Buyrak kasalliklarini bir hujayrali darajada o'rganish
Apr 04, 2023
Abstrakt
Ma'lumot: Buyrak juda murakkab organ bo'lib, sog'liq uchun zarur bo'lgan ko'p funktsiyalarga ega. Buyrak kasalligi buyraklar shikastlanganda va to'g'ri ishlamasa paydo bo'ladi. Yagona hujayrali tahlil buyrak hujayralarining normal va g'ayritabiiy turlari haqida misli ko'rilmagan ma'lumot beradigan kuchli usul bo'lib, umumiy buyrak kasalliklari mexanizmlari haqidagi tushunchamizni o'zgartiradi.
Xulosa: Buyrak kasalligining patogenezi haqidagi tushunchamiz buyrak funktsiyasi uchun mas'ul bo'lgan hujayra turlarining to'liq bo'lmagan molekulyar tavsifi bilan cheklangan. Buyrak tadqiqotlarida bitta hujayrali texnologiyani qo'llash buyrak kasalliklarining rivojlanishi va rivojlanishida hujayralarning heterojenligini, genlarni ifodalash profillarini va molekulyar dinamikani aniqladi. Buyrak organoidi va allogreft to‘qimalarining bir hujayrali tahlili buyrak organogenezi, kasallik mexanizmlari va terapevtik natijalar haqida yangi tushunchalar berdi. Umuman olganda, buyrak hujayralarining heterojenligi va buyrak kasalliklarining molekulyar dinamikasini yaxshiroq tushunish diagnostika aniqligini oshiradi va nefrologiyada yangi terapevtik strategiyalarni aniqlashga yordam beradi.
Asosiy xabar: Ushbu sharh maqolasida biz buyrak kasalligi bo'yicha so'nggi bir hujayrali tadqiqotlarni umumlashtiramiz va bitta hujayrali texnologiyaning asosiy va klinik buyrak tadqiqotlariga ta'sirini muhokama qilamiz.
Kalit so'zlar
Bir hujayrali texnologiya; Buyrak kasalligi; Immun hujayralari; Buyrak organoidi; allograft;Cistanche foydalari.
Kirish
Buyraklar loviya shaklidagi ikkita organ bo'lib, qondagi chiqindilarni, ortiqcha suvni va boshqa aralashmalarni filtrlash va siydik ishlab chiqarish uchun javobgardir. Buyraklar, shuningdek, pH, tuz va kaliy darajasini va qon bosimini tartibga soladi; qizil qon hujayralari ishlab chiqarishni nazorat qilish; va organizmga kaltsiyni so'rilishiga yordam beradigan D vitamini shaklini faollashtiradi. bugungi kunga kelib, butun dunyo bo'ylab taxminan 850 million kishi buyrak kasalligi, jumladan surunkali buyrak kasalligi (CKD), o'tkir buyrak shikastlanishi, buyrak etishmovchiligi va boshqa ko'plab kasalliklardan aziyat chekmoqda. Buyrak kasalligi buyraklar shikastlanganda va o'z vazifalarini bajara olmaganida paydo bo'ladi. Zarar diabet, yuqori qon bosimi va boshqa turli xil surunkali (uzoq muddatli) sharoitlar tufayli yuzaga kelishi mumkin. Buyrak kasalligi boshqa sog'liq muammolariga, jumladan osteoporoz, asab shikastlanishi, to'yib ovqatlanmaslik va yurak kasalliklariga olib kelishi mumkin. Bemorlarni davolashning hozirgi strategiyalari qimmatga tushadigan buyrak transplantatsiyasi yoki dializ bo'lib qolmoqda.
Buyrakning turli hujayralari, shu jumladan epiteliy, tilakoid, endotelial va neyron hujayralari, shuningdek, immun hujayra tarmoqlari buyrak faoliyatini normal saqlash uchun o'zaro ta'sir qiladi. Sog'lom buyraklarning heterojenligini va buyrak kasalligining asosiy jarayonlarini chuqurroq tushunish buyrakning molekulyar va gistopatologik fenotipik ta'rifini aniqlaydi va kasallikning yangi tasniflarini ishlab chiqishga yordam beradi. Yagona hujayrali texnologiya buyrak kasalligining boshlanishi va rivojlanishi davrida hujayraning pastki turlarini, holatini va chastotasi o'zgarishini aniqlashda potentsial foydalidir. So'nggi yillarda, yuqori samarali bir hujayrali RNK ketma-ketligi (scRNA-seq) texnologiyasining jadal rivojlanishi bilan, buyrak aniqligi bo'yicha tibbiyot tadqiqotlari uchun oddiy buyrakning keng qamrovli uyali atlasi yaratildi. Buyrakning nozik tibbiyoti loyihasi (KPMP) inson buyragi biopsiyalarini olish, buyrak to'qimalari atlaslarini yaratish, kasallikning subpopulyatsiyalarini aniqlash va oxir-oqibat asosiy hujayralar, yo'llar va yangi terapiya maqsadlarini aniqlash uchun global miqyosda ishlab chiqilgan. Buyrak bilan bog'liq bir hujayrali transkripsiya ma'lumotlar to'plamiga asoslanib, tadqiqotchilar, shuningdek, buyrak hujayralari subtiplaridagi ACE2, TMPRSS2 va SLC6A19 gen ekspresyon profillarini tahlil qildilar, bu og'ir o'tkir respirator sindromli koronavirus 2 patogenezini tushunish uchun juda muhimdir. Ushbu sharhda, biz (1) bitta hujayrali texnologiyani ishlab chiqish va qo'llashga, (2) buyrak kasalliklarining rivojlanishi va rivojlanishini o'rganish uchun scRNA-seqdan foydalanishga, (3) buyrak kasalliklarida immun hujayralarining molekulyar xaritasiga, ( 4) buyrakga o'xshash organlarga scRNA-seqni qo'llash va (5) buyrak allogreftlarini chuqur o'rganish uchun scRNK-seqdan foydalanish (1-rasm).
Olish uchun shu yerni bosingCistanche ning buyraklarga ta'siri
Bir hujayrali transkriptomik texnologiyani ishlab chiqish va qo'llash
Yagona hujayra hayotning asosiy birligidir. Yagona hujayrali tahlil usullari bizning hujayra tarkibini aniqlash, molekulyar dinamikani kuzatish va patologik mexanizmlarni ochish qobiliyatimizni inqilob qildi. Erta global yagona hujayrali gen ekspressiyasi tahlili mikroarray va qPCR texnikasi yordamida amalga oshirildi. Tietjen va boshqalar. individual neyronlar va progenitor hujayralarning molekulyar ifoda profillarini kuzatish va turli rivojlanish bosqichlarida signalizatsiya yo'llarini aniqlash uchun bitta hujayrali mikroarraylardan foydalangan. Bundan tashqari, bitta hujayrali ekspressiya tahlili oshqozon osti bezi rivojlanishiga yangi tushunchalar beradigan yangi oshqozon osti bezi genlariga ega bo'lgan bir nechta rivojlanayotgan hujayra subtiplarini aniqladi. Bu sinf bir hujayrali qPCR texnikasini ishlab chiqdi va ularni sichqonchaning blastotsist rivojlanishi va gematopoetik nasl differensiatsiyasida asosiy tartibga soluvchi genlarni o'rganish uchun qo'lladi.
