SARS-CoV-2 Variantlari va NL63, HKU1 va 229E NL63, HKU1 va 229E ga qarshi uch xil vaktsina platformasi tomonidan qo'zg'atilgan antikorlarni neytrallash faoliyati tahlili
Oct 26, 2023
Abstrakt: Yaqinda 2019-yilda boshlangan jiddiy oʻtkir respirator sindromli koronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemiyasida avjiga chiqqan koronavirus infeksiyalari oʻzaro neytrallovchi faollikka ega boʻlgan antikor javobini qoʻzgʻatish uchun samarali vaktsinalarning muhimligini taʼkidladi. SARS-CoV-2 infektsiyalari yukini va kasallikning og'irligini kamaytirish uchun COVID-19 vaktsinalari jadallik bilan ishlab chiqildi. Insonning mavsumiy koronavirus (hCoV) infektsiyalaridan o'zaro himoya qilish faraz qilingan, ammo hali ham bahsli. Bu yerda biz BNT162b2, mRNK-1273 yoki AZD1222 ning ikki dozasi bilan emlangan shaxslarning ota-bobolarining SARS-CoV-2 ga qarshi neytrallashtiruvchi faolligini va tarixi bo‘lgan yoki bo‘lmagan holda o‘rganib chiqdik. SARS-CoV-2 infektsiyasi. SARS-CoV-2 va VOClarga qarshi antikorlarni zararsizlantirish faolligi BNT162b2-vaksinatsiya qilingan, ilgari SARS-CoV-2 bilan kasallangan va keng spektrli himoyaga ega bo‘lganlarda yuqoriroq bo‘lgan. Omicron BA.1 varianti VOClar orasida eng chidamlisi edi. COVID{25}} vaksinasi hCoV-HKU1 dan himoya qilmadi. Aksincha, mRNK{28}} emlash natijasida kelib chiqqan antikorlar hCoV-NL63 ga qarshi neytrallash faolligini oshirdi, AZD1222 vaktsinasi esa hCoV-229E ga qarshi antikorlarni neytrallashni kuchaytirdi, bu esa virusning antigenligi va immunogenligida potentsial farqlarni ko'rsatadi. turli xil emlash platformalari o'rtasida ishlatiladigan konstruktsiyalar. Bu maʼlumotlar HCoV va SARS-CoV-2 spike oqsillari oʻrtasida umumiy epitoplar boʻlishi mumkinligini koʻrsatadi.
Kalit so‘zlar: SARS-CoV-2; mavsumiy; HKU1; 229E; NL63; neytrallash
cistanche tubulosa - immunitet tizimini yaxshilaydi
1.Kirish
2019-yil dekabr oyida og‘ir o‘tkir respirator sindromli koronavirus 2 (SARS-CoV-2) deb nomlangan yangi koronavirusning tarqalishi butun dunyo bo‘ylab tez tarqalib, global pandemiyaga olib keldi [1]. O'shandan beri tegishli terapevtik vositani yaratish bo'yicha xalqaro sa'y-harakatlar ko'plab emlash platformalari va boshqa antiviral dori vositalarini ishlab chiqishga olib keldi. Variantlarning bosqichma-bosqich o'sishi SARS-CoV-2 ning oldingi infektsiyasi yoki emlash [2,3] natijasida paydo bo'lgan neytrallashtiruvchi antikorlarning samaradorligiga ta'sir ko'rsatdi. Jahon sog'liqni saqlash tashkiloti (VOZ) tashvishli variantlarni tashvishli variantlar (VOC) deb tasnifladi, bir xil mezonlarga javob bermaydigan boshqa variantlar esa qiziqish variantlari (VOI) yoki tekshirilayotgan variantlar (VUI) toifasiga kiradi. Variantlar va ularning xususiyatlariga, masalan, antikorlardan qochish va replikatsiya tezligiga katta e'tibor qaratildi, ko'plab tadqiqotlar pandemiya rivojlanishda davom etar ekan, variantlar va ularni neytrallash qobiliyatini taqqoslaydi [4-8].
cistanche tubulosa - immunitet tizimini yaxshilaydi
SARS-CoV-2 SARS-CoV-1 [9], Yaqin Sharq respirator virusi (MERS) [10] va toʻrtta inson koronavirusi 229E, HKU-1 oʻz ichiga olgan Coronaviridae oilasiga tegishli. , NL63 va OC43 [11] (1A-rasm). SARS-CoV-1 va MERS odamlarda og'ir kasalliklarga olib keladigan epidemiyalarga ega bo'lgan bo'lsa-da [12], odatda mavsumiy yoki inson koronaviruslari (HCoVs) deb ataladigan boshqa to'rtta koronavirus odatda shamollash kabi engil kasalliklarni keltirib chiqaradi. [11,13]. Ammo kamdan-kam hollarda HCoVlar og'ir kasalliklarga olib kelishi mumkin [14-16]. SARS-CoV-2 NL63 bilan birgalikda hujayraga kirishning asosiy retseptorlari sifatida angiotensin-konvertatsiya qiluvchi ferment 2 (ACE2) dan foydalanadi [17,18]. HKU1 va OC43 SARS-CoV-2 bilan chambarchas bog'liq bo'lishiga qaramay, ular kirish usuli sifatida sialik kislotalar bilan bog'lanadi [19], uzoqroq aloqador 229E esa inson aminopeptidazasidan (hAPN) foydalanadi [20]. (1B-rasm).
1-rasm. Coronaviridae oilasi a'zolarining filogenetik daraxti. * ushbu tadqiqotda ishlatilgan boshoq oqsillarini bildiradi (A). SARS-CoV-2 va uchta mavsumiy HCoV ning boshoq oqsillari tuzilishi; Ushbu tadqiqotda ishlatilgan HKU1, NL63 va 229E (B). (PDB kodlari: 6VXX, 60HW, 6U7H, 5I08 va 5SZS). Kulrang S2 domenini bildiradi, ochiq ko'k esa S1 subbirligining N-terminal domenini, quyuq ko'k esa qolgan S1 subbirligini bildiradi. NL63 boshqa koronaviruslarda kuzatilmagan S1 domenidagi noyob hududni ifodalovchi qo'shimcha ko'k rangli bo'limga ega [21].
Pandemiya boshida HCOV ga qarshi ko'tarilgan antikorlarning SARS-CoV dan himoyalanishda rol o'ynashi mumkinligi haqida munozaralar bor edi-2 [22-25]. O'shandan beri HCoVlarga bo'lgan qiziqish ortib borayotgani ular ishlab chiqaradigan immunitet reaktsiyasini tushunishning ortishiga olib keldi. HCoV larning ta'sirini o'rgangan bir nechta nashrlar antikorlarning bog'lanishini o'lchaydigan ferment bilan bog'langan immunosorbent tahlillari (ELISA) kabi bog'lanish tahlillaridan foydalanishga tayangan, ammo ularning neytrallash qobiliyatini aniqlamagan. Bundan tashqari, turli xil vaktsina platformalarining muvaffaqiyatli ishlab chiqarilishi odamlarni infektsiya va og'ir kasalliklardan himoya qilish uchun ishlatilgan [26], ammo yangi va ko'proq immunitetdan qochish variantlari paydo bo'lishi bilan ularning samaradorligi pasayadi [27]. Bu erda biz BNT162b2 (Pfizer), AZD1222 (Astrazeneca) ning ikki dozasi bilan induktsiya qilingan neytrallashtiruvchi antikorlarning kuchini o'lchash uchun SARS-CoV-2, VOCs/VOI va HCoVlarning lentivirusga asoslangan psevdotipli viruslaridan foydalanamiz. yoki SARS-CoV-2 ga qarshi mRNK-1273 (Moderna) va B.1.1.7 (Alfa), B.1.351 (Beta), P.1 (Gamma), B.1.617.2 (variantlari) Delta), B.1.525 (Eta) va B.1.1.529 (Omicron BA.1) (2-rasm) va bu vaktsinalar HCoV 229E, HKU1 yoki NL63 ga qarshi neytrallashtiruvchi antikorlarni ko'paytirishga qodirmi yoki yo'qmi.
2-rasm. SARS-CoV-2 variantlari ushbu tadqiqotda ishlatilgan spike mutatsiyalari.
2. Materiallar va usullar
2.1. Bemor zardobini yig'ish/axloq haqida ma'lumot
Sarum namunalari 36 ta sog'lom emlangan sub'ektlardan olingan. Tadqiqot San Raffaele ilmiy kasalxonasining axloqiy qo'mitasi tomonidan tasdiqlangan (protokol raqami 68/INT/2020). Barcha ro'yxatga olingan bemorlar yozma ravishda xabardor qilingan rozilik berishdi.
