydi. Yana bir muhim cheklov shundan iboratki, ishtirokchilarning ovqatlanish odatlari qayd etilmagan, bu esa har doim natijalarga ta'sir qiladi. Sog'lom guruh ham yo'q edi, ammo yuqorida aytib o'tilganidek, sog'lom va kasal guruhlar o'rtasidagi mikrobioma yaxshi tavsiflangan va bu tadqiqotning maqsadi emas edi.

Ushbu tadqiqot sohasidagi kelajakdagi yo'nalishlar diabetik KKDning har bir bosqichida (1-5) ko'proq bemorlarni uzunlamasına o'rganishni o'z ichiga olishi kerak, bunda asosiy e'tibor 2-toifa diabetning asosiy shakliga e'tiborni qaratib, dietani va dorilar, ayniqsa antibiotiklardan foydalanish haqida.

Ushbu tadqiqot diabetga chalingan va turli xil bemorlarda mikrobioma haqida ba'zi kutilmagan, ammo qiziqarli savollarni tug'diradi.buyrak funktsiyasining buzilishi. Biz hozirgi adabiyotlardan bilamizki, sog'lom odamlar va diabetik KKD bilan kasallangan odamlar o'rtasida ichak mikrobiomasida sezilarli farq bor. Biroq, ushbu tadqiqotning cheklovlari doirasida biz diabetik KKDning olti bosqichidan birortasida mikrobiomada sezilarli o'zgarishlarni kuzatmadik. Biz taklif qilamizki, bemorlar erta diabetik KKDda disbiyoz holatiga erishgan bo'lsalar, bu disbiyoz nisbatan bir xil bo'lib qoladi va boshqa xavf omillari (an'anaviy va yangi) bilan birgalikda diabetning kech bosqichiga o'tishiga ta'sir qiluvchi sezuvchanlik xavf omili sifatida qaralishi mumkin. CKD.

5. Xulosalar

Xulosa qilib aytadigan bo'lsak, CKD bilan bog'liq diabetga chalingan bizning kogortamizdan olingan ma'lumotlar phyla Firmicutes va Bacteroidetesning ustunligini ko'rsatadi. Ruminococcaceae va Bacteroidaceae oilalari eng yuqori ko'plikni ifodalaydi, foydali Prevotellaceae oilasi esa mo'l-ko'llikda kamayadi. Eng qiziqarli kuzatuv shundan iboratki, bu ichak mikroblarining nisbiy ko'pligi diabetik KKDning (1-5) bosqichlarida o'zgarmaydi, bu diabet bilan bog'liq CKD rivojlanishining dastlabki hodisasi ekanligini ko'rsatadi. 2-toifa diabet bilan bog'liq salbiy bog'langan Bifidobacterium, Bacteroides, Faecalibacterium va Akkermansia avlodlari, xuddi ijobiy bog'langan Ruminococcus kabi erta va kech KKD guruhlari o'rtasida o'xshash nisbiy ko'plikni ko'rsatdi. Biz taxmin qilamizki, diabetik KKDning dastlabki bosqichlarida olingan disbiotik mikrobioma nisbatan statik bo'lib qoladi va progressiv kasallikka ta'sir qiluvchi ko'plab xavf omillaridan faqat biri hisoblanadi.buyrak funktsiyasining buzilishi. Ushbu topilmalar ko'plab namunalar va klinik ma'lumotlar, shu jumladan parhez va dori-darmonlar to'g'risidagi ma'lumotlar bilan vaqt o'tishi bilan bo'ylama kuzatilgan katta bemorlar kogortalarida qo'shimcha tekshiruvni talab qiladi. Shundagina disbiotik mikrobioma tarkibi bir xil bo'lib qoladimi yoki surunkali diabet rivojlanishi bilan sezilarli darajada o'zgaradimi, ishonchli tekshirish mumkin bo'ladi.buyrak kasalligi?

Moliyalashtirish:Ushbu tadqiqot hech qanday haddan tashqari moliyalashtirilmagan.

Axborotlangan rozilik bayonoti:Tadqiqotga jalb qilingan barcha sub'ektlardan xabardor qilingan rozilik olindi.

Minnatdorchilik:Mualliflar Kyoko Xasebega DNK ekstraktsiyasi va protokolni ko'rib chiqishda yordam bergani uchun minnatdorchilik bildiradilar. Mualliflar tadqiqotga saxiylik bilan vaqt ajratgan ishtirokchilarni tan oladilar.

Manfaatlar to'qnashuvi:Mualliflar manfaatlar to'qnashuvi yo'qligini e'lon qilmaydi.