Keyingi avlod sekvensiyasi texnologiyalarining paydo bo'lishi bilan scRNA-seq turli xil izoformlarni, allel ifodasini va bitta hujayradagi yangi transkriptlarni arzonroq narxda ajratishda aniq afzalliklarni ko'rsatdi. 2009 yilda Tang va boshqalar. birinchi bitta hujayrali mRNK butun transkriptoma ketma-ketligi haqida xabar berib, bitta sichqoncha oositlari yoki oositlardagi transkripsiya variantlarining murakkabligini ko'rsatdi. smart-seq was 2012 yagona hujayralardagi to'liq uzunlikdagi transkriptlarni aniqlash uchun ishlab chiqilgan va uni noyob hujayralarga qo'llash orqali tadqiqotchilar melanoma aylanma o'simta hujayralari uchun nomzod biomarkerlarni aniqladilar. Bir yil o'tgach, yaxshilangan teskari transkripsiya, o'qish qamrovi, tarafkashlik va aniqlik bilan Smart-seq2 taqdim etildi. Smart-seq3-dagi so'nggi ishlanmalar, allel va izoform o'lchamlari bilan minglab bitta hujayrali transkriptlarni aniqlashda uning sezgirligini sezilarli darajada yaxshiladi. PCR-ga asoslangan kuchaytirish usullaridan farqli o'laroq, CEL-seq multipleks chiziqli kuchaytirish orqali samarali bitta hujayrali transkriptomlarni ushlaydi. Dastlabki Cryptobacterium hidradenoma embrion rivojlanishini o'rganish uchun CEL-seq yordamida o'tkazilgan tadqiqot uning bir hujayrali rezolyutsiyada takrorlanadigan va sezgir natijalarini aniqladi. scRNA-seq ning birinchi avtomatlashtirilgan platformasi Fluidigm C1 bo'lib, u 96 yoki 384 kameradagi bitta hujayralarni ushlash uchun mikrofluidik tizimdan foydalanadi, so'ngra hujayra lizisi, teskari transkripsiya va PCR kuchaytirilishi.
2015 yildan beri bir hujayrali tadqiqotlar Drop-seq, inDrop, 10× Genomics, Seq-well, Microwell-seq va SPLiTseq doimiy mavjudligi bilan yuqori o'tkazuvchanlik, arzon narxlardagi va avtomatlashtirish davriga to'liq kirdi. Drop-seq va inDrop alohida hujayralarni nanolitr o'lchamdagi tomchilarga ajratadi va har bir hujayrani belgilash uchun ularni noyob shtrix-kod bilan aralashtiradi. Boshqa tomondan, Cyto-seq, Seq-well va Microwell-seq mikroquduqdagi hujayra va shtrixli boncukni ushlab, yuqori o'tkazuvchanlikdagi bitta hujayrali mRNK ketma-ketligini ta'minlaydi. Bizning guruhimiz Microwell-seq yordamida bitta hujayra darajasida birinchi sichqoncha hujayralari atlasini va inson hujayralari landshaftini yaratdi. Yaqinda yuqori o'tkazuvchanlik va oddiyroq usullar scRNA-seq uchun SPLiT-seq va sci-RNK-seq deb nomlanadi. Ushbu usullar hujayra yoki yadroning o'zidan hovuzning bo'linishining bir necha turlari orqali shtrixli hujayralarni shtrix kodlash uchun reaktsiya kamerasi sifatida foydalanadi. Keyin barcha hujayralar cDNK PCR kuchaytirilishi va ketma-ketligiga duchor bo'ladi. Cao va boshqalar. taxminan 2 million sichqonchaning organogen hujayralari va 4 million inson homila hujayralarining transkriptomlarini tahlil qilish uchun sci-RNK-seq3 dan foydalangan, bu esa sutemizuvchilarning rivojlanish jarayonlarining global ko'rinishini ta'minlaydi. Genomik, proteomik va epigenomik tahlillarni qamrab oluvchi boshqa bir hujayrali texnologiyalar ham rivojlandi; ammo ular ushbu maqola doirasidan tashqarida.
Buyrak kasalligining paydo bo'lishi va rivojlanishi
Buyrak ko'plab keng tarqalgan va jiddiy kasalliklarga, jumladan o'tkir buyrak shikastlanishiga, glomerulonefritga, ko'tarilgan infektsiyalarga (pielonefrit) va saratonga ta'sir qilishi mumkin. Umuman olganda, buyrak kasalligining patogenezini tushunishimiz organlarning o'ziga xos funktsiyalari uchun javobgar bo'lgan hujayra turlarining to'liq bo'lmagan molekulyar tavsifi bilan cheklangan. Ushbu bilim bo'shlig'ini yopish uchun bizning guruhimiz va Park va boshqalar. scRNA-seq yordamida sog'lom sichqon buyragining transkripsiya atlasini yaratdi. Buyrak birligi epiteliy hujayralarining asosiy kichik tiplariga pedunkul hujayralari, proksimal quvurli epiteliy hujayralari, Henle halqasi, distal kanalchalar va yig'uvchi kanal hujayralari kiradi. Tadqiqot kanal hujayralari populyatsiyasini yig'ish uchun yangi ko'chib yuruvchi hujayra turini aniqladi, bu scRNA-seq tadqiqotlarida interkalatsiyalangan hujayralar va asosiy hujayralar o'rtasidagi o'zaro konversiyaning oldingi topilmalarini tasdiqladi. Bundan tashqari, Ransick va boshqalar. erkak va ayol kattalar buyraklarini tahlil qildi va bitta hujayra darajasida sichqonchaning buyragi elementlarining anatomik atlasini yaratdi. Bizning guruhimiz, shuningdek, inson homilasi va kattalar buyrak to'qimalarining Microwell-seq tahlilini o'tkazdi. Epitelial hujayralar, endotelial hujayralar, stromal hujayralar va to'qima ichidagi immun hujayralarga qo'shimcha ravishda, biz homila buyragida ilgari tavsiflanmagan s-tipli somatik hujayra turlarini va kattalar buyragida yangi migratsiya hujayra turini aniqladik. Buyrak qon tomir tizimining bir hujayrali molekulyar profili qurilish nefronlarining maxsus ekspressiv profillarini aniqladi va buyrak kasalliklarining patogenezini ochib berdi. Bundan tashqari, barcha turdagi glomerulyar hujayralar sog'lom sichqonlardan va turli xil kasallik modellaridan bitta hujayrali transkriptom klasterlash tahlili orqali aniqlandi va kasallik modellarida nefrotoksik immunitetdan keyin podotsitlarda faollashgan Hippo yo'li kabi yangi kasallik bilan bog'liq genlar va tartibga solish yo'llari aniqlandi. jarohat.