2.2. Filogenetik daraxt va o'xshashlik syujeti
Spike geni kodon moslashuviga asoslangan maksimal ehtimollikdagi filogenetik rekonstruksiya daraxt (1.6.12-versiya) [28] yordamida 10,000 oʻta tezkor yuklash replikatsiyasi [29] va TVM+F+I yordamida qurilgan. +G4 almashtirish modeli, ModelFinder [30] yordamida tanlangan. Ketma-ketlik o'xshashligi syujeti SARS CoV-2 (QHD43416.1), HKU1 (YP_173238.1) 229E (NP_073551.1) va NL63 (NP{20}}.1) spike protein ketma-ketliklarini tekislash orqali tuzilgan. YP_003767.1), mat (7.453-versiya) [31] (gen juftligi varianti) yordamida va kuzatilishi mumkin boʻlgan (https://observablehq.com/@spyros-lytras/seasonal cov) D3 JavaScript paketi yordamida vizuallashtirilgan -spike 2022-yil 3-noyabrda foydalanilgan).
2.3. To'qimalar madaniyati
Inson embrion buyragi 293T/17 (HEK293T/17) hujayralari va inson gepatotsitlari Huh{4}} hujayralari 10% homila sigir zardobi va 1% penitsillin/streptomitsin bilan toʻldirilgan DMEMda saqlangan. Xitoy tuxumdon hamsteri (CHO) hujayralari 10% homila sigir zardobi va 1% penitsillin/streptomitsin bilan to'ldirilgan Ham F12 tarkibida saqlangan. Hujayralar muntazam ravishda fosfat-buferli tuz eritmasi bilan yuvilib, tripsin-EDTA bilan ajratilib, qo'shilishning oldini olish uchun o'tkazildi. Barcha hujayralar 37 ◦C va 5% CO2 da inkubatsiya qilindi.
cistanche o'simlik - immunitet tizimini oshiradi
2.4. Psevdotip virus ishlab chiqarish
Barcha psevdotiplar (PV) ilgari tasvirlanganidek yaratilgan [32]. Qisqacha aytganda, 1000 ng PC-DNK 3.1+ ajdodlaridan qolgan SARS-CoV-2 novdasi boʻlgan plazmid, Alpha, Beta, Delta, Gamma, Eta, Omicron Ba. 1 yoki HCoVs 229E, HKU1 va NL63 OIV Gag-polni kodlovchi 1000 ng p8.91 plazmid va Renilla olovbardoshi lusiferaza reportyor genini o'z ichiga olgan 1500 ng pCSFLW plazmidi bilan aralashtirildi va HEK293T xujayralariga ko-transfektsiya qilingan. FuGENE-HD yordamida T-75 kolbalarda. HKU{21}} transfeksiyadan 24 soat o‘tgach, 10 ml to‘ldirilgan DMEMga 1,5 U ekzogen neyraminidaza (Sigma) qo‘shishning qo‘shimcha bosqichini talab qildi. Psevdotipli viruslarni yig'ish uchun transfeksiya kunidan 48 soat o'tgach media aspiratsiya qilindi va 0,45 mikron tsellyuloza asetat filtri yordamida filtrlandi. Barcha PVlar ajratilgan va saqlash uchun -80 ◦C da saqlangan. Takroriy urinishlardan keyin biz HCoV OC43 psevdotipini aniqlay olmadik.
2.5. Psevdotipli virusni titrlash
Barcha PVlar yuqorida tavsiflanganidek titrlangan [32]. SARS-CoV-2, variantlari va HCoV NL63 uchun maqsadli hujayralar titrlashdan bir kun oldin ACE-2 va TRSSMP2 transfektsiyasi orqali tayyorlangan. CHO hujayralari HKU-1 uchun maqsadli hujayralar sifatida, Huh-7 hujayralari esa 229E uchun maqsadli hujayralar sifatida ishlatilgan. Qisqacha aytganda, 50 µL yig‘ilgan PV oq F-pastki 96-quduq plastinkasining (Nunc) yuqori qatoriga qo‘shildi va HKU-1 uchun DMEM yoki Ham's F-12 yordamida ketma-ket suyultirildi. Har bir quduqqa 10,{15}} maqsadli hujayra qo‘shilishidan oldin, PV’larni yarim qadamda plastinkaning pastki qatoriga qo‘ying. Plitalar Bright-Glo reagenti bilan lizisdan oldin 48 soat davomida inkubatorga qaytarildi va Glo-Max luminometr yordamida nisbiy chiziqli birliklarda (RLU) lusiferaza muxbiri gen faolligini tahlil qildi. PV titrlari RLU/ml da bildirilgan.
cistanche tubulosa - immunitet tizimini yaxshilaydi
Cistanche Enhance Immunity mahsulotlarini ko'rish uchun shu yerni bosing
【Batafsil ma'lumot so'rang】 Email:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692
2.6. Psevdotip mikroneytralizatsiya (pMN) tahlillari
pMN tahlili yuqorida tavsiflanganidek amalga oshirildi. Qisqacha aytganda, tiklanish sarumlari DMEM yoki Xom F-12 bilan dastlabki 1:40 suyultirishda aralashtiriladi va so'ngra oq tekis tubli 96-quduqli plastinkada ketma-ket 2-buklanib, yakuniy holga keltiriladi. suyultirish 1:5120. Barcha namunalar ikki nusxada takrorlandi. Keyin har bir quduqqa 1 × 106 RLU / ml kirishda PV qo'shildi. Plitalar HKU-1 va Huh-7 hujayralari uchun oldindan transfektsiyalangan ACE-2/TRSSMP2 HEK293T maqsadli hujayralar yoki CHO hujayralari qo'shilishidan oldin 1 soat davomida to'qima madaniyati inkubatoriga qaytarildi. 229E, har bir quduqqa 1 × 104 hujayra zichligida. Plitalar Bright-Glo reagenti bilan lizisdan oldin 48 soat davomida inkubatorga qaytarildi va Glo-Max luminometr yordamida nisbiy chiziqli birliklarda (RLU) lusiferaza muxbiri gen faolligini tahlil qildi. IC50lar GraphPad Prism 8 dasturi yordamida [33] da tavsiflangan chiziqli bo'lmagan regressiya egri chizig'idan foydalangan holda hisoblangan.
2.7. Statistik tahlil
Tegishli mavzularning ahamiyatini baholash uchun Wilcoxon tomonidan moslashtirilgan juftlik testlari ishlatilgan. Kruskal-Uollis ANOVA testi uchta vaktsina platformasi o'rtasida IC50 titrlarini solishtirishda muhimlikni baholash uchun ishlatilgan. Barcha testlar GraphPad Prism 8 dasturida ishlatilgan.
3. Natijalar
3.1. Kohort xususiyatlari
SARS-CoV-2ga xos antikorlarining SARS CoV-2 VOC va hCoVlarga qarshi neytrallash potentsialini baholash uchun ikki marta dozalangan BNT162b2-vaktsinasi (n=13) dan olingan sarumlar, AZD1222-vaksinatsiyalangan (n=16) va mRNK-1273-emlangan (n=7) SARS-CoV-2 infeksiyasi boʻlgan va boʻlmagan shaxslar tekshirildi ( 1-jadval).
Jadval 1. Kohortning demografik va klinik xususiyatlari.
3.2. SARS-CoV-2 Variantlarini zararsizlantirish
Biz birinchi navbatda vaktsina turidan qat'i nazar, ota-bobolarimizdan qolgan SARS-CoV-2 ga qarshi neytrallashtiruvchi antikor javoblarining hajmini tahlil qilish uchun pMN tahlillarini o'tkazdik (3A-rasm). Natijalarimiz shuni ko'rsatdiki, Omicron BA.1 eng kam neytrallangan VOC (24-katta kamayishi, p =< 0.0001). As expected, we observed the samples from individuals with prior infection had higher neutralisation titers compared with immunologically naïve subjects. The serum from previously infected individuals (Figure 3B), neutralized the Alpha variant more effectively compared with the ancestral strain, as it showed a 1.3-fold decrease in median IC50 titre, followed by Eta and Delta variants, (3.4- and 4.5-fold decrease, respectively). Beta and Gamma variants were more resistant to neutralization (10.9- and 9.7-fold decrease, respectively), and Omicron BA.1 reached a 16.1-fold decrease compared with ancestral SARS-CoV-2. Notably, the majority of these subjects had received the BNT162b2 vaccine. Taken together, these results suggested that in vaccinated subjects the pre-existing immunity raised by natural infection with SARS-CoV-2, or a VOC is more effective in protecting against the spectrum of variants that emerged later over time, compared with immunity triggered by vaccination only. However, the recently emerged variants evolved mechanisms to evade the neutralizing antibody response.