1. Huper, LV; Gordon, JI Commensal Ichakdagi xost-bakterial munosabatlar. Fan 2001, 292, 1115–1118.

2. Bourlioux, P.; Koletzko, B.; Guarner, F.; Braesco, V. Ichak va uning mikroflorasi uy egasining himoyasi bo'yicha hamkorlardir: Parijda 2002 yil 14 iyunda bo'lib o'tgan Danone "Aqlli ichak" simpoziumida hisobot. Am. J. Klin. Nutr. 2003, 78, 675–683.

3. Rodriges, JM; Merfi, K.; Stanton, C.; Ross, RP; Kober, OI; Juge, N.; Avershina, E.; Rudi, K.; Narbad, A.; Jenmalm, MC; va boshqalar. Hayot davomida ichak mikrobiotasining tarkibi, erta hayotga urg'u beradi. Mikrob. Ekol. Shifolash. Dis. 2015 yil, 26, 26050.

4. Aron-Visnyuskiy, J.; Clément, K. Ichak mikrobiomasi, dietasi va kardiometabolik va surunkali kasalliklarga aloqasi. Nat. Ruhoniy Nefrol. 2015, 12, 169–181.

5. Xuttenxauer, C.; Gevers, D.; Ritsar, R.; Abubuker, S.; Badger, JH; Chinwalla, AT; Creasy, HH; Erl, AM; FitzGerald, MG; Fulton, RS; va boshqalar. Sog'lom inson mikrobiomasining tuzilishi, funktsiyasi va xilma-xilligi. Tabiat 2012, 486, 207–214.

6. Ley, RE; Turnbaugh, PJ; Klein, S.; Gordon, JI. Semizlik bilan bog'liq inson ichak mikroblari. Tabiat 2006, 444, 1022–1023.

7. Karlsson, FH; Tremaroli, V.; Nukaev, I.; Bergström, G.; Behre, CJ; Fagerberg, B.; Oddiy, buzilgan va diabetik glyukoza nazorati bo'lgan Evropa ayollarida Nielsen, J. Gut metagenomi. Tabiat 2013, 498, 99–103.

8. Xalqaro qandli diabet federatsiyasi (IDF). Qandli diabet atlasi, 7-nashr; Xalqaro diabet federatsiyasi: Bryussel, Belgiya, 2015 yil.

9. AQSh Buyrak ma'lumotlari tizimi 2008. Yillik ma'lumotlar hisoboti. Qo'shma Shtatlardagi surunkali buyrak kasalligi va yakuniy bosqich buyrak kasalligi atlasi; Milliy sog'liqni saqlash institutlari, Milliy diabet va ovqat hazm qilish va buyrak kasalliklari institutlari: Bethesda, MD, AQSh, 2008 yil.

10. Valmadrid, KT; Klein, R.; Moss, SE; Klein, BE. Qandli diabet bilan og'rigan keksa odamlarda mikroalbuminuriya va yalpi proteinuriya bilan bog'liq yurak-qon tomir kasalliklaridan o'lim xavfi. Ark. Stajyor. Med. 2000, 160, 1093–1100.

11. Karrero, JJ; Stenvinkel, P. Surunkali buyrak kasalligida boshqa xavf omillari uchun katalizator sifatida doimiy yallig'lanish: Gipoteza taklifi. Klin. J. Am. Soc. Nefrol. 2009, 4 (1-ilova), S49–S55.

12. Larsen, N.; Vogensen, FK; van den Berg, FWJ; Nielsen, DS; Andreasen, AS; Pedersen, BK; Abu al-Soud, V.; Sørensen, SJ; Xansen, LH; Jakobsen, M. Gut 2-toifa qandli diabetga chalingan kattalardagi inson mikrobiotasi diabetga chalingan bo'lmagan kattalardan farq qiladi. PLoS ONE. 2010, 5, e9085.

13. Qin, J.; Li, Y.; Cai, Z.; Li, S.; Chju, J.; Chjan, F.; Liang, S.; Chjan V.; Guan, Y.; Shen, D.; va boshqalar. 2-toifa diabetda ichak mikrobiotasini metagenom miqyosda assotsiatsiya o'rganish. Tabiat 2012, 490, 55–60.

14. Hatch, M.; Freel, RW; Vaziri, ND Surunkali buyrak etishmovchiligida oksalatning ichak orqali chiqarilishi. J. Am. Soc. Nefrol. 1994, 5, 1339–1343.