Buyrak fibrozi CKDning o'ziga xos belgisi bo'lib, dunyo aholisining 10 foizidan ko'prog'iga ta'sir qiladi. Buyrak fibrozining heterojen birga yashash modelida Kramann va boshqalar. monotsitlar miofibroblastlarning kichik qismini qo'shganligini, lekin ko'pchilik miofibroblastlar mezenxima hujayralaridan olinganligini tasdiqlash uchun scRNA-seqdan foydalangan. Keyinchalik, Kuppe va boshqalar. [37] proksimal va proksimal bo'lmagan kanalchalardagi taxminan 135 000 hujayraning transkriptomini tahlil qildi va MSC ning turli izoformlari inson buyrak fibroziga asosiy hissa qo'shuvchi ekanligini tasdiqladi. Bundan tashqari, sog'lom va fibrotik buyrak monositlarini qiyosiy tahlil qilishda, miofibroblastga xos gen, yalang'och keratinotsit homologi 2 (NKD2) inson buyrak fibrozi uchun potentsial terapevtik maqsad sifatida aniqlandi. 402 ta buyrak biopsiyasiga asoslanib, siydik fibrinogeni KBH bo'lgan bemorlarda invaziv bo'lmagan biomarker sifatida taxmin qilingan.
Standartlashtirilgan Cistanche
Diabetik nefropatiya (DN) bir vaqtning o'zida glomeruli va quvurli interstitiumning shikastlanishi bilan tavsiflanadi. Biroq, kasallikning boshlanishi va gen ekspressiyasining rivojlanishi bilan hujayra holati va chastotasi qanday o'zgarishi haqida nisbatan kam narsa ma'lum. Sichqoncha DN-da glomerulyar hujayra gen ifodasidagi o'zgarishlarni tushuntirish uchun Fu va boshqalar. scRNA-seq tahlilini o'tkazdi va Magi2, Robo2, Ramp3 va Fabp4 kabi glomerulyar hujayralarning bir nechta yangi potentsial belgilarini aniqladi. Diabetik nefropatiyada (DKD) angiogen va migratsiya yo'llarining regulyatsiyasi endotelial hujayralarda o'zgaradi, tilakoid hujayralarida translatsiya va oqsil-barqaror tartibga solish yo'llari yuqori darajada boyitiladi. Umuman olganda, endotelial va tilakoid hujayralarining molekulyar dinamikasidagi o'zgarishlar DN rivojlanishiga hissa qo'shadigan muhim patofizyologik omillarni aniqlashga yordam beradi. Chung va boshqalar. qandli diabetning sichqoncha modelida glomerullarning bir hujayrali transkriptomiyasi tasvirlangan. Ob/ob sichqonlarining tilakoid va podotsitlarida gen ifodasi nazorat bilan solishtirganda o'zgargan. Tilakoid hujayralarida proliferativ yo'llar va podotsitlarda hujayralar sonining nisbati o'zgarishiga mos keladigan hujayra o'limi bilan bog'liq yo'llar paydo bo'ldi. Chop etilgan DKD scRNA-seq ma'lumotlar to'plamining keng qamrovli tahlili 17 ta asosiy genni aniqladi, bu DKD patogenezi ostida yotgan molekulyar mexanizmlar haqidagi tushunchamizni boyitdi. Bundan tashqari, kriyoprezervatsiyalangan inson diabetik buyragi namunalarining xolis yagona yadroli RNK ketma-ketligi (snRNA-seq) uchta nazorat va uchta erta DN namunalaridan 23 980 ta transkriptomni berdi. Natijalar gen ekspresyonidagi hujayra turiga xos o'zgarishlarni ko'rsatdi, bu inson DNsida kaliy sekretsiyasining ko'payishini ko'rsatdi. Katta yoshli sichqonchaning buyraklaridagi scRNA-seq va snRNA-seqni solishtirgan oldingi tadqiqot, ikkinchisining yanada samarali ushlash qobiliyatiga ega ekanligini ko'rsatdi. Masalan, glomerulyar podotsitlar, tilakoid hujayralar va endotelial hujayralar scRNA-seq tomonidan emas, balki snRNA-seq tomonidan ushlangan. SnRNA-seqni qo'llash fermentativ hazm qilishning psevdo-ta'sirini kamaytiradi va muzlatilgan namunalarda amalga oshirilishi mumkin, bu esa turli xil buyrak kasalliklarida patologik mexanizmlarni o'rganishni tezlashtirish uchun kengroq qo'llanilishiga olib keladi.
Aniq hujayrali transkriptom buyrak o'simtasi hujayralarining kelib chiqishini va malign transformatsiyani qo'llab-quvvatlovchi transkripsiya traektoriyalarini aniqlashi mumkin. yosh va boshqalar. 72 501 bitta hujayrali transkriptomlar katalogidan normal va saratonli inson buyrak hujayralari turlarini aniqladi. Buyrak saraton hujayralarining (RCC) o'ziga xos normal hujayrali korrelyatsiyasini aniqlash orqali tadqiqot Wilms o'simta hujayralari aberrant xomilalik hujayralar ekanligi va RCClar proksimal naycha hujayralarining kam ma'lum bo'lgan kichik turidan kelib chiqishi mumkinligi haqidagi gipotezaga dalil berdi. Shunday qilib, scRNA-seq aniq miqdoriy hujayra molekulyar o'lchamlari bilan inson buyrak saratoni hujayralarini tavsiflash uchun kengaytiriladigan eksperimental strategiyani taqdim etadi.
Buyrak kasalliklarida immun hujayralarining molekulyar atlasi
Immun hujayralari inson to'qimalarining asosiy tarkibiy qismi bo'lib, fiziologik va patologik metabolizmda muhim rol o'ynaydi. Darhaqiqat, immunitet tizimining patogen yoki xavfli signallarni yoki malign hujayralarni tan olish qobiliyati juda muhimdir. Buyrak immun hujayralarini o‘rganishda bir hujayrali texnologiyani qo‘llash sog‘lom buyraklar va kasalliklar patogenezida immun tizimining rolini yaxshiroq tushunishga, shuningdek, yangi terapevtik strategiyalarni aniqlashga yordam beradi. Ushbu sa'y-harakatlar buyrak ichidagi murakkab immun landshaftini xaritalash va to'qimalarda yashovchi immunitet hujayralari va ularning o'zaro faollashgan qo'shnilari o'rtasidagi munosabatlarni ochib berishga kirishmoqda.