3-rasm. BNT162b2, AZD1222 yoki mRNK-1273 ning ikki dozasi bilan emlangan shaxslardan olingan SARS-CoV-2 va VOClarni zararsizlantirish uchun sarum antikorlarining qobiliyati. BNT162b2, AZD1222 yoki mRNK-1273 vaktsinalarining ikki dozasini olgan avval yuqtirilgan (koʻk) va yuqmagan shaxslarda (qizil) ota-bobolarining SARS-CoV-2 va variantlariga qarshi neytrallashtiruvchi antikor javobi (A) . Uilkoxon juftliklari imzolangan darajali testlar statistik tahlili ota-bobolarining SARS-CoV-2 ni har bir variant (A) bilan solishtirish uchun ishlatilgan. Oldindan infektsiya tarixi bo'lgan BNT162b2-emlangan shaxslardan olingan sarumlarning neytrallash profillari. Katta o'zgarishlarga ega kichik namuna hajmi tufayli C panelida BNT162b2 uchun statistik test ishlatilmadi. (B). Variantlar (C) ga qarshi uchta vaktsina turlarining neytrallash profillari va vaktsina platformalari o'rtasida taqqoslangan. (D) Uilkoxon juftliklari imzolangan daraja testlari statistik tahlil ajdodlar SARS-CoV-2 ni C panelidagi har bir variant bilan solishtirish uchun ishlatilgan. D panelda statistik tahlil uchun Kruskal-Uollis ANOVA ishlatilgan. ns {{23} } ahamiyatsiz, * p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0,001, **** p Kamroq 0,0001 dan ortiq yoki teng.
Keyin biz emlashdan oldin SARS-CoV-2 infektsiyasini boshdan kechirmagan sub'ektlarni tahlil qildik (3C-rasm). Har bir vaktsina platformasining samaradorligi ajdodlar shtammini va uning variantlarini zararsizlantirish qobiliyatiga qarab tahlil qilindi. Biz BNT162b2-vaksinatsiya qilingan sub'ektlarning sarumlari mRNK-1273- va AZD1222-vaksinatsiyalangan shaxslardan olinganlarga nisbatan yuqori o'rtacha IC50 titrlariga ega ekanligini kuzatdik. Alpha varianti emlangan sub'ektlarning hech birida immunitetdan qochishni ko'rsatmagan bo'lsa-da, barcha VOClar turli darajada antikorlarni zararsizlantirishga chidamli edi (3C-rasm). IC50 titrlarida juda katta tarqalish bilan bir nechta namunalar (n=5) tufayli BNT162b2 namunalaridan mazmunli ahamiyatlilik ballarini chiqara olmadik. Biz uchta vaktsina platformasi o'rtasida Alfa, Eta, Beta, Gamma va BA.1 variantlarini zararsizlantirish qobiliyatlari bo'yicha statistik jihatdan muhim farqni kuzatmadik. Aksincha, uchta vaktsina turi o'rtasidagi eng katta farq ajdodlar va Delta variantlarida kuzatildi, chunki mRNK-1273 mos ravishda IC50 o'rtacha titrlarida 1.6- va 1.{18}}kamayganligini ko'rsatdi. , BNT162b2 bilan solishtirganda, AZD1222 esa 3.8- va 4.1-kamayishni koʻrsatdi (3D-rasm).
3.3. Mavsumiy HCoVlarni zararsizlantirish
SARS-CoV-2 ga qarshi emlash mavsumiy HCoVlardan oʻzaro himoyalanishi mumkinligini aniqlash uchun biz SARS-CoV-2 bilan oldingi infektsiya HCoVlarning antikor vositachiligida zararsizlanishiga taʼsir qilgan yoki yoʻqligini soʻradik (4A-rasm). ). Ilgari SARS-CoV-2 bilan kasallangan va naif shaxslar oʻrtasida 229E yoki HKU{8}} ga nisbatan neytrallash titrlarida statistik jihatdan sezilarli oʻsish kuzatilmadi. Aksincha, SARS-CoV{13}} infektsiyasini boshdan kechirgan emlangan sub'ektlarda (p=0.033) emlangan sub'ektlarda ikkinchi dozadan keyin NL63 ga qarshi neytrallashtiruvchi titrlarning statistik jihatdan sezilarli darajada pasayishi (p {{) aniqlandi. 16}}.063). Keyin biz bir yoki bir nechta vaktsina platformalari oldingi infektsiya holatidan qat'i nazar, barcha sub'ektlarda HCoV ga qarshi titrlarni kuchaytiradimi yoki yo'qligini baholadik (4B-rasm). Umuman olganda, emlangan sub'ektlarda NL63 ga qarshi o'rtacha antikor neytrallash titrlari vaktsina platformasidan qat'i nazar, 229E va HKU1 ga nisbatan yuqori bo'lgan (4B-rasm). Shunisi e'tiborga loyiqki, NL63 SARS-CoV-2 kabi maqsadli hujayralarga kirish retseptorlari sifatida ACE2 dan foydalanadi. Vaktsina turi NL63 va HKU1 bundan mustasno, ikkinchi dozadan keyin biz o'rgangan uchta mavsumiy koronavirusga qarshi neytrallash faoliyatini kuchaytirishga ta'sir ko'rsatmadi. NL63 ga qarshi IC50 titri mRNK yordamida ikkinchi dozadan keyin oshdi-1273 (p=0.03), holbuki 229E faqat AZD1222-vaksinatsiya qilingan shaxslarda IC50 titrining statistik jihatdan sezilarli o'sishini ko'rsatdi (p { {37}}< 0.001). Conversely, after the second boost of the BNT162b2 vaccine, neutralization titers against HCoV HKU-1 decreased, probably due to the selection of antigen-specific plasma cells with lower affinity for the HKU1 spike. To better understand the impact of COVID-19 vaccination on the protection from seasonal HCoVs in subjects with or without a history of SARS-CoV-2 infection, we analysed the spike protein similarity of HCoVs HKU1, NL63, 229E, and SARS-CoV-2 to investigate whether a particular region could explain the neutralization differences (Figure 4C). The similarity plot generated by comparing pairwise similarity showed HKU1 had higher similarity in all spike regions to the SARS-CoV-2 spike compared with 229E and NL63, consistent with the viruses' taxonomy. However, HKU1 seems to have extra insertions at the C-terminal end of the RBD compared with the other two seasonals and SARS-CoV-2. Furthermore, the S2 region shows much higher similarity to SARS-CoV-2 in all three HCoVs compared with the S1 region (Figure 4C).
4-rasm. SARS-CoV ga qarshi birinchi va ikkinchi dozali emlash oʻrtasida NL63, 229E va HKU1 HCoVlarida neytrallashtiruvchi javoblarni solishtirish-2. Ikki marta dozalangan BNT162b2, mRNK-1273 yoki AZD1222 – SARS-CoV-2 infeksiyasi boʻlgan yoki boʻlmagan emlangan shaxslarda HCoVs NL63, 229E va HKU1 ga qarshi neytrallash profili. (A). BNT162b2, mRNK{{20}} yoki AZD1222 vaktsinalarining birinchi va ikkinchi dozalari kiritilgandan so'ng yuqorida aytib o'tilgan HCoVlarga qarshi neytrallashtiruvchi antikor titrlari. (B). Uilkoxonning mos juftliklari imzolangan daraja testlari statistik tahlili A va B da qoʻllanilgan. Oʻxshashlik grafigi (C) HKU-1 koʻtarilishini ikkalasiga nisbatan SARS-CoV-2 ga oʻxshash aminokislotalar ketma-ketligiga ega ekanligini koʻrsatadi. NL63 va 229E boshoq oqsilining barcha hududlarida. Yuqoridagi chiziqli chiziqlar 400 aminokislota oynasi va 1 qadam yordamida chizilgan SARS-CoV-2 va 3 HCoV Spike oqsillari o‘rtasidagi aminokislotalarning juft-juft o‘xshashligini ko‘rsatadi. Bo‘shliqlar bo‘lgan pozitsiyalar derazalardan tashqarida. Pastki qismdagi gorizontal chiziqlar hizalanish uzunligi boʻylab 4 ta tekislangan koronavirusning har biri uchun qoldiq borligini koʻrsatadi (rang mavjudligi=aminokislota mavjudligi; rang yoʻqligi=boʻshliq). ns=ahamiyatsiz, * p < 0,05, *** p < 0,001.