15. Vaziri, ND; Freel, RW; Hatch, M. Surunkali eksperimental buyrak etishmovchiligining urat metabolizmiga ta'siri. J. Am. Soc. Nefrol. 1995, 6, 1313–1317.

16. Xu, K.-Y.; Xia, G.-H.; Lu, J.-Q.; Chen, M.-X.; Zhen, X.; Vang, S.; Siz, C.; Ni, J.; Chjou, X.; Yin, J. Buyrak funktsiyasining buzilishi va ichak mikrobiotasining disbiyozi surunkali buyrak kasalligi bo'lgan bemorlarda trimetilamin-N-oksidning ko'payishiga yordam beradi. Sci. Rep. 2017, 7, 1–12.

17. Yakub, R.; Nugent, M.; Cai, V.; Nadkarni, GN; Chaves, LD; Abyad, S.; Xonan, AM; Tomas, SA; Chjen V.; Valiyaparambil, SA; va boshqalar. Peritoneal dializ bilan og'rigan bemorlarda bakterial ichak mikrobiotasiga yuqori glikatsiyalangan mahsulotlarning dietani cheklash ta'siri; randomize ochiq yorliqli nazorat ostida sinov. PLoS ONE 2017, 12, e0184789.

18. Sabatino, A.; Regolisti, G.; Kosola, C.; Gesualdo, L.; Fiaccadori, E. 2-toifa diabet va surunkali buyrak kasalligida ichak mikrobiotasi. Curr. Diabet Rep. 2017, 17, 16.

19. Felizardo, RJF; Kastoldi, A.; Andrade-Oliveyra, V.; Câmara, NOS Mikrobiota va surunkali buyrak kasalliklari: Ikki qirrali qilich. Klin. Tarjima. Immunol. 2016, 5, e86. 20. Vong, J.; Piceno, YM; DeSantis, TZ; Pahl, M.; Andersen, GL; Vaziri, ND ESRDda ureaza va urikaz o'z ichiga olgan, indol va p-krezol hosil qiluvchi kengayishi va qisqa zanjirli yog 'kislotasi ishlab chiqaruvchi ichak mikrobiotalarining qisqarishi. Am. J. Nefrol. 2014, 39, 230–237.

21. Le Chatelier, E.; Nielsen, T.; Qin, J.; Prifti, E.; Xildebrand, F.; Faloniy, G.; Almeyda, M.; Arumugam, M.; Batto, J.-M.; Kennedi, S.; va boshqalar. Inson ichak mikrobiomasining boyligi metabolik belgilar bilan bog'liq. Tabiat 2013, 500, 541–546.

22. de Andrade, LS; Ramos, CI; Cuppari, L. Buyrak va ichak o'rtasidagi o'zaro suhbat: Surunkali buyrak kasalligi uchun oqibatlari. Nutrire 2017, 42, 27.

23. Vaziri, ND; Vong, J.; Pahl, MV; Piceno, YM; Yuan, J.; DeSantis, TZ; Ni, Z.; Nguyen, T.-H.; Andersen, GL Surunkali buyrak kasalligi ichak mikrobial florasini o'zgartiradi. Buyrak Int. 2013, 83, 308–315.

24. Martines-Kastelao, A.; Navarro-Gonsales, JF; Gorriz, JL; de Alvaro, F. So'nggi yillarda diabetik nefropatiya tushunchasi va epidemiologiyasi o'zgardi. J. Klin. Med. 2015, 4, 1207–1216.

25. Jamg'arma, NK ACR.

26. Go, AS; Chertow, GM; Fan, D.; McCulloch, Idoralar; Xsu, C.-Y. Surunkali buyrak kasalligi va o'lim xavfi, yurak-qon tomir kasalliklari va kasalxonaga yotqizish. N. Engl. J. Med. 2004, 351, 1296–1305.

27. Chjan, J.; Kobert, K.; Flori, T.; Stamatakis, A. PEAR: Tez va aniq Illumina Paired-End o'qish birlashmasi. Bioinformatika 2014, 30, 614–620.

28. Kaporaso, JG; Kuchinski, J.; Stombaugh, J.; Bittinger, K.; Bushman, FD; Kostello, EK; Fierer, N.; Peña, AG; Gudrich, JK; Gordon, JI; va boshqalar. QIIME yuqori o'tkazuvchanlikdagi jamoalar ketma-ketligi ma'lumotlarini tahlil qilish imkonini beradi. Nat. Metodlar 2010, 7, 335–336.