2018 yilda sichqonchaning buyrak to'qimalarida scRNA-seq qo'llanilishi rezident makrofaglar, neytrofillar, B va T limfotsitlari va NK hujayralarini o'z ichiga olgan keng qamrovli immun hujayra manzarasini ta'minladi. Bir yil o'tgach, inson buyragi immun hujayralarining fazoviy-vaqtinchalik tashkilotining misli ko'rilmagan yagona hujayrali tadqiqoti o'rnatildi. Homila va kattalar buyraklarida to'qimalarda yashovchi miyeloid va limfoid immun hujayra tarmoqlari aniqlandi va tadqiqotlar infektsiyani himoya qilishni rag'batlantiradigan postnatal orttirilgan transkripsiya dasturlarini aniqladi. Bundan tashqari, etuk buyrak epitelial hujayralari va immun hujayralari o'rtasidagi o'zaro suhbat buyrakning eng sezgir hududlariga antibakterial makrofaglar va neytrofillarni jalb qilish uchun taxmin qilingan. Umuman olganda, buyrakning keng qamrovli immun landshafti patogen mexanizmlarni o'rganishga va immun va yuqumli buyrak kasalliklarida terapevtik maqsadlarni aniqlashga yordam beradi.
Lupus nefrit (LN) potentsial o'limga olib keladigan otoimmün kasallik bo'lib, hozirgi terapiya samarasiz va ko'pincha toksikdir. Buyrak shikastlanishiga olib keladigan molekulyar va hujayrali jarayonlar va LN ning heterojenligi noaniq bo'lib qolmoqda. scRNA-seq Arazi va boshqalar tomonidan ishlatilgan. LN bemorlarida miyeloid, T, tabiiy qotil va B hujayralarining 21 ta kasallikka xos subpopulyatsiyasini aniqlash. Xuddi shunday, Der va boshqalar. LN bemorlarining buyrak va teri biopsiya to'qimalariga scRNA-seq qo'llaniladi. Naychali epiteliya hujayralarining I-toifa interferon javob darajasi LN bilan og'rigan bemorlarda sog'lom odamlarga qaraganda yuqoriroq ekanligi xabar qilindi. Bundan tashqari, quvurli hujayralarning yallig'lanish va fibrotik xususiyatlari davolash samarasizligi bilan bog'liq edi. DKDda scRNA-seq tahlili diabetik glomeruliyadagi immun hujayralarining nazorat guruhiga qaraganda ancha yuqori sonini ko'rsatdi. Ushbu tadqiqotlar siydik, teri va buyraklardagi immunitet hujayralarining gen ekspresyon profili yuqori darajada o'zaro bog'liqligini ko'rsatadi, bu siydik va teri biopsiyalari buyrak kasalliklari uchun diagnostika va prognostik belgilarning potentsial manbai bo'lishi mumkinligini ko'rsatadi.
Yaqinda o'tkazilgan tadqiqotlar bitta hujayrali rezolyutsiyaga ega buyrak kasalliklari modellarida immunitet hujayralarining rolini ko'rsatdi. Bir tomonlama ureteral obstruktsiya modellari buyrak interstitsial fibrozi uchun keng qo'llaniladi, bu erda makrofaglar va yallig'lanish hujayralari buyrak interstitiumiga kirib, buyrak gemodinamikasi va metabolizmida sezilarli o'zgarishlarga olib keladi. scRNA-seq fibrozning rivojlanishi va regressiyasi paytida miyeloid hujayra landshaftini ajratish uchun qaytariladigan bir tomonlama ureteral obstruktsiya modellarida ishlatilgan. Conway va boshqalar. Miyeloid hujayralardagi heterojenlikni aniqladi, subpopulyatsiyalarning nisbiy nisbati dinamik o'zgaradi, monotsitlar shikastlanishning boshida to'planadi, Ccr2 plus makrofaglar jarohatning kech davrida to'planadi va Mmp12 plyus makrofaglarning yangi klasteri tiklanish jarayonida rol o'ynaydi. Buyrak kasalliklari va transplantatsiyasida ishemiya-reperfuzion shikastlanish (IRI) yallig'lanish va leykotsitlarni jalb qilish bilan bog'liq. IRI ning eksperimental modellari buyrakdagi tug'ma limfoidga o'xshash hujayralarning 2 guruhining funktsional rolini baholash uchun ishlatilgan va ma'lumotlar shuni ko'rsatadiki, bu hujayralar buyrak shikastlanishida ortiqcha funktsiyalarga ega. Buyrak transplantatsiyasi IRI modeliga scRNA-seqni qo'llash orqali Kremann va boshqalar. keyingi CXCR5 plus leykotsitlar infiltratsiyasi tizimli CXCL13 darajasining oshishiga olib kelganligini aniqladi. knRNA-seq Kirita va boshqalar tomonidan IRI sichqoncha modeliga ham qo'llanilgan. shikastlanishdan keyin batafsil hujayrali javoblarni tavsiflash va yallig'lanishga qarshi va pro-fibrotik proksimal tubula hujayralari holatini aniqlash. Purin metabolizmining yakuniy oksidlanish mahsuloti bo'lgan siydik kislotasi bir nechta kasallik modellarida buyrak yallig'lanishi bilan chambarchas bog'liq. Misol uchun, NLRP3 (NOD-, LRR- va pirin o'z ichiga olgan tuzilmaviy domen 3) siydik kislotasi ortiqcha signallarini sezadi va giperurikemiyali nefropatiyada yallig'lanish pufakchalari faollashadi. Shu bilan birga, giperurikemiya natijasida kelib chiqqan buyrak shikastlanishining o'ziga xos immun mexanizmlari ma'lum emas. Giperurikemiya natijasida kelib chiqqan buyrak shikastlanishi modelida bitta hujayra darajasida yallig'lanishli tana landshaftini qurish yaqin kelajakda amalga oshirilishi kutilmoqda.
Immun infiltratsiyasi buyrak o'smalarida mavjud bo'lib, o'simta mikromuhiti ta'sirida bo'ladi. Oldingi tadqiqot shuni ko'rsatdiki, o'simta infiltratsiya qiluvchi makrofaglar populyatsiyalari qon tomir endotelial o'sish omili A ni ifodalaydi va RCC to'qimalarida VEGF signalizatsiyasining murakkab yo'lida ishtirok etadi. Ushbu tadqiqot shuni ko'rsatadiki, scRNA-seq o'simta hosil bo'lishini hal qilishi va taxminiy patofizyologik mexanizmlar va dori terapiyasi uchun maqsad bo'lishi mumkin bo'lgan uyali signalizatsiya tarmoqlarini aniqlashi mumkin. Umuman olganda, tadqiqot immun tizimi va sog'lom va kasal buyraklarda ishlaydigan uyali tarmoqlar haqida ma'lumot beruvchi scRNAseq-dagi yutuqlarni ta'kidlaydi.
O'simlik tsistanche
Buyrak organoidlariga scRNA-seq qo'llanilishi
Kasal buyrak to'qimalarini o'rganish bilan bir qatorda, buyrak organoidlari organogenez va kasallik mexanizmlarini o'rganish uchun asosiy vositaga aylandi va muqobil to'qimalarning manbai sifatida terapiyaning rivojlanishini tezlashtirish imkoniyatiga ega. Bunga parallel ravishda, scRNA-seqdagi yutuqlar turli xil hujayra subpopulyatsiyalarini va buyraklarga o'xshash organlarda gen ekspressiyasi o'zgarishlarini batafsilroq tahlil qilishga olib keldi.