4. Munozara
Ushbu tadqiqotda biz ikkita m-RNKga asoslangan vaktsinalar, BNT162b2 va mRNK-1273 va adenovirusga asoslangan vaktsina AZD1222 tomonidan SARS-CoV{{8} ga qarshi qo'zg'atilgan antikor neytrallash titrlarini bevosita solishtirishga muvaffaq bo'ldik. }, uning paydo bo'lgan variantlari va uchta mavsumiy HCoV. SARS-CoV-2 ga qarshi antikorlarni zararsizlantirish haqidagi maʼlumotlarimiz va uning emlangan subʼyektlardagi variantlari, oldingi infeksiya tarixi boʻlgan yoki boʻlmagan, adabiyotda keltirilgan maʼlumotlarga mos keladi [2,4,5,7,34–38 ]. Ikki dozali vaktsinalar bilan emlash SARS-CoV-2 va VOClarni zararsizlantirishga qodir antikorlarni keltirib chiqarishini tasdiqladik, BNT162b2 eng yuqori neytrallanish titrlarini, undan keyin esa mRNK-1273 va AZD1222. Neytrallash titridagi farqlarga qaramay, har uchala vaktsina ham jiddiy COVIDning oldini olishda yuqori samaradorlikka ega ekanligi xabar qilingan-19 [39–41]. Omicron BA.1 varianti ushbu tadqiqotda tahlil qilingan barcha VOClarning eng qochqin varianti edi (3-rasm). Haqiqatan ham, BA.1 variantining kuchli mutatsiyaga uchragan spike oqsili COVID-19 dan himoyalanish uchun joriy vaktsinalarning samaradorligiga qiyinchiliklar tug‘dirdi va bu va yangi paydo bo‘lgan SARS-CoV-19 dan himoyalanishni kuzatish zarurligini ko‘rsatdi. {31}} variant, yaʼni Omicron BA.4 va BA.5. mRNK asosidagi vaktsinalarning ikki valentli formulalari SARS-CoV-2 va BA.4 va BA.5 avlodlari oʻrtasida umumiy boʻlgan boshoqning mRNKsini oʻz ichiga oladi. asl vaktsina dizayni bilan yuzaga kelgan immunitet reaktsiyasidan qochish.
HCoVlar global miqyosda tarqalgan va qisqa muddatli himoya antikorlarini keltirib chiqarishi mumkin [42]. Shu sababli, seroprevalentlik darajasi yuqori bo'lishiga qaramay, ayniqsa qishki davrlarda [13,43-45] qayta infektsiyaning yuqori darajada saqlanib qolishi ehtimoli yuqori. Mavsumiy HCoV bilan oldingi infektsiya SARS-CoV-2 ga qarshi oʻzaro reaktiv antikorlarni keltirib chiqaradimi yoki yoʻqmi, bundan ham muhimi, bu SARS-CoV-2 dan himoyalanishga olib kelishi hozirda muhokama qilinmoqda. Pandemiyadan oldingi sarum va sog'lom donorlarda o'zaro reaktiv antikorlar [47-54] va T-hujayra javoblari [55-61] aniqlandi; ammo shunga o'xshash eksperimental yondashuvlar boshqa tadqiqotchilar tomonidan buning aksini ko'rsatdi [62]. Bundan tashqari, pandemiyadan oldingi namunalarda o'zaro reaktiv antikorlarni aniqlagan yuqorida aytib o'tilgan ko'plab maqolalarda o'zaro reaktiv namunalar soni tahlil qilingan umumiy sarumning kichik qismini tashkil etdi, bu esa mavjud bo'lsa-da, o'zaro reaktivlik past ekanligini ko'rsatadi. . Xuddi shu savol COVID{25}} vaktsinalari tomonidan paydo bo'lgan antikorlar haqida ko'tarilgan, tadqiqotlar mavsumiy HCoVlarning hammasi emas, balki ba'zilariga o'zaro reaktiv antikorlarni ko'rsatgan [63-65]. SARS-CoV{30}} spike proteiniga qarshi emlash makakalarda alfa va betakoronaviruslarga oʻzaro reaktiv antikorlarni keltirib chiqarishi koʻrsatilgan [66]. O'zaro reaktiv antikorlar SARS-CoV-2 ga qarshi himoya qiluvchi, neytrallashtiruvchi antikorlarga aylanadimi, degan xulosaga kelish muhimdir. Ba'zi ma'lumotlarga ko'ra, SARS-CoV-2 infektsiyasi paytida HCoV ga qarshi antikorlarda ozgina kuchaygan bo'lsa-da, ular himoya bilan bog'liq emas [67]. Xuddi shunday, tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, HCoV bilan oldingi infektsiya SARS-CoV-2 infektsiyasi va kasalligidan himoya qilmagan [68,69].
cistanche tubulosa - immunitet tizimini yaxshilaydi
Biz SARS-CoV-2-vaksinatsiyalangan sub'ektlar kogortamizda, SARS-CoV-2 infektsiyadan oldingi holatidan qat'i nazar, HKU1 ga qarshi neytrallashuvchi antikor titrlarining kuchayganini topmadik. BNT162b2. Bu BNT162b2 [63,64] tomonidan SARS-CoV-2 ga qarshi emlashdan keyin HKU-1 titri oshishi kuzatilgan ikkita hisobotdan farq qiladi [63,64]. Hicks va boshqalar. HCoV-OC43 va HCoVHKU1 ga reaksiyaga kirishuvchi antikorlar SARS-CoV-2 bilan minimal oʻzaro reaktivlikka ega ekanligini koʻrsatdi, bu oqsillarning ketma-ketlik homologiyasiga muvofiq [54]. Bundan tashqari, avvalgi SARS-CoV-2 infektsiyasi HKU1 yoki filogenetik jihatdan ko'proq bog'langan HCoV-229E ga qarshi o'zaro neytrallanishni kuchaytirmagan (4A-rasm). Bir hisobotda HKU1 boshqa nomzod retseptorlari bo'lishi mumkinligini ko'rsatdi, chunki u sialik kislotani bog'laydigan hududlardan uzoqda joylashgan taxminiy RBD mavjudligi sababli hali aniqlanmagan [70,71]. Shuni ham ta'kidlash kerakki, neytrallash qobiliyati nafaqat oqsil tarkibidagi aminokislotalar o'rtasidagi juftlik o'xshashligiga, balki oqsilning strukturaviy tuzilishini o'zgartirishi mumkin bo'lgan qisqa qo'shimchalar va deletsiyalarga ham bog'liq bo'lishi mumkin. Masalan, RBD ning C-terminal oxiridagi HKU-1-maxsus kiritilishi (4C-rasm) neytrallash natijalarini qisman tushuntirishi mumkin. Aksincha, biz oddiy odamlarda ikkinchi dozani qo'llash NL63 ga qarshi himoya antikor javobini xuddi shu dozani olgan ilgari yuqtirgan bemorlarda olinganiga nisbatan oshirganligini aniqladik. Bu, ehtimol, spike antijeniga qo'shimcha ta'sir qilish NL63 ga qarshi antikorlarni zararsizlantirishga ta'sir qilmasligi bilan bog'liq.
HCoVlar o'rtasidagi antikorlarni zararsizlantirishdagi farqlar emlash platformalari tomonidan ishlatiladigan tikanlardagi farqlarga bog'liq bo'lishi mumkin. BNT162b27 oqsilning termoyadroviydan oldingi konformatsiyasini barqarorlashtirish uchun K986P va V987P mutatsiya joylari bilan to'liq uzunlikdagi boshoqni kodlaydi [72]. mRNK-1273 vaktsinasi BNT162b2 vaktsinasida qoʻllanilgan prolin oʻrnini bosish orqali barqarorlashtirilgan spike glikoproteinni kodlash ketma-ketligini oʻz ichiga oladi, transmembran langar va buzilmagan S1-S2 parchalanish joyi. Birlashishdan oldingi konformatsiya markaziy spiralning yuqori qismidagi S2 bo'linmasida joylashgan ketma-ket prolin almashtirishlari bilan barqarorlashadi [73]. Aksincha, mahalliy o'xshash boshoq AZD1222 vaktsinasi bilan ifodalanadi. Bizning sodda sub'ektlarimiz AZD1222 vaktsinasi bilan qo'llanganligi sababli, biz taxmin qilishimiz mumkinki, spike oqsilining mahalliy shakli termoyadroviy stabilizatsiya qilingan oqsil bilan solishtirganda yuqori neytrallashtiruvchi antikor titrlarini rivojlanishiga turtki bo'ldi. Aksincha, SARS-CoV-2 spikeiga ikkinchi immunogen ta'sir qilish, oldindan xabar qilinganidek, NL63 yoki 229E (4B-rasm) ga qarshi neytrallashtiruvchi javobni kuchaytirdi [67], vaktsina platformasiga bog'liq holda, oldingi holatdan qat'i nazar. infektsiya holati. Qizig'i shundaki, boshqa hisobotda bir xil o'zaro neytrallash faolligi kuzatilgan, ammo bu vaktsina platformasidan qat'i nazar [74]. O'zaro reaktivlik NL63 ning SARS-CoV-2 ning retseptorlari bilan bog'lanish motividagi (RBM) epitoplarning o'xshashligi tufayli yuzaga kelishi mumkin, chunki ikkala virus ham kirish retseptorlari sifatida ACE-2 ni taqsimlaydi [75] ]. Xuddi shunday, 229E da S2 termoyadroviy peptidi bilan ustma-ust tushadigan epitop SARS-CoV-2 [48] ga qarshi oʻzaro reaktivlikni keltirib chiqarishi xabar qilingan. Song va boshqalar. S2 subdomenini nishonga olgan himoya neytrallashtiruvchi antikorlar tasvirlangan [53]. Bundan tashqari, asl SARS-CoV-1 epidemiyasi haqidagi hisobotda NL63 va 229E [76] ga qarshi oʻzaro reaktiv antikorlar topildi, bu alfakoronaviruslar va betakoronaviruslar oʻrtasidagi umumiy epitoplar haqidagi gipotezani mustahkamladi. NL63 ning S oqsili furinni aniqlash joyini o'z ichiga olmaydi va biogenez jarayonida parchalanmaydi [77]. Xuddi shunday, mRNA1273 vaktsinasi tomonidan ifodalangan boshoq oqsilida parchalanish joyi yo'q; shuning uchun oqsilning konformatsiyasi o'xshash bo'lishi mumkin va umumiy epitoplarga qarshi neytrallashtiruvchi antikorlarni qo'zg'atishi mumkin va ular bir xil antigen bilan ikkinchi marta ta'sir qilgandan keyin kuchayadi.