29. Edgar, RC Qidiruv va klasterlash buyurtmalarini BLASTga qaraganda tezroq. Bioinformatika 2010, 26, 2460–2461.

30. Edgar, RC; Haas, BJ; Klemente, JK; behi, C.; Knight, R. UCHIME ximerani aniqlashning sezgirligi va tezligini yaxshilaydi. Bioinformatika 2011, 27, 2194–2200.

31. Edgar, RC UPARSE: Mikrobial amplikon o'qishlaridan yuqori aniqlikdagi OTU ketma-ketliklari. Nat. Usullar 2013, 10, 996–998.

32. DeSantis, TZ; Xyugenxoltz, P.; Larsen, N.; Rojas, M.; Brodi, EL; Keller, K.; Huber, T.; Dalevi, D.; Xu, P.; Andersen, GL Greengenes, kimera tomonidan tekshirilgan 16S rRNK gen ma'lumotlar bazasi va ARB bilan mos ish stoli. Ilova. Atrof. Mikrobiol. 2006, 72, 5069–5072.

33. Makmurdi, PJ; Xolms, S. phyloseq: Mikrobiomalarni ro'yxatga olish ma'lumotlarining takrorlanadigan interaktiv tahlili va grafikasi uchun R to'plami. PLoS ONE. 2013, 8, e61217.

34. Shennon, Idoralar Aloqaning matematik nazariyasi. Qo'ng'iroq tizimi. Tech. J. 1948, 27, 379–423.

35. Bauer, DF Rank statistikasi yordamida ishonch to'plamlarini qurish. J. Am. Stat. Dots. 1972, 67, 687.

36. Lozupone, C.; Knight, R. UniFrac: Mikrobial jamoalarni solishtirishning yangi filogenetik usuli. Ilova. Atrof. Mikrobiol. 2005, 71, 8228–8235.

37. Lozupone, C.; Lladser, ME; Ritsarlar, D.; Stombaugh, J.; Knight, R. UniFrac: Mikrobial hamjamiyatni taqqoslash uchun samarali masofaviy o'lchov. ISME J. 2011, 5, 169–172.

38. Oksanen, J.; Kindt, R.; Legendre, P.; O'Xara, B.; Simpson, GL; Solymos, P.; Stivens, MHH; Eduard Szoeks, E.; Vagner, H. Vegan: Jamoatchilik ekologiyasi to'plami. R paketining 1-versiyasi.13-12. 2008 yil.

39. Gurung, M.; Li, Z.; Siz, H.; Rodriges, R.; Sakrash, JB; Morgan, A.; Shulzhenko, N. 2-toifa diabet patofiziologiyasida ichak mikrobiotasining roli. EBioMedicine 2020, 51, 102590.

40. Sircana, A.; Framarin, L.; Leone, N.; Berrutti, M.; Kastellino, F.; Parente, R.; De Michieli, F.; Paschetta, E.; Musso, G. 2-toifa diabetda ichak mikrobiotasini o'zgartirdi: shunchaki tasodifmi? Curr. Diabet Rep. 2018, 18, 98.

41. Vaziri, ND; Yuan, J.; Nazertehrani, S.; Ni, Z.; Liu, S. Surunkali buyrak kasalligi oshqozon va ingichka ichak epiteliyasining qattiq birikmasining buzilishiga olib keladi. Am. J. Nefrol. 2013, 38, 99–103.

42. Rinninella, E.; Raul, P.; Cintoni, M.; Francheski, F.; Miggiano, GAD; Gasbarrini, A.; Mele, MC Sog'lom ichak mikrobiota tarkibi nima? Yosh, atrof-muhit, parhez va kasalliklar bo'yicha o'zgaruvchan ekotizim. Mikroorganizmlar 2019, 7, 14.

43. Bammens, B.; Verbeke, K.; Vanrenterghem, Y.; Evenepoel, P. Surunkali buyrak etishmovchiligida oqsilni assimilyatsiya qilishning buzilishiga dalil. Buyrak Int. 2003, 64, 2196–2203.

44. Moraes, C.; Fuke, D.; Amaral, AC; Mafra, D. Surunkali buyrak kasalligi bilan og'rigan bemorlarda ichak mikrobiotasidan trimetilamin N-oksidi: Dietga e'tibor bering. J. Ren. Nutr. 2015, 25, 459–465.

45. Montemurno, E.; Kosola, C.; Dalfifino, G.; Daidone, G.; De Anjelis, M.; Gobbetti, M.; Gesualdo, L. Siz nima iste'mol qilmoqchisiz, janob CKD Microbiota? O'rta er dengizi dietasi, iltimos! Buyrak qon bosimi. Res. 2014, 39, 114–123.