Umuman olganda, bitta hujayra darajasida buyrak embrionining rivojlanishini yaxshiroq tushunish buyrakka o'xshash organlarning kamolotiga rahbarlik qilish uchun zarur. Inson homila buyragining bir hujayrali transkriptomik tadqiqotlari 22 ta hujayra turini va tegishli marker genlarini aniqladi.
Turli xil rivojlanish bosqichlarini taqqoslash oyoq hujayralarining molekulyar dinamikasining uzluksizligini ko'rsatadi. Yana bir hujayrali tahlil inson homila buyragi va embrion ildiz hujayralaridan olingan buyrakka o'xshash organlarda o'tkazildi. Buyrakdagi bir hujayrali rivojlanish traektoriyalarining qiyosiy tahlili in vivo va in vitroda o'xshash genlarni ifodalash profillarini aniqladi, kechki bosqichdagi podotsitlar bundan mustasno, bu podotsitlarga o'xshash organlarning to'liq kamolotga etish jarayonini ko'rsatadi. Transplantatsiya tajribalari yana shuni ko'rsatadiki, tilakoid va tomir lümeni organoid modellar yordamida optimallashtirilishi mumkin. Buyrak organoidlarini yaratish uchun posterior buyrak mezenximasi va siydik pufagiga o'xshash hujayralardan foydalangan holda o'tkazilgan yaqinda o'tkazilgan tadqiqot scRNA-seq proksimal tubulalarning kamolotini yaxshilaganligini va maqsaddan tashqari hujayralar populyatsiyasini kamaytirishini ko'rsatdi. Subramanian va boshqalar tomonidan inson pluripotent ildiz hujayralari (PSC) dan olingan buyrak organoidlarining scRNA-seq tahlili o'tkazildi. va Wu va boshqalar. Inson homila va kattalar buyragining bir hujayrali ma'lumotlar to'plami bilan solishtirganda, turli xil buyrakka o'xshash organlar asosan ko'paytiriladigan hujayra turlarini ko'rsatdi, ammo maqsaddan tashqari hujayralar mavjudligi sababli turli hujayra nisbatlariga ega. Bundan tashqari, transkripsiya faktorlari tarmog'ini tahlil qilish buyrak organoidlarini farqlash yo'llarini aniqladi, bu organoid differentsiatsiyasini tavsiflash va boshqarishda bitta hujayrali texnologiyaning kuchini ta'kidladi.
Xulosa qilib aytganda, insonning buyragiga o'xshash organlar tog'-kon kasalliklari modellari, potentsial tartibga solish mexanizmlari, yuqori samarali dori skriningi va oxir-oqibat regenerativ terapiya uchun foydali manbadir. Ushbu tadqiqotlar in vivo fiziologik va patologik jarayonlarni yoritish uchun buyrak modeli tizimlarida scRNA-seqning potentsial qo'llanilishini ta'kidlaydi va buyrak kasalliklarini tashxislash va davolashda kelajakdagi tadqiqotlar uchun ko'rsatmalar beradi.
scRNA-seq bo'yicha buyrak allograftlari haqida tushuncha
Allogenik buyrak transplantatsiyasi oxirgi bosqichli buyrak kasalligi uchun eng samarali klinik davolash usullaridan biridir. Yagona hujayrali texnologiya allogenik transplantatsiyadan keyin inson biopsiya namunalari yordamida buyrak hujayralarining turlari va holatini aniq va aniq tavsiflash imkoniyatini beradi. Buyrak transplantatsiyasi biopsiya namunalarining birinchi nashr etilgan hisobotida 8746 ta bitta hujayrali transkriptomlar tahlil qilindi va aniq yallig'lanish reaktsiyalari aniqlandi. Monotsitlar noklassik CD16 plus guruhini va klassik CD16- guruhini tashkil qildi; endotelial hujayralar dam olish holatini va 2 antikor vositachiligini rad etish holatini taqdim etdi. Ushbu topilmalar buyrak transplantatsiyasida immunitetni rad etishni yaxshiroq tushunishimizga yordam beradi. Qabul qiluvchi va donor manbalaridan olingan buyrak monositlarini qiyosiy o'rganishda buyrak biopsiyasi namunalari sezilarli darajada farq qiluvchi transkripsiya gen ifodasini ko'rsatdi. Qabul qiluvchilarda yallig'lanish bilan faollashtirilgan makrofaglar va sitotoksik tarzda ifodalangan T hujayralari kuzatilgan. Xuddi shunday, Liu va boshqalar. surunkali buyrak transplantatsiyasini rad etishdan olingan hujayralarni tahlil qildi va bitta hujayrali darajadagi sog'lom kattalardagi buyraklar bilan mos keladi. Nazoratsiz klasterlash tahlili shuni ko'rsatdiki, surunkali buyrak transplantatsiyasini rad etish guruhida immunitet hujayralari va miofibroblastlar sonining ko'payishi buyrakni rad etish va fibrozga yordam berishi mumkin. Shunisi e'tiborga loyiqki, yaqinda o'tkazilgan tadqiqot kattalar siydigining birinchi bitta hujayrali atlasini tasvirlab berdi va siydikda SOX9 va buyrak ildizi / progenitor hujayra populyatsiyasini aniqladi. Progenitor hujayralar in vivo jonli ravishda muvaffaqiyatli ko'payib, farqlanib, quvurli hujayralarning ba'zi xususiyatlariga ega bo'ldi va kelajakda buyrak transplantatsiyasi terapiyasi uchun potentsial foydali manbani ta'minladi. Umuman olganda, scRNA-seq texnologiyasi inson buyrak transplantatsiyasini rad etish bo'yicha yangi va tushunarli tushunchalarni beradi, natijada diagnostika aniqligini oshiradi va molekulyar biopsiya talqinini qabul qilishni tezlashtiradi.
Cistanche qo'shimchalari
Xulosa
So'nggi o'n yillikda scRNA-seq fiziologik biologiyani o'rganish va kasallikdagi molekulyar tartibga solish anomaliyalarini aniqlash uchun transkriptom keng tarqalgan differentsial gen ekspressiyasini tahlil qilish uchun ajralmas vositaga aylandi. An'anaviy diskret fenotiplardan farqli o'laroq, bitta hujayra darajasida molekulyar xarakteristikalar buyrak kasalliklari fenotiplarini tavsiflash uchun tizimli standartni ta'minlashi mumkin. Sog'lom buyrak to'qimalarida yoki klinik buyrak biopsiyasi namunalarida bitta hujayrali texnologiyani qo'llash buyrakning keng qamrovli molekulyar atlasini beradi va bizning nefrologiya haqidagi tushunchamizni kengaytiradi. Buyrakning yagona hujayrali atlasi inson tanasining keng qamrovli va tizimli ma'lumotnoma xaritasini yaratishga qaratilgan Inson hujayralari atlasining xalqaro ishining ajralmas qismi bo'ladi. Kelgusi tadqiqotlarda bitta hujayrali ultra yuqori o'tkazuvchanlik va fazoviy transkriptom tahlillari buyraklar haqidagi tushunchamizni kengaytirishi kutilmoqda. Multi-omiks ma'lumotlarining integratsiyasi buyrak kasalliklarining shaxsiy diagnostikasi va davolashini yanada yaxshilaydi.