Turli xil vaktsinalar bilan ifodalangan boshoq oqsilining antigenik tabiati, ular olishi mumkin bo'lgan bir nechta konformatsiyalar bilan birga, boshoq oqsilidagi bir nechta epitoplarga turli xil yaqinlikdagi neytrallashtiruvchi antikorlarning rivojlanishiga ta'sir qilishi mumkin. AZD-1222 spike oʻz pogʻonasini trimerik sintezdan oldingi tuzilishga barqarorlashtirish uchun ikkita prolin mutatsiyasini oʻz ichiga olmaydi [78,79], termoyadroviydan keyingi pogʻonaning mavjudligi potentsial ravishda epitoplarga nisbatan kattaroq immun reaktsiyasini keltirib chiqarishi mumkin. S2 domenida. Bu nima uchun biz mRNK asosidagi, termoyadroviydan oldin stabillashgan immunogen yoki emlangan namunalarda 229E ga qarshi neytrallash titrlarida hech qanday o'sishni kuzatmaganimizni tushuntirishi mumkin. Oxir oqibat, titrlarda o'sish kuzatilganiga qaramay, bu himoya titrlariga aylanadimi yoki yo'qligini aytishning iloji yo'q, chunki SARS-CoV-2 dan himoyalanish o'zaro bog'liqliklari hali aniqlanmagan. Tadqiqotimizda ko'rib chiqilishi kerak bo'lgan bir nechta cheklovlar mavjud. Bizning maʼlumotlarimiz barcha vaktsinalar platformasidagi koʻproq namunalar va SARS-CoV-2 bilan kasallangan yoki yoʻq emlanmagan shaxslarning nazorat namunalaridan foyda koʻrar edi. Bundan tashqari, biz emlangan sub'ektlar kohortimizda mavsumiy koronaviruslarga qarshi o'zaro reaktiv neytrallashtiruvchi antikorlarning boshlang'ich darajasini tahlil qilmadik. Pan-koronavirus vaktsinasi keng doiradagi koronaviruslarni taniydigan va zararsizlantiradigan antikorlarni keltirib chiqaradi. Tez-tez mutatsiyaga uchragan va immunitetni qo'zg'atadigan bu RNK viruslarining genetik tabiati tufayli bu juda qiyin, bu esa vaqt o'tishi bilan pasayib, qayta infektsiya ehtimolini oshiradi. Shuning uchun, boshoq oqsilining eng saqlanib qolgan hududlarida, ayniqsa S2 subunitida joylashgan asosiy epitoplarni aniqlash, virusning kirib borishiga vositachilik qiluvchi hujayrali retseptorlarga kengroq yaqinlik bilan neytrallashtiruvchi antikorlarni potentsial qo'zg'atish uchun muhimdir. Bir nechta vaktsina nomzodlari ishlab chiqilgan va ba'zilari ikkilamchi antijenlarga asoslangan, shu jumladan spike va nukleokapsid (N) komponentlari [80]. Ushbu formulalar klinikadan oldingi bosqichda, chunki ular koronaviruslarga qarshi kengroq va bardoshli gumoral va hujayrali immunitetni ta'minlashi mumkin [80].
Ma'lumotnomalar
1. Chju, N.; Chjan D.; Vang, V.; Li, X.; Yang, B.; Song, J.; Chjao, X.; Huang, B.; Shi, V.; Lu, R.; va boshqalar. Xitoyda pnevmoniya bilan og'rigan bemorlarning yangi Koronavirusi, 2019. N. Engl. J. Med. 2020, 382, 727–733. [CrossRef] [PubMed]
2. Altmann, DM; Boyton, RJ; Beale, R. SARS-CoVga qarshi immunitet-2 Xavotirlanish variantlari. Fan 2021, 371, 1103–1104. [CrossRef] [PubMed]
3. Burki, T. SARS-CoV variantlarini tushunish-2. Lancet 2021, 397, 462. [CrossRef] [PubMed]
4. Garsiya-Beltran, WF; Lam, EC; Sankt-Denis, K.; Nitido, AD; Garsiya, ZH; Xauzer, BM; Feldman, J.; Pavlovich, MN; Gregori, DJ; Poznanskiy, MC; va boshqalar. Ko'p SARS-CoV-2 Variantlari vaktsinalar bilan bog'liq gumoral immunitet orqali neytrallashdan qochadi. Hujayra 2021, 184, 2372–2383. [CrossRef] [PubMed]
5. Xoffman, M.; Arora, P.; Groß, R.; Zaydel, A.; Hörnich, BF; Han, AS; Krüger, N.; Graichen, L.; Xofman-Vinkler, H.; Kempf, A.; va boshqalar. SARS-CoV-2 Variantlar B.1.351 va P.1 Neytrallashtiruvchi antikorlardan qochish. Hujayra 2021, 184, 2384–2393. [CrossRef]
6. Kantoni, D.; Mayora-Neto, M.; Nadesalingam, A.; Wells, DA; Carnell, GV; Ohlendorf, L.; Ferrari, M.; Palmer, P.; Chan, ACY; Smit, P.; va boshqalar. SARS-CoV ning neytrallash ierarxiyasi-2 Standartlashtirilgan, miqdoriy neytrallash tahlillaridan foydalangan holda tashvishlanish variantlari kasallikning og'irligi bilan bog'liqligini aniqlaydi; Himoya antikorlari chegaralarini ochishga. Old. Immunol. 2022, 13, 773982. [CrossRef]
7. Planas, D.; Bruel, T.; Grzelak, L.; Guivel-Benhassine, F.; Staropoli, I.; Porrot, F.; Planchais, C.; Buchrieser, J.; Raja, MM; Bishop, E.; va boshqalar. Yuqumli SARS-CoV-2 B.1.1.7 va B.1.351 Variantlarining neytrallashtiruvchi antikorlarga sezuvchanligi. Nat. Med. 2021, 27, 917–924. [CrossRef]
8. Lyustig, Y.; Zukerman, N.; Nemet, I.; Atari, N.; Kliker, L.; Regev-Yochay, G.; Sapir, E.; Mor, O.; Alroy-Preis, S.; Mendelson, E.; va boshqalar. Sog'liqni saqlash xodimlarida Comirnaty (BNT162b2, BioNTech/Pfizer) emlashdan keyin Delta (B.1.617.2) va tashvishning boshqa variantlariga qarshi zararsizlantirish qobiliyati, Isroil. Eurosurveillance 2021, 26, 2100557. [CrossRef]
9. Ksiazek, TG; Erdman, D.; Goldsmith, CS; Zaki, SR; Peret, T.; Emeri, S.; Tong, S.; Urbani, C.; Comer, JA; Lim, V.; va boshqalar. Og'ir o'tkir respirator sindrom bilan bog'liq bo'lgan yangi Koronavirus. N. Engl. J. Med. 2003, 348, 1953–1966 yillar. [CrossRef]
10. Zaki, AM; van Boheemen, S.; Bestebroer, TM; Osterhaus, ADME; Fuchier, Saudiya Arabistonida pnevmoniya bilan og'rigan odamdan yangi koronavirusni operativ xotiradan ajratish. N. Engl. J. Med. 2012, 367, 1814–1820. [CrossRef]
11. Liu, DX; Liang, JQ; Fung, TS Inson Koronavirusi-229E, -OC43, -NL63 va -HKU1 (Coronaviridae). Virusologiya ensiklopediyasida, 4-nashr; Bamford, DH, Zukerman, M., Ed.; Akademik matbuot: Oksford, Buyuk Britaniya, 2021; 428–440-betlar. ISBN 978-0-12-814516-6.