46. ​​Gradisteanu, G.; Stoika, R.; Petcu, L.; Piku, A.; Suceveanu, A.; Salmen, T.; Stefan D.; Serafifanceanu, C.; Chififiriuc, MC; Surunkali buyrak kasalligi bo'lgan -2 turdagi diabetik bemorlarda Stoian, AP Microbiota imzolari - Pilot tadqiqoti. J. Mind Med Sci. 2019, 6, 130–136.

47. Li, F.; Vang, M.; Vang, J.; Li, R.; Zhang, Y. Ichak mikrobiotasiga o'zgarishlar va ularning surunkali buyrak kasalligida yallig'lanish omillari bilan bog'liqligi. Old. Hujayra. Yuqtirish. Mikrobiol. 2019, 9, 206.

48. Yakub, R.; Nadkarni, GN; McSkimming, DI; Chaves, LD; Abyad, S.; Bryniarski, MA; Xonan, AM; Tomas, SA; Gouda, M.; U, JC; va boshqalar. Buyrak funktsiyasi bo'yicha polikistik buyrak kasalligi bo'lgan bemorlarning najas mikrobiotasini tahlil qilish: pilot tadqiqot. Exp. Biol. Med. 2019, 244, 505–513.

49. Precup, G.; Vodnar, D.-C. Gut Prevotella dietaning mumkin bo'lgan biomarkeri va uning eubiotik va disbiotik rollari sifatida: keng qamrovli adabiyotlarni ko'rib chiqish. Br. J. Nutr. 2019, 122, 131–140.

50. den Besten, G.; van Eunen, K.; Groen, AK; Venema, K.; Reijngoud, DJ; Bakker, BM Qisqa zanjirli yog 'kislotalarining dieta, ichak mikrobiotasi va mezbon energiya almashinuvi o'rtasidagi o'zaro ta'sirida roli. J. Lipid Res. 2013, 54, 2325–2340.

51. Peng, L.; Li, ZR; Yashil, RS; Holzman, IR; Lin, J. Butirat Caco-2 hujayra monoqatlamlarida AMP bilan faollashtirilgan protein kinazni faollashtirish orqali qattiq birikma birikmasini osonlashtirish orqali ichak to'sig'ini kuchaytiradi. J. Nutr. 2009, 139, 1619–1625.

52. Keku, TO; Dulal, S.; Deveaux, A.; Jovov, B.; Xan, X. Oshqozon-ichak mikrobiotasi va kolorektal saraton. Am. J. Fiziol. Jigar fiziol. 2015, 308, G351–G363.

53. Staples, A.; Vong, C. Surunkali buyrak kasalligining rivojlanishi uchun xavf omillari. Curr. Fikr. Pediatr. 2010, 22, 161–169.

54. Qanot, MR; Ramezani, A.; Gill, HS; Devaney, JM; Raj, DS Surunkali buyrak kasalligi rivojlanishining epigenetikasi: fakt yoki fantaziya? Semin. Nefrol. 2013, 33, 363–374.

55. Sabatino, A.; Regolisti, G.; Brusasko, I.; Kabasi, A.; Morabito, S.; Fiaccadori, E. Surunkali buyrak kasalligida ichak to'sig'i va mikrobiotaning o'zgarishi. Nefrol. Tering. Transplantatsiya. 2014, 30, 924–933.

56. Qo'l, TW; Vujkovich-Chvijin, I.; Ridaura, VK; Belkaid, Y. Mikrobiota, surunkali kasallik va immun tizimini bog'lash. Trendlar Endokrinol. Metab. 2016, 27, 831–843.

57. Rossi, M.; Kempbell, KL; Jonson, DW; Stanton, T.; Vesey, DA; Coombes, JS; Weston, KS; Xouli, CM; McWhinney, BC; Ungerer, JP; va boshqalar. Protein bilan bog'langan uremik toksinlar, yallig'lanish va oksidlovchi stress: surunkali buyrak kasalligining 3-4 bosqichida kesma tadqiqot. Ark. Med Res. 2014, 45, 309–317.

58. Darisipudi, MN; Knauf, F. Buyrak kasalliklari patogenezida yallig'lanishning roli haqida yangilanish. Pediatr. Nefrol. 2015, 31, 535–544.

59. Turin, TC; Tonelli, M.; Manns, BJ; Ahmad, SB; Ravani, P.; Jeyms, M.; Hemmelgarn, BR Hayot davomida ESRD xavfi. J. Am. Soc. Nefrol. 2012, 23, 1569–1578.

QO'ShIMChA MA'LUMOT UCHUN:david.deng@wecistanche.com