ADABIYOTLAR
1. Kriz W, Bankir L. Buyrak tuzilmalari uchun standart nomenklatura. Xalqaro fiziologiya fanlari ittifoqining buyraklar komissiyasi (IUPS). Buyrak Int. 1988 yil yanvar; 33(1):1–7.
2. Kurts C, Panzer U, Anders HJ, Rees AJ. Immun tizimi va buyrak kasalligi: asosiy tushunchalar va klinik ta'sir. Nat Rev Immunol. 2013 yil oktabr;13(10):738–53.
3. Luyckx VA, Al-Aly Z, Bello AK, Bellorin Font E, Carlini RG, Fabian J va boshqalar. Barqaror rivojlanish maqsadlari buyrak salomatligi bilan bog'liq: taraqqiyot haqida yangilanish. Nat Rev Nefrol. 2021 yil yanvar;17(1):15–32.
4. Klark AR, Greka A. Birining kuchi: buyrakdagi bir hujayrali genomikadagi yutuqlar. Nat Rev Nefrol. 2020-yil fevral;16(2):73–4.
5. Xan X, Vang R, Zhou Y, Fei L, Sun H, Lai S va boshqalar. Sichqoncha hujayrasi atlasini microwell-seq bo'yicha xaritalash. Hujayra. 2018-yil fevral;172(5):1091–107.e17.
6. Park J, Shrestha R, Qiu C, Kondo A, Huang S, Werth M va boshqalar. Sichqoncha buyragining bir hujayrali transkriptomiyasi buyrak kasalligining potentsial hujayrali maqsadlarini ochib beradi. Fan. 2018 yil may; 360(6390):758–63.
7. Hochane M, van den Berg PR, Fan X, Bérenger-Currias N, Adegeest E, Bialecka M va boshqalar. Bir hujayrali transkriptomika inson homila buyragi rivojlanishining gen ifodasi dinamikasini ochib beradi. PLoS Biol. 2019-yil, 17(2): e3000152.
8. Xan X, Zhou Z, Fei L, Sun H, Vang R, Chen Y va boshqalar. Bir hujayra darajasida inson hujayra landshaftini qurish. Tabiat. 2020 yil may; 581(7808):303–9.
9. Liao J, Yu Z, Chen Y, Bao M, Zou C, Chjan H va boshqalar. Inson buyragining bir hujayrali RNK ketma-ketligi. Ilmiy ma'lumotlar. 2020 yil yanvar;7(1):4.
10. Nefrologiyada aniq tibbiyot. Nat Rev Nefrol. 2020 yil noyabr;16(11):615.
11. Chen QL, Li JQ, Xiang ZD, Lang Y, Guo GJ, Liu ZH. Bir hujayrali transkriptom tahlili orqali buyrakda SARS-CoV-2 ning hujayra retseptorlari bilan bog'liq genlarini lokalizatsiya qilish. Buyrak dis. 2020 yil iyul;6(4):258–70.
12. Tietjen I, Rihel JM, Cao Y, Koentges G, Zakhary L, Dulac C. Neyron progenitörlerinin bir hujayrali transkripsiya tahlili. Neyron. 2003 yil aprel;38(2):161–75.
13. Chiang MK, Melton DA. Pankreas rivojlanishining bir hujayrali transkript tahlili. Dev xujayrasi. 2003 yil mart;4(3):383–93.
14. Guo G, Huss M, Tong GQ, Vang C, Li Sun L, Clarke ND va boshqalar. Zigotadan blastotsistgacha bo'lgan yagona hujayrali gen ekspressiyasini tahlil qilish orqali aniqlangan hujayra taqdiri qarorlarini hal qilish. Dev xujayrasi. 2010 yil aprel;18(4):675–85.
15. Guo G, Luc S, Marko E, Lin TW, Peng C, Kerenyi MA va boshqalar. Hujayra yuzasi repertuarini bir hujayrali tahlil qilish orqali hujayra ierarxiyasini xaritalash. Hujayra Ildiz Hujayrasi. 2013 yil oktabr;13(4):492– 505.
16. Vang Z, Gerstein M, Snyder M. RNK-Seq: transkriptomika uchun inqilobiy vosita. Nat Rev Genet. 2009 yil yanvar;10(1):57–63.
17. Tang F, Barbacioru C, Vang Y, Nordman E, Li C, Xu N va boshqalar. Bitta hujayraning mRNK-Seq butun transkriptom tahlili. Nat usullari. 2009 yil may;6(5):377–82.
18. Ramsköld D, Luo S, Vang YC, Li R, Deng Q, Faridani OR va boshqalar. RNKning bir hujayrali darajalari va individual aylanma o'simta hujayralaridan to'liq uzunlikdagi mRNK-seq. Nat Biotexnol. 2012 yil avgust;30(8):777–82.
19. Picelli S, Björklund ÅK, Faridani OR, Sagasser S, Winberg G, Sandberg R. Yagona hujayralardagi sezgir to'liq uzunlikdagi transkriptom profilini yaratish uchun Smart-seq2. Nat usullari. 2013 yil noyabr;10(11): 1096–8.
20. Hagemann-Jensen M, Ziegenhain C, Chen P, Ramsköld D, Hendriks GJ, Larsson AJM va boshqalar. Smart-seq3 yordamida allel va izoform rezolyutsiyasida bitta hujayrali RNKni hisoblash. Nat Biotexnol. 2020 yil iyun;38(6):708–14.
21. Hashimshony T, Vagner F, Sher N, Yanai I. CEL-seq: multiplekslangan chiziqli kuchaytirish orqali bir hujayrali RNK-seq. Hujayra vakili 2012 yil, 2(3): 666–73.
22. Yanai I, Hashimshony T. CEL-seq2-bir hujayrali RNKni multiplekslangan chiziqli kuchaytirish orqali ketma-ketlashtirish. Usullari Mol Biol. 2019; 1979: 45–56.
23. Ko'chalar AM, Chjan X, Cao C, Pang Y, Vu X, Xiong L va boshqalar. Mikrofluidik bir hujayrali butun transkriptoma ketma-ketligi. Proc Natl Acad Sci US A. 2014 yil may;111(19):7048–53.