12. de Vit, E.; van Doremalen, N.; Falzarano, D.; Munster, VJ SARS va MERS: Rivojlanayotgan Koronaviruslar haqida so'nggi ma'lumotlar. Nat. Rev. Mikrobiol. 2016, 14, 523–534. [CrossRef]
13. Gaunt, ER; Hardi, A.; Claas, ECJ; Simmonds, P.; Templeton, KE Epidemiologiyasi va to'rtta inson koronaviruslari 229E, HKU1, NL63 va OC43ning klinik ko'rinishlari Yangi Multipleks Real-Time PCR usuli yordamida 3 yil davomida aniqlangan. J. Klin. Mikrobiol. 2010, 48, 2940–2947. [CrossRef]
14. Da Veyga, ABG; Martins, LG; Riediger, I.; Mazetto, A.; Debur, MDC; Gregianini, TS oddiy shamollashdan ham ko'proq: Endemik Koronaviruslar OC43, HKU1, NL63 va 229E Sog'lom kattalar orasida og'ir o'tkir respirator infektsiya va o'lim holatlari bilan bog'liq. J. Med. Virol. 2021, 93, 1002–1007. [CrossRef]
15. Arden, KE; Nissen, MD; Sloots, TP; Mackay, IM Yangi inson Koronavirusi, HCoV-NL63, Avstraliyada pastki nafas yo'llarining og'ir kasalligi bilan bog'liq. J. Med. Virol. 2005, 75, 455–462. [CrossRef]
16. Qo'l, J.; Rose, EB; Salinas, A.; Lu, X.; Sakthivel, SK; Shnayder, E.; Watson, JT, uzoq muddatli tibbiy muassasada inson NL63 Koronavirusi bilan bog'liq bo'lgan og'ir respirator kasalliklar epidemiyasi. Emerg. Yuqtirish. Dis. 2018, 24, 1964–1966. [CrossRef]
17. Xoffman, M.; Kleine-Weber, H.; Shreder, S.; Krüger, N.; Herrler, T.; Erichsen, S.; Schiergens, TS; Herrler, G.; Vu, N.-H.; Nitsche, A.; va boshqalar. SARS-CoV-2 hujayraga kirishi ACE2 va TMPRSS2 ga bog'liq va klinik jihatdan isbotlangan proteaz inhibitori tomonidan bloklanadi. Hujayra 2020, 181, 271–280.e8. [CrossRef]
18. Xofman, X.; Pirk, K.; van der Xuk, L.; Geyer, M.; Berkhout, B.; Pöhlmann, S. Inson Koronavirusi NL63 Og'ir o'tkir respirator sindromli Koronavirus retseptorini hujayraga kirish uchun ishlatadi. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 2005, 102, 7988–7993. [CrossRef]
19. Hulsvit, RJG; Lang, Y.; Bakkers, MJG; Li, V.; Li, Z.; Schouten, A.; Ophorst, B.; van Kuppeveld, FJM; Boons, G.-J.; Bosch, B.-J.; va boshqalar. Inson Koronaviruslari OC43 va HKU1 9-O-atsetillangan sialik kislotalar bilan Spike Protein A domenidagi konservalangan retseptorlar bilan bog'lanish joyi orqali bog'lanadi. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 2019, 116, 2681–2690. [CrossRef]
20. Yeager, CL; Ashmun, RA; Uilyams, RK; Cardellichio, CB; Shapiro, LH; Qaramoq; Xolms, KV Inson aminopeptidaza N - bu inson Koronavirusi 229E uchun retseptor. Tabiat 1992, 357, 420–422. [CrossRef]
21. Vu, K.; Li, V.; Peng, G.; Li, F. NL63 respiratorli koronavirus retseptorlari bilan bog'langan domenning kristalli tuzilishi, uning inson retseptorlari bilan murakkab. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 2009, 106, 19970–19974. [CrossRef]
22. Meyerxolz, DK; Perlman, S. Umumiy sovuq Koronavirus infektsiyasi og'ir SARS-CoV-2 kasalligidan himoya qiladimi? J. Klin. Tekshirish. 2021, 131. [CrossRef] [PubMed]
23. Ringlander, J.; Martner, A.; Nilsson, S.; Vestin, J.; Lind, M.; Hellstrand, K. Sovuq Koronaviruslar bilan oldindan tasdiqlangan va aniqlanmagan bemorlarda Kovid-19 bilan kasallanish darajasi va jiddiyligi. J. Yuqtirish. Dis. 2021, 223, 1831–1832 yillar. [CrossRef]
24. Schnierle, BS Ringlander va boshqalarga javob. J. Yuqtirish. Dis. 2021, 223, 1833. [CrossRef] [PubMed]
25. Beretta, A.; Kranaj, M.; Zipeto, D. Oʻzaro reaktiv immunitet COVID-19 immunopatogenezini qoʻzgʻatadimi? Old. Immunol. 2020, 11, 2695. [CrossRef] [PubMed]
26. Creech, CB; Walker, SC; Samuels, RJ SARS-CoV-2 vaktsinalari. JAMA 2021, 325, 1318–1320. [CrossRef]
27. Tao, K.; Tzou, PL; Nouxin, J.; Gupta, RK; de Oliveyra, T.; Kosakovskiy hovuzi, SL; Fera, D.; Shafer, RW Rivojlanayotgan SARS-CoV-2 Variantlarining Biologik va Klinik ahamiyati. Nat. Rev. Genet. 2021, 22, 757–773. [CrossRef]
28. Nguyen, L.-T.; Shmidt, HA; fon Haeseler, A.; Minh, BQ IQ-TREE: Maksimal ehtimollik filogeniyalarini baholash uchun tez va samarali stoxastik algoritm. Mol. Biol. Rivojlanish. 2015, 32, 268–274. [CrossRef]
29. Xoang, DT; Chernomor, O.; fon Haeseler, A.; Minh, BQ; Vinh, LS UFBoot2: Ultrafast Bootstrap yaqinlashuvini yaxshilash. Mol. Biol. Rivojlanish. 2018, 35, 518–522. [CrossRef]
30. Kalyaanamoorti, S.; Minh, BQ; Vong, TKF; fon Haeseler, A.; Jermiin, LS ModelFinder: To'g'ri filogenetik baholash uchun tezkor model tanlash. Nat. Usullar 2017, 14, 587–589. [CrossRef]
31. Katoh, K.; Standley, DM MAFFT Multiple Sequence Alignment Software Version 7: Ishlash va foydalanish imkoniyatlarini yaxshilash. Mol. Biol. Rivojlanish. 2013, 30, 772–780. [CrossRef]
32. Genova, CD; Sampson, A.; Skott, S.; Kantoni, D.; Mayora-Neto, M.; Bentli, E.; Mattiuzzo, G.; Rayt, E.; Derveni, M.; Auld, B.; va boshqalar. Og'ir o'tkir respirator sindromli Koronavirus 2 (SARS-CoV-2) lentiviral psevdotiplarini ishlab chiqarish, titrlash, neytrallash, saqlash va liofilizatsiya qilish. Bio-protokol 2021, 11, e4236. [CrossRef]
33. Ferrara, F.; Temperton, N. Pseudotip neytrallash tahlillari: Laboratoriya dastgohidan ma'lumotlarni tahlil qilishgacha. Metodlar protokoli. 2018, 1, 8. [CrossRef]
34. Liu, C.; Ginn, HM; Dejnirattisai, V.; Supasa, P.; Vang, B.; Tuekpraxon, A.; Nutalay, R.; Chjou, D.; Mentzer, AJ; Chjao, Y.; va boshqalar. SARS-CoV-2 B.1.617 ning vaktsina va rekonvalesent zardob orqali zararsizlanishi kamaygan. Hujayra 2021, 184, 4220–4236.e13. [CrossRef]