24. Klein AM, Mazutis L, Akartuna I, Tallapragada N, Veres A, Li V va boshqalar. Embrion ildiz hujayralariga qo'llaniladigan bitta hujayrali transkriptomiya uchun tomchilatib shtrix kodlash. Hujayra. 2015 yil may;161(5): 1187–201.
25. Macosko EZ, Basu A, Satija R, Nemesh J, Shekhar K, Goldman M va boshqalar. Nanolitr tomchilari yordamida alohida hujayralarni genom bo'ylab yuqori darajada parallel ravishda ifodalash. Hujayra. 2015 yil may;161(5):1202–14.
26. Fan HC, Fu GK, Fodor SP. Ifoda profilini yaratish. Gen ifodasi sitometriyasi uchun yagona hujayralarni kombinatsion etiketlash. Fan. 2015 yil fevral; 347 (6222): 1258367.
27. Gierahn TM, Wadsworth MH, Hughes TK, Bryson BD, Butler A, Satija R va boshqalar. Seq-quduq: yuqori o'tkazuvchanlikda bitta hujayraning portativ, arzon RNK ketma-ketligi. Nat usullari. 2017 yil aprel;14(4):395–8.
28. Cao J, Packer JS, Ramani V, Cusanovich DA, Huynh C, Daza R va boshqalar. Ko'p hujayrali organizmning keng qamrovli bir hujayrali transkripsiya profili. Fan. 2017 yil avgust;357(6352): 661–7.
29. Rosenberg AB, Roco CM, Muscat RA, Kuchina A, Sample P, Yao Z va boshqalar. Split-hovuzli shtrix kodlash bilan rivojlanayotgan sichqoncha miyasi va o'murtqa shnurning bir hujayrali profilini yaratish. Fan. 2018 yil aprel;360(6385):176–82.
30. Cao J, Spielmann M, Qiu X, Huang X, Ibrohim DM, Hill AJ va boshqalar. Sutemizuvchilar organogenezining bir hujayrali transkripsiyaviy landshafti. Tabiat. 2019 yil fevral;566(7745):496–502.
31. Cao J, O'Day DR, Pliner HA, Kingsley PD, Deng M, Daza RM va boshqalar. Homila genini ifodalovchi inson hujayra atlasi. Fan. 2020; 370(6518):370.
32. Chen L, Li JW, Chou CL, Nair AV, Battistone MA, Păunescu TG va boshqalar. Bir hujayrali RNK-seq tomonidan aniqlangan sichqonlarda asosiy buyrak yig'uvchi kanal hujayralari turlarining transkriptomlari. Proc Natl Acad Sci US A. 2017 Noyabr;114(46): E9989–98.
33. Ransick A, Lindström NO, Liu J, Zhu Q, Guo JJ, Alvarado GF va boshqalar. Bir hujayrali profillash sichqonchaning buyragida jins, nasl va mintaqaviy xilma-xillikni ochib beradi. Dev xujayrasi. 2019 yil noyabr;51(3):399– 413.e7.
34. Barry DM, McMillan EA, Kunar B, Lis R, Zhang T, Lu T va boshqalar. Buyrakdagi nefron tomirlarining ixtisoslashuvining molekulyar determinantlari. Nat Commun. 2019 yil 10-dekabr (1):5705.
35. Chung JJ, Goldstein L, Chen YJ, Li J, Webster JD, Roose-Girma M va boshqalar. Buyrak glomerulusining bir hujayrali transkriptom profili asosiy hujayra turlarini va shikastlanishga reaktsiyasini aniqlaydi. J Am Soc Nephrol. 2020 yil oktabr;31(10): 2341–54.
36. Kramann R, Machado F, Wu H, Kusaba T, Hoeft K, Schneider RK va boshqalar. Parabioz va bitta hujayrali RNK ketma-ketligi buyrak fibrozida monotsitlarning miofibroblastlarga cheklangan hissasini ko'rsatadi. JCI Insight. 2018 yil may;3(9): e99561.
37. Kuppe C, Ibrohim MM, Kranz J, Chjan X, Ziegler S, Perales-Patón J va boshqalar. Inson buyrak fibrozining miyofibroblast kelib chiqishini dekodlash. Tabiat. 2021 yil yanvar;589(7841):281–6.
38. Vang H, Zheng C, Lu Y, Jiang Q, Yin R, Zhu P va boshqalar. Siydik fibrinogeni CKD rivojlanishining bashoratchisi sifatida. Clin J Am Soc Nephrol. 2017-yil dekabr;12(12):1922–9.
39. Fu J, Akat KM, Sun Z, Zhang V, Schlondorff D, Liu Z va boshqalar. Glomerulyar hujayralarning bir hujayrali RNK profili eksperimental diabetik buyrak kasalligida dinamik o'zgarishlarni ko'rsatadi. J Am Soc Nephrol. 2019 yil aprel;30(4):533–45.
40. Zhang Y, Li V, Zhou Y. Ko'p mikroarray tahlili orqali diabetik buyrak kasalligida markaz genlarini aniqlash. Ann Transl Med. 2020 yil avgust;8(16):997.
41. Wilson PC, Wu H, Kirita Y, Uchimura K, Ledru N, Rennke HG va boshqalar. Insonning erta diabetik nefropatiyasining bir hujayrali transkriptomik manzarasi. Proc Natl Acad Sci US A. 2019-sentabr;116(39):19619–25.
42. Wu H, Kirita Y, Donnelly EL, Humphreys BD. Kattalar buyragining bir hujayrali RNK ketma-ketligidan bitta yadroning afzalliklari: kam uchraydigan hujayra turlari va fibrozda aniqlangan yangi hujayra holatlari. J Am Soc Nephrol. 2019 yil yanvar;30(1):23–32.
43. Yosh MD, Mitchell TJ, Vieira Braga FA, Tran MGB, Styuart BJ, Ferdinand JR va boshqalar. Inson buyragidan olingan bitta hujayrali transkriptomlar buyrak o'smalarining hujayrali kimligini ochib beradi. Fan. 2018 yil avgust;361(6402):594–9.
44. Styuart BJ, Ferdinand JR, Young MD, Mitchell TJ, Loudon KW, Riding AM va boshqalar. Inson buyragining fazoviy-zamon immun zonalanishi. Fan. 2019 yil sentyabr;365(6460):1461–6.
45. Arazi A, Rao DA, Berthier CC, Davidson A, Liu Y, Hoover PJ va boshqalar. Lupus nefritli bemorlarning buyraklaridagi immun hujayra manzarasi. Nat immunol. 2019 yil iyul;20(7):902–14.
46. Der E, Ranabothu S, Suryavanshi H, Akat KM, Clancy R, Morozov P va boshqalar. Lupus nefritida molekulyar heterojenlikni ajratish uchun bitta hujayrali RNK ketma-ketligi. JCI Insight. 2017 yil may;2(9):e93009.
47. Der E, Suryawanshi H, Morozov P, Kustagi M, Goilav B, Ranabothu S va boshqalar. Lupus nefritiga qo'llaniladigan quvurli hujayralar va keratinotsitlar bitta hujayrali transkriptomikasi I tipdagi IFN va fibroz bilan bog'liq yo'llarni aniqlaydi. Nat immunol. 2019 yil iyul; 20(7):915–27.
48. Conway BR, O'Sullivan ED, Cairns C, O'Sullivan J, Simpson DJ, Salzano A va boshqalar. Bir hujayrali buyrak atlasi buyrak kasalligining rivojlanishi va regressiyasida miyeloid heterojenligini aniqlaydi. J Am Soc Nephrol. 2020 yil dekabr; 31(12):2833–54.
49. Cameron GJM, Cautivo KM, Loering S, Jiang SH, Deshpande AV, Foster PS va boshqalar. 2-guruh tug'ma limfoid hujayralari eksperimental buyrak ishemiyasi-reperfuziya shikastlanishida ortiqcha. Old immunol. 2019;10:826.
50. Kreimann K, Jang MS, Rong S, Greite R, von Vietinghoff S, Schmitt R va boshqalar. Ishemiya-reperfuziya shikastlanishi allogenik buyrak transplantatsiyasidan so'ng CXCL13 chiqarilishini va B hujayralarini jalb qilishni boshlaydi. Old immunol. 2020;11:1204.
51. Kirita Y, Vu X, Uchimura K, Wilson PC, Humphreys BD. Sichqonchaning o'tkir buyrak shikastlanishining hujayra profili shikastlanishga saqlanib qolgan hujayra javoblarini ko'rsatadi. Proc Natl Acad Sci US A. 2020 iyul;117(27):15874–83.
52. Wen L, Yang H, Ma L, Fu P. Giperurisemik nefropatiyada NLRP3 yallig'lanish vositachiligidagi signalizatsiya yo'llarining rollari. Mol hujayra biokimyosi. 2021 yil mart;476(3):1377–86.
53. Nishinakamura R. Inson buyragi organoidlari: taraqqiyot va qolgan muammolar. Nat Rev Nefrol. 2019 yil oktabr;15(10):613–24.
54. Tran T, Lindström NO, Ransick A, De Sena Brandine G, Guo Q, Kim AD va boshqalar. Inson podotsitlarining in vivo rivojlanish traektoriyalari pluripotent ildiz hujayralaridan olingan podotsitlarning in vitro differensiatsiyasi haqida ma'lumot beradi. Dev xujayrasi. 2019 yil iyul;50(1):102-e6.
55. Uchimura K, Vu X, Yoshimura Y, Humphreys BD. Odamning pluripotent ildiz hujayralaridan olingan buyrak organoidlari, yaxshilangan yig'ish kanali etukligi va shikastlanish modellari. Hujayra vakili 2020-yil;33(11):108514.
56. Subramanian A, Sidhom EH, Emani M, Vernon K, Sahakian N, Zhou Y va boshqalar. Inson buyragi organoidlarini bir hujayrali ro'yxatga olish transplantatsiyadan so'ng reproduktivlikni va maqsaddan tashqari hujayralarni kamaytirishni ko'rsatadi. Nat Commun. 2019 yil noyabr;10(1):5462.
57. Wu H, Uchimura K, Donnelly EL, Kirita Y, Morris SA, Humphreys BD. Bir hujayrali transkriptomika bilan insonning PSC-de-rived buyrak organoid differentsiatsiyasini qiyosiy tahlil qilish va takomillashtirish. Hujayra Ildiz Hujayrasi. 2018 yil 23-dekabr (6):869–e8.
58. Czerniecki SM, Cruz NM, Harder JL, Menon R, Annis J, Otto EA va boshqalar. Yuqori o'tkazuvchanlik skriningi buyrak organoidlarini inson pluripotent ildiz hujayralaridan farqlashni kuchaytiradi va avtomatlashtirilgan ko'p o'lchovli fenotiplash imkonini beradi. Hujayra Ildiz Hujayrasi. 2018 yil iyun; 22(6): 929-e4.
59. Dvela-Levitt M, Kost-Alimova M, Emani M, Kohnert E, Tompson R, Sidhom EH va boshqalar. Kichik molekula TMED9 ni nishonga oladi va proteinopatiyani qaytarish uchun lizosomal degradatsiyaga yordam beradi. Hujayra. 2019 yil iyul; 178(3):521-e23.
60. Vu H, Malone AF, Donnelly EL, Kirita Y, Uchimura K, Ramakrishnan SM va boshqalar. Inson buyragi allogreft biopsiya namunasining bir hujayrali transkriptomiyasi turli xil yallig'lanish reaktsiyasini belgilaydi. J Am Soc Nephrol. 2018 yil avgust;29(8):2069–80.
61. Malone AF, Vu X, Fronick C, Fulton R, Gaut JP, Humphreys BD. Buyrak transplantatsiyasini rad etishda immun hujayra ximerizmini aniqlash uchun yagona nukleotid o'zgarishi va bitta hujayrali RNK ketma-ketligidan foydalanish. J Am Soc Nephrol. 2020-yil, 31(9):1977–86.
62. Liu Y, Xu J, Liu D, Zhou S, Liao J, Liao G va boshqalar. Yagona hujayrali tahlil surunkali transplantatsiya rad etilgan bemorlarning buyraklarida immun landshaftini ochib beradi. Teranostika. 2020; 10(19):8851–62.
63. Vang Y, Zhao Y, Zhao Z, Li D, Nie H, Sun Y va boshqalar. Bir hujayrali RNK-Seq tahlili inson siydigidan buyrak progenitor hujayralarini aniqladi. Protein hujayra. 2021 yil aprel;12(4):305–12.
64. Stark R, Grzelak M, Hadfield J. RNK ketma-ketligi: o'smirlik yillari. Nat Rev Genet. 2019 yil noyabr;20(11):631–56. 65 Regev A, Teichmann SA, Lander ES, Amit I, Benoist C, Birney E va boshqalar. Inson hujayra atlasi. Elife. 2017;12:6.
Mengmeng Jianga,b; Hayda Chenb, c; Guodzi Guoa, b, c, d, e
a: Liangzhu laboratoriyasi, Zhejiang universiteti tibbiyot markazi, Xanchjou, Xitoy;
b: Ildiz hujayralari va regenerativ tibbiyot markazi, Zhejiang universiteti tibbiyot maktabi, Xanchjou, Xitoy;
c: To'qimalarni muhandislik va regenerativ tibbiyot bo'yicha Zhejiang provintsiyasi kalit laboratoriyasi, doktor Li Dak Sum va Yip Yio Chin, ildiz hujayra va regenerativ tibbiyot markazi, Xanchjou, Xitoy;
d: Suyak iligi transplantatsiyasi markazi, birinchi bog'liq kasalxona, Zhejiang universiteti tibbiyot maktabi, Xanchjou, Xitoy;
e: Gematologiya instituti, Zhejiang universiteti, Xanchjou, Xitoy