35. Shen, X.; Tang, H.; Pajon, R.; Smit, G.; Glenn, GM; Shi, V.; Korber, B.; Montefiori, DC SARS-CoV ni neytrallash-2 Variantlari B.1.429 va B.1.351. N. Engl. J. Med. 2021, 384, 2352–2354. [CrossRef]
36. Shen, X.; Tang, H.; MakDanal, C.; Vag, K.; Fisher, V.; Theiler, J.; Yun, X.; Qopqoq.; Haynes, BF; Sanders, KO; va boshqalar. SARS-CoV-2 Variant B.1.1.7 ajdodlardan qolgan boshoqli vaktsinalar natijasida kelib chiqqan neytrallashtiruvchi antikorlarga sezgir. Cell Host Microbe 2021, 29, 529–539. [CrossRef]
37. Willett, BJ; Grove, J.; MacLean, OA; Wilkie, C.; De Lorenzo, G.; Furnon, V.; Kantoni, D.; Skott, S.; Logan, N.; Ashraf, S.; va boshqalar. SARS-CoV-2 Omicron - bu hujayraga kirish yo'li o'zgargan immunitetdan qochish variantidir. Nat. Mikrobiol. 2022, 7, 1161–1179. [CrossRef]
38. Sirakusano, G.; Rudjiero, A.; Bisoffi, Z.; Piubelli, C.; Carbonare, LD; Valenti, MT; Mayora-Neto, M.; Temperton, N.; Lopalko, L.; Zipeto, D. BNT162b2 bilan emlashdan keyingi 15 xaftada yangi va ilgari yuqtirilgan sub'ektlarda antikor reaktsiyasining turli xil parchalanishi va VOC sezuvchanligi. J. Tarjima. Med. 2022, 20, 22. [CrossRef]
39. Polak, FP; Tomas, SJ; Kitchin, N.; Absalon, J.; Gurtman, A.; Lokhart, S.; Peres, JL; Peres Mark, G.; Moreira, ED; Zerbini, C.; va boshqalar. BNT162b2 MRNA Covid-19 vaktsinasining xavfsizligi va samaradorligi. N. Engl. J. Med. 2020, 383, 2603–2615. [CrossRef]
40. Baden, LR; El Sahli, HM; Essink, B.; Kotloff, K.; Frey, S.; Novak, R.; Diemer, D.; Spector, SA; Rufael, N.; Creech, CB; va boshqalar. MRNA-1273 SARS-CoV-2 vaktsinasining samaradorligi va xavfsizligi. N. Engl. J. Med. 2021, 384, 403–416. [CrossRef]
41. Emari, KRW; Golubchik, T.; Aley, PK; Ariani, CV; Angus, B.; Bibi, S.; Blane, B.; Bonsol, D.; Cicconi, P.; Charlton, S.; va boshqalar. SARS-CoV ga qarshi ChAdOx1 NCoV-19 (AZD1222) vaktsinasining samaradorligi-2 Xavotir varianti 202012/01 (B.1.1.7): Tasodifiy nazorat ostidagi sinovning tadqiqot tahlili. Lancet 2021, 397, 1351–1362. [CrossRef]
42. Edridge, AWD; Kaçzorovska, J.; Xost, ACR; Bakker, M.; Klein, M.; Loens, K.; Jebbink, MF; Matser, A.; Kinsella, CM; Rueda, P.; va boshqalar. Mavsumiy Koronavirusga qarshi himoya immuniteti qisqa muddatli. Nat. Med. 2020, 26, 1691–1693. [CrossRef] [PubMed]
43. Aldridge, RW; Lever, D.; Beale, S.; Jonson, AM; Zambon, M.; Hayward, AC; Fragaszy, EB mavsumiyligi va laboratoriya tomonidan tasdiqlangan mavsumiy koronaviruslarga immuniteti (HCoV-NL63, HCoV-OC43 va HCoV-229E): Grippni kuzatish bo'yicha kohort tadqiqoti natijalari. Wellcome Open Res 2020, 5, 52. [CrossRef] [PubMed]
44. Chjan, S.-F.; Tuo, J.-L.; Huang, X.-B.; Chju, X.; Chjan, D.-M.; Chjou, K.; Yuan, L.; Luo, H.-J.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y.; va boshqalar. Nafas olish yo'llari infektsiyasi belgilari bo'lgan bemorlarda inson koronaviruslarining epidemiologiya xususiyatlari va Guanchjouda 2010-2015 davrida HCoV-OC43 ning filogenetik tahlili. PLoS ONE 2018, 13, e0191789. [CrossRef] [PubMed]
45. Byington, CL; Ampofo, K.; Stokmann, C.; Adler, FR; Herbener, A.; Miller, T.; Sheng, X.; Blashke, AJ; Crisp, R.; Pavia, AT Yuta shtatidagi oilalar orasida respirator viruslarni jamoatchilik nazorati Mikroblarni yaxshiroq aniqlash-bo'ylama virusli epidemiologiya (BIG-LoVE) tadqiqoti. Klin. Yuqtirish. Dis. 2015, 61, 1217–1224. [CrossRef] [PubMed]
46. Wells, DA; Kantoni, D.; Mayora-Neto, M.; Genova, CD; Sampson, A.; Ferrari, M.; Karnell, G.; Nadesalingam, A.; Smit, P.; Chan, A.; va boshqalar. Odamning mavsumiy Koronavirusini zararsizlantirish va COVID-19 jiddiyligi. J. Med. Virol. 2022, 94, 4820–4829. [CrossRef]
47. Shrvani, K.; Sharma, R.; Krishnan, M.; Jons, T.; Mayora-Neto, M.; Kantoni, D.; Temperton, NJ; Dobson, SL; Subramaniam, K.; MakNamara, PS; va boshqalar. Pandemiyadan oldingi va post-COVID-19 davolovchi namunalarda SARS-CoV-2 ga qon zardobidagi oʻzaro faol antikorlar va xotira javobini aniqlash. J. Yuqtirish. Dis. 2021, 224, 1305–1315. [CrossRef]
va boshqalar. Odamlardagi -2 Sars-Kiskagacha bo'lganlar uchun oldindan ish olib borish. [CrossRef]
49. Wudenberg, T. Pella, s .; Anna, f.; Attiya, m; Donnadie, f .; Tru, a. Lohmann, c .; Serafin, h .; Guihenesuf, r; Delilayn, v .; va boshqalar. Sars-Cov--2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 va shimoliy-sharqda kattalardagi mavsumiy tanali immunitet. Ebiomedikin 2021, 70, 103495. [CrossRef]
50. TOO, FY; LIDIBES, SJ; Peña, Pb; Clegg, AA; NGOWI, JR; Mwaiselaj, j; Ngalamika, O. Yulius, p.; G'arbiy, jt; Yog'och, C. O'tkir nafas olish sindromiga nisbatan kuchli seronavirus -2 (SARS-CR &}} Sahroan Afrika shahrida. Int. J. Yuqtirish. Dis. 2021, 102, 577-583. [CrossRef]
51. Linging, Ed; Sterling, SL; Richard, Sa; Fothat, s; Samuels, EA; EPSI, NJ; Yan, L.; Moreno, n .; Kolonlar, v.; Mehalno, j; va boshqalar. Betakoronavirus multipleks mikrosfera immunoassay SARS-CoV-2 ning erta serokonversiyasini aniqlaydi va avvaldan mavjud mavsumiy odamda koronavirus antikorlarining oʻzaro reaktivligini nazorat qiladi. MeRXIV 2020. [CrossRef]
va boshqalar. SARS-CoV-2 antikorlarining epitop bilan hal qilingan profilini aniqlash insonning endemik koronaviruslari bilan oʻzaro reaktivlikni aniqlaydi. 2021, 2, 100189. [CrossRef]
U, V.; Vargas, S.; va boshqalar. Nat. Kommun.
va boshqalar. J. Klin. Immunol. [CrossRef]
55. Grifoni, A.; Vayskopf, D.; Ramires, SI; Mateus, J.; Dan, JM; Moderbacher, CR; Rawlings, SA; Sazerlend, A.; Premkumar, L.; Jadi, RS; va boshqalar. T-hujayralarining SARS-CoV-2 Koronavirusiga COVID-19 kasalligiga chalingan va taʼsir etmagan shaxslarga boʻlgan javob maqsadlari. Hujayra 2020, 181, 1489–1501.e15. [CrossRef]
56. Mateus, J.; Grifoni, A.; Tarke, A.; Sidney, J.; Ramires, SI; Dan, JM; Burger, ZC; Rawlings, SA; Smit, DM; Filips, E.; va boshqalar. Fan 2020, 370, 89–94. [CrossRef]
57. Sekine, T.; Peres-Potti, A.; Rivera-Ballesteros, O.; Strålin, K.; Gorin, J.-B.; Olsson, A.; Llevelin-Leysi, S.; Kamol, H.; Bogdanovich, G.; Muschiol, S.; va boshqalar. Hujayra 2020, 183, 158–168.e14. [CrossRef]
58. Shulyen, I.; Kemming, J.; Oberhardt, V.; Wild, K.; Seidel, LM; Killmer, S.; Sagar; Daul, F.; Salvat Lago, M.; Deker, A.; va boshqalar. Oldindan mavjud va qoʻzgʻatilgan SARS-CoV-2-Maxsus CD8+ T hujayralarining xarakteristikasi. Nat Med 2021, 27, 78–85. [CrossRef]
59. Reynolds, CJ; Swadling, L.; Gibbons, JM; Pade, C.; Jensen, deputat; Diniz, MO; Shmidt, NM; Butler, DK; Amin, OE; Beyli, SNL; va boshqalar. Asemptomatik va engil SARS-CoV-2 infektsiyasida neytrallashtiruvchi antikor va T-hujayralarining nomutanosib javoblari. Sci. Immunol. 2020, 5, eabf3698. [CrossRef]
60. Past, JS; Vaqueirinho, D.; Mele, F.; Foglierini, M.; Jerak, J.; Perotti, M.; Jarrossey, D.; Yovich, S.; Peres, L.; Cacciatore, R.; va boshqalar. SARS-CoV ga CD4 T hujayralarining immunodominantligi va oʻzaro reaktivligining klonal tahlili-2. Fan 2021, 372, 1336–1341. [CrossRef]
61. Echeverria, G.; Gevara, A.; Koloma, J.; Ruiz, AM; Vaskes, MM; Tejera, E.; de Waard, JH Ekvadorda SARS-CoV-2 ga oldindan mavjud T-hujayra immuniteti, COVID-19 Interferon-Gamma-ajralish tahlili bilan aniqlangan. Int. J. Yuqtirish. Dis. 2021, 105, 21–25. [CrossRef]
62. Poston, D.; Vaysblum, Y.; Dono, H.; Templeton, K.; Jenks, S.; Xatziyoannu, T.; Bieniasz, P. Og'ir o'tkir respirator sindromning yo'qligi Koronavirus 2 Yaqinda mavsumiy Koronavirus infektsiyasi bo'lgan shaxslarning pandemiyadan oldingi sarumlarida neytrallash faolligi. Klin. Yuqtirish. Dis. 2020, 73, e1208–e1211. [CrossRef] [PubMed]
63. Amanat, F.; Thapa, M.; Ley, T.; Ahmad, SMS; Adelsberg, Kolumbiya okrugi; Karrenyo, JM; Strohmeier, S.; Shmitz, AJ; Zafar, S.; Chjou, JQ; va boshqalar. SARS-CoV-2 MRNA vaktsinasi NTD, RBD va S2 uchun funktsional jihatdan xilma-xil antikorlarni keltirib chiqaradi. Hujayra 2021, 184, 3936–3948.e10. [CrossRef]
64. Angyal, A.; Longet, S.; Mur, SC; Payne, RP; Xarding, A.; Tipton, T.; Rongkard, P.; Ali, M.; Hering, LM; Meardon, N.; va boshqalar. Ilgari yuqtirilgan va SARS-CoVda birinchi BNT162b2 vaktsina dozasiga T-hujayrasi va antikor javoblari-2-Buyuk Britaniya sogʻliqni saqlash xodimlarining soddaligi: Koʻp markazli istiqbolli kohort tadqiqoti. Lancet Microbe 2022, 3, e21–e31. [CrossRef] [PubMed]
65. Skelli, DT; Harding, AC; Gilbert-Jaramillo, J.; Knight, ML; Longet, S.; Braun, A.; Adel, S.; Adland, E.; Braun, H.; Tipton, T.; va boshqalar. Ikki dozali SARS-CoV-2 vaktsinasi paydo bo'layotgan SARS-CoV-2 xavotirlariga qarshi mustahkam immunitetni keltirib chiqaradi. Nat. Kommun. 2021, 12, 5061. [CrossRef] [PubMed]
66. Grobben, M.; van der Straten, K.; Brouver, PJ; Brinkkemper, M.; Maisonnasse, P.; Dereuddre-Bosquet, N.; Appelman, B.; Lavell, AA; van Vught, LA; Burger, JA; va boshqalar. SARS-CoV-2 infektsiyasi va emlashdan keyin o'zaro reaktiv antikorlar. eLife 2021, 10, e70330. [CrossRef]
67. Anderson, EM; Gudvin, EC; Verma, A.; Arevalo, CP; Bolton, MJ; Weirik, ME; Guma, S.; MakAllister, CM; Kristensen, SR; Weaver, J.; va boshqalar. Mavsumiy odamda koronavirus antikorlari SARS-CoV-2 infektsiyasida ko'payadi, ammo himoya bilan bog'liq emas. Hujayra 2021, 184, 1858–1864.e10. [CrossRef]
68. Sermet-Gaudel, I.; Temmam, S.; Xuon, C.; Behillil, S.; Gajdos, V.; Bigot, T.; Lurier, T.; Kretyen, D.; Backovic, M.; Delaunay Moisan, A.; va boshqalar. Serologiya tomonidan baholangan mavsumiy koronaviruslar bilan oldingi infektsiya bolalarda SARS-CoV-2 infektsiyasi va kasalliklarini oldini olmaydi, Frantsiya, 2020-yil aprel-iyun. Eurosurveillance 2021, 26, 2001782. [CrossRef]
69. Gombar, S.; Bergquist, T.; Pejaver, V.; Hammarlund, NE; Murugesan, K.; Muni, S.; Shoh, N.; Pinskiy, BA; Banaei, N. SARS CoV-2 Infektsiyasi va COVID-19 Avvalgi mavsumiy Koronavirus infektsiyasi bo'lgan shaxslarda jiddiylik. Tashxis qo'ying. Mikrobiol. Yuqtirish. Dis. 2021, 100, 115338. [CrossRef]
70. Qian, Z.; Ou, X.; Góes, LGB; Osborn, C.; Castano, A.; Xolms, KV; Dominges, SR Inson Betakoronavirusi HKU1 ning boshoq glikoproteinining retseptorlari bilan bog'lanish sohasini aniqlash. J. Virol. 2015, 89, 8816–8827. [CrossRef]
71. Ou, X.; Guan, X.; Qin, B.; Mu, Z.; Voydyla, J.A; Vang, M.; Dominges, SR; Qian, Z.; Cui, S. Inson Betakoronavirusi HKU1 ning boshoq glikoproteinining retseptorlarini bog'lovchi domenining kristall tuzilishi. Nat Commun 2017, 8, 15216. [CrossRef]
72. Vogel, AB; Kanevskiy, I.; Che, Y.; Swanson, KA; Muik, A.; Vormehr, M.; Kranz, LM; Valzer, KC; Xayn, S.; Guler, A.; va boshqalar. BNT162b vaktsinalari rezus-makakalarni SARS-CoVdan himoya qiladi-2. Tabiat 2021, 592, 283–289. [CrossRef]
73. Jekson, LA; Anderson, EJ; Rouphael, NG; Roberts, kompyuter; Makene, M.; Koler, RN; McCullough, deputat; Chappell, JD; Denison, MR; Stivens, LJ; va boshqalar. SARS-CoV ga qarshi MRNA vaktsinasi-2 — Dastlabki hisobot. N. Engl. J. Med. 2020, 383, 1920–1931 yillar. [CrossRef]
74. Lorens, J.; Xie, Q.; Zek, F.; Vayl, T.; Zaydel, A.; Krnavek, D.; van der Xuk, L.; Myunx, J.; Myuller, JA; Kirchhoff, F. Og'ir o'tkir respirator sindromli Koronavirus 2 Emlash insonning mavsumiy koronaviruslariga qarshi neytrallashtiruvchi faollikni oshiradi. Klin. Yuqtirish. Dis. 2022, 75, e653–e661. [CrossRef]
75. Simula, ER; Manka, MA; Jasemi, S.; Uzzau, S.; Rubino, S.; Manchia, P.; Bitti, A.; Palermo, M.; Sechi, LA HCoV-NL63 va SARS-CoV-2 CoV-2 pandemiyasidan oldin va davrida toʻplangan odamlarning sarumlaridagi gumoral reaktsiyasi boʻyicha tan olingan epitoplarni baham koʻradi. Mikroorganizmlar 2020, 8, 1993. [CrossRef]
76. Chan, KH; Cheng, VCC; Voo, PCY; Lau, SKP; Poon, LLM; Guan, Y.; Seto, WH; Yuen, KY; Peiris, JSM Og'ir o'tkir respirator sindromli koronavirus infektsiyasi va inson koronaviruslari 229E, OC43 va NL63 bilan o'zaro reaktivligi bo'lgan bemorlarda serologik javoblar. Klin. Vaktsina Immunol. 2005, 12, 1317–1321. [CrossRef]
77. Lin, H.-X.; Feng, Y.; Tu, X.; Chjao, X.; Xsieh, C.-H.; Griffin, L.; Junop, M.; Chjan, C. Retseptorlarni bog'lash va psevdotipli virusga kirishda inson NL63 Koronavirusining boshoq oqsilining tavsifi. Virus Res. 2011, 160, 283–293. [CrossRef]
78. Xaynts, FX; Stiasny, K. Hozirgi COVID{1}} vaktsinalarining ajralib turadigan xususiyatlari: antigen taqdimoti va ta'sir qilish usullari haqida ma'lum va noma'lum. npj Vaktsinalar 2021, 6, 1–13. [CrossRef]
79. Martinez-Flores, D.; Zepeda-Servantes, J.; Kruz-Resendiz, A.; Agirre-Sampieri, S.; Sampieri, A.; Vaca, L. SARS-CoV-2 Spike glikoproteinga asoslangan vaktsinalar va yangi virusli variantlarning oqibatlari. Old. Immunol. 2021, 12. [CrossRef]
80. Dolgin, E. Pan-koronavirusga qarshi vaktsina quvur liniyasi shakllandi. Nat. Rev. Drug Discov. 2022, 21, 324–326. [CrossRef]